; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC02g0009 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC02g0009
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionprotein MET1, chloroplastic
Genome locationMC02:157413..163737
RNA-Seq ExpressionMC02g0009
SyntenyMC02g0009
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001478 - PDZ domain
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR036034 - PDZ superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022153815.1 protein MET1, chloroplastic [Momordica charantia]2.18e-227100Show/hide
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XP_022958629.1 protein MET1, chloroplastic [Cucurbita moschata]2.63e-17579.65Show/hide
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XP_022996247.1 protein MET1, chloroplastic [Cucurbita maxima]6.20e-17779.54Show/hide
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XP_023532558.1 protein MET1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.21e-17679.25Show/hide
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XP_038902944.1 protein MET1, chloroplastic [Benincasa hispida]5.59e-18083.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWR6 Uncharacterized protein4.46e-17382.01Show/hide
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        MSLAPP      SS  LPK C      SS +  +  S +H H   S    S+S ST H  SL+ S FI+RASD ESK+DT   D+D    QPYEEY+VEL
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        EQPYGLKFAKGRDGGTYIDAIAPGG ADKTGLFTVGDKV+ATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLMKMQKRYGKTDSFGELTEKEIIRAERNSG
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        VVSNKVREIQLQNA RMKEQKARRENDLR+GL+LYKNAKYEEALEKFESVLGSKP PDEASVASYNVACCYSQLNQLKAGLSALEDALEAGFEDFKRVRT
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        DPDLS +RT EEFEPLVKRFDESFINENAINAIKSLFGF
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A0A5D3DEH5 Putative tyrosine phosphatase1.13e-17082.18Show/hide
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        AP    SS+ LPK C    SS +  +  S +H H   S    S+S ST H  SL+ S FI+RASD ESK+DT   D+D    QPYEEY+VELEQPYGLKF
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        AKGRDGGTYIDAIAPGG ADKTGLFTVGD+V+ATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLMKMQKRYGKTDSFGELTEKEIIRAERNSGVVSNKVRE
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A0A6J1DHX0 protein MET1, chloroplastic1.06e-227100Show/hide
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A0A6J1H5N2 protein MET1, chloroplastic1.27e-17579.65Show/hide
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A0A6J1K1D9 protein MET1, chloroplastic3.00e-17779.54Show/hide
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        MSLAPP           + + SSSSQPLPKFCSSF      PKLF SN+HFHL+F++S SS     SL+ S F+VRASD           AD+ ADQPYE
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4J117 Phosphoglucan phosphatase LSF1, chloroplastic1.3e-0428.57Show/hide
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        EY V LE+P G++FA   DG  ++ AI  G +A+K  +  VGD +   S   G  +    ++G T   + ++ G   + +++ +
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Q94BS2 Protein MET1, chloroplastic1.3e-11366.47Show/hide
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        MSLAP + P+L SS     +Q   +  S  T   F S     L+ +S+S    H    R+ A  ++AS+ ES +    G  D + ++ YE Y++E+EQPY
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Query:  GLKFAKGRDGGTYIDAIAPGGSADKTGLFTVGDKVIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLMKMQKRYGKTDSFGELTEKEIIRAERNSGVVSN
        GLKF KGRDGGTYIDAI PGGSADKTG FTVGD+VIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLM+M+KR GK +  GELTEKEIIRAERN+G +S+
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        ++REIQ+QN  + KEQKA+RE DLREGLQ  KN KYEEALE+FESVLGSKP P+EASVASYNVACCYS+LNQ++AGLSALE+AL++G+EDFKR+R+DPDL
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         TLR S++F+PL+K+FDESFINE+AINAIKSLFGFNK
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55480.1 protein containing PDZ domain, a K-box domain, and a TPR region9.1e-11566.47Show/hide
Query:  MSLAPPA-PTLSSS-----SQPLPKFCSSFTPKLFPSNAHFHLTFSSSSSSTPHPRSLRSSAFIVRASDIESKSDTGLGDADADADQPYEEYQVELEQPY
        MSLAP + P+L SS     +Q   +  S  T   F S     L+ +S+S    H    R+ A  ++AS+ ES +    G  D + ++ YE Y++E+EQPY
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Query:  GLKFAKGRDGGTYIDAIAPGGSADKTGLFTVGDKVIATSAVFGTEIWPAAEYGRTMYTIRQRIGPLLMKMQKRYGKTDSFGELTEKEIIRAERNSGVVSN
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AT3G01510.1 like SEX4 19.1e-0628.57Show/hide
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        EY V LE+P G++FA   DG  ++ AI  G +A+K  +  VGD +   S   G  +    ++G T   + ++ G   + +++ +
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AT5G17170.1 rubredoxin family protein5.7e-0840Show/hide
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AT5G17170.2 rubredoxin family protein5.7e-0840Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CACTTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACTCCTCACCCTCGTTCCCTTAGATCCTCAGCTTTCATTGTCAGGGCGTCCGATATAGAATCCAAAAGCGATACTGGACTCGGAG
ATGCCGATGCCGATGCCGATCAACCTTATGAAGAGTACCAAGTGGAACTGGAGCAGCCTTATGGGTTGAAGTTTGCCAAGGGCCGAGACGGCGGAACTTATATCGACGCC
ATTGCACCCGGTGGCTCTGCTGACAAAACTGGATTGTTCACCGTCGGGGATAAAGTTATTGCTACCAGTGCAGTGTTTGGGACAGAAATATGGCCTGCTGCAGAATACGG
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TGCATGCTGTTATTCCCAACTAAATCAGTTGAAAGCTGGGCTATCCGCCCTTGAAGATGCCTTGGAAGCAGGATTCGAAGATTTCAAGAGAGTTCGGACGGATCCTGACC
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AAATAA
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GCCAAAGAAATCCGAAGAAAACAAGTTCCTTCCAAAACCTCCAACTCCAAGGAGCAACTCAGAATGTCTTTAGCTCCACCGGCACCCACCTTGAGCTCCTCTTCCCAGCC
ACTTCCCAAATTTTGCTCTTCCTTCACTCCCAAACTCTTTCCCTCCAACGCTCACTTTCATCTCACTTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACTCCTCACCCTCGTTCCCTTA
GATCCTCAGCTTTCATTGTCAGGGCGTCCGATATAGAATCCAAAAGCGATACTGGACTCGGAGATGCCGATGCCGATGCCGATCAACCTTATGAAGAGTACCAAGTGGAA
CTGGAGCAGCCTTATGGGTTGAAGTTTGCCAAGGGCCGAGACGGCGGAACTTATATCGACGCCATTGCACCCGGTGGCTCTGCTGACAAAACTGGATTGTTCACCGTCGG
GGATAAAGTTATTGCTACCAGTGCAGTGTTTGGGACAGAAATATGGCCTGCTGCAGAATACGGAAGGACAATGTATACAATTCGGCAAAGAATTGGTCCATTACTCATGA
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CCCTTGAAGATGCCTTGGAAGCAGGATTCGAAGATTTCAAGAGAGTTCGGACGGATCCTGACCTATCAACCTTGAGGACATCGGAGGAATTTGAGCCTCTTGTGAAAAGG
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AATTCGTGTGTCAAGTATTCAAAAAGCTTCTTTGTATCGTTCCAATTTTATTAGATGTCCCTGAAGAGACAAGTATTCAAAAAGCTTCTGGCTTTGGCTTTTAGATGGGT
AACATAAGAATTTCAATGTAATTCGTTCTCAAAATCTTTATTTGTGCGTTCTGTTAACGATATGCACAATGAAAAACTGTTGCAAGAAAGCTGTTTGTGTCTAATTAGTC
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TTGCCGAGCAAGATCGCACAATCCTCCAAAAGCAAAGCTCCATGACAAATCTTGCTATATTTAGACTTCCAATGCAACGTCATGAATTCAATCCAACAATTAAAAATAAG
TAAATTCTGACTAGGTTACATGCAATAAGTTCCAGAAAGATATTGTCAATCAGATGTAGCAGTCCTCGTTGAAGTCCAATTCGTCCACCCCCAATCATCTAGAGCTTTTA
AATAACAAGAATTTATTCCTACATCAGTTCTGTTATTTCTAATCTCAATTCAATCCATGCTTAACGCCCTTGTCATAACGATACATTAAAGAACCTAAAGGGAAATTTTA
CAACAATAAATAACTAATAGAACTGGACGGCAGGCCTCAAGTAGCACAGCCAGATGCATAAACTTGAAAGGCCTTTTAATAACTGCTCCTGCTAGCCAACAAAACTTGGA
ATTTAGGTACAGACATTGAGACTCTCCCAGGCCACTTGTCCTGACATTACTGCTGAATTTTAAGCACTGGAAAAGCAATTACATCTCGAATGCTTGCAGAATTTGTCAGA
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ATATGTTCCATATTTCTCTATACCAACCACTATTTGAGTGTTTAATGTTTACCTCAAGAAAGATATACCTTTTCATAGTATTATGTGAATATAAAATTATCATAGTATAA
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TAAATTCCAATAATCCCCTAGATTTTGGTAATGTGACATTTTTTTCATATATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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K