; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC02g0274 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC02g0274
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptiontranscription factor TCP15-like
Genome locationMC02:2484298..2484831
RNA-Seq ExpressionMC02g0274
SyntenyMC02g0274
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005333 - Transcription factor, TCP
IPR017887 - Transcription factor TCP subgroup


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004145813.1 transcription factor TCP7 [Cucumis sativus]2.64e-8378.49Show/hide
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XP_008465370.1 PREDICTED: transcription factor TCP7 [Cucumis melo]3.23e-8479.26Show/hide
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        SA L+L  C+    PSSSN+ S TTS F++ET   NNY FP  N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ+  DG D
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XP_022140679.1 transcription factor TCP15-like [Momordica charantia]9.93e-119100Show/hide
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XP_022996075.1 transcription factor TCP14-like [Cucurbita maxima]2.65e-7874.44Show/hide
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        SAA  L  C P+  SS+ + TT+    + NNY FP  +  +PLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN E++   D
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XP_038900506.1 transcription factor TCP16-like [Benincasa hispida]4.49e-8679.35Show/hide
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        SA L+L  C P    SSSNLS TT+ F++  + NNY FPM N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI  LQEVAEN E++   D
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDC7 TCP domain-containing protein1.28e-8378.49Show/hide
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        MGSK+MRVK+ TS+SPRNAPK NS  P ASESK +PSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IA
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        SA L+L  C+    PSSSN  S TTS F++ET   NNY FPM N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ+   D
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A0A1S3CNQ2 transcription factor TCP71.56e-8479.26Show/hide
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        SA L+L  C+    PSSSN+ S TTS F++ET   NNY FP  N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ+  DG D
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A0A5A7T0X8 Transcription factor TCP71.56e-8479.26Show/hide
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A0A6J1CGC4 transcription factor TCP15-like4.81e-119100Show/hide
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A0A6J1K5P6 transcription factor TCP14-like1.28e-7874.44Show/hide
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        MGSKNMRVKKATS+SPR  P       NASESKP+PSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIA
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        SAA  L  C P+  SS+ + TT+    + NNY FP  +  +PLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN E++   D
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q93Z00 Transcription factor TCP142.2e-1958.24Show/hide
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        A++  PL   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG     A  N  + N S  SS  S
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Q9C518 Transcription factor TCP87.1e-1845.16Show/hide
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        G     V  + S  PR+ P  +S   + +++ +     ++ KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP+I+A TG   
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Query:  ASAALNLAACNPSPSSSNLSATTS
          A  +  + +   S S LSA  S
Subjt:  ASAALNLAACNPSPSSSNLSATTS

Q9C9L2 Transcription factor TCP152.0e-2047.66Show/hide
Query:  TSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSK-APKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN
        +SSS   A  S ++ PN+   KP P + + KDRH KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG     A  N  + N
Subjt:  TSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSK-APKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN

Query:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN
         S  SS  S + +  +   ++Y F  P+
Subjt:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN

Q9FTA2 Transcription factor TCP211.4e-1857.14Show/hide
Query:  SNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPS
        SN    NA +  P      KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+ + A+ + S
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Q9LSD5 Transcription factor TCP205.4e-1854Show/hide
Query:  NSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDI--ASAALNLAACNPSPSSSNLSA
        N  S N ++  P  S + KDRH KV GR RRIR+P LCAAR+FQLTRELG+K+DG+T++WLL++AEPSIIA TG     ASA  + AA +      +L+A
Subjt:  NSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDI--ASAALNLAACNPSPSSSNLSA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G58100.1 TCP family transcription factor5.0e-1945.16Show/hide
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        G     V  + S  PR+ P  +S   + +++ +     ++ KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP+I+A TG   
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Query:  ASAALNLAACNPSPSSSNLSATTS
          A  +  + +   S S LSA  S
Subjt:  ASAALNLAACNPSPSSSNLSATTS

AT1G69690.1 TCP family transcription factor1.4e-2147.66Show/hide
Query:  TSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSK-APKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN
        +SSS   A  S ++ PN+   KP P + + KDRH KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG     A  N  + N
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Query:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN
         S  SS  S + +  +   ++Y F  P+
Subjt:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN

AT3G27010.1 TEOSINTE BRANCHED 1, cycloidea, PCF (TCP)-domain family protein 203.9e-1954Show/hide
Query:  NSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDI--ASAALNLAACNPSPSSSNLSA
        N  S N ++  P  S + KDRH KV GR RRIR+P LCAAR+FQLTRELG+K+DG+T++WLL++AEPSIIA TG     ASA  + AA +      +L+A
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AT3G47620.1 TEOSINTE BRANCHED, cycloidea and PCF (TCP) 141.6e-2058.24Show/hide
Query:  ASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPSPSSSNLS
        A++  PL   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG     A  N  + N S  SS  S
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AT5G08330.1 TCP family transcription factor1.0e-1957.14Show/hide
Query:  SNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPS
        SN    NA +  P      KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+ + A+ + S
Subjt:  SNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATCAAAAAACATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAGCTCTCCAAGAAATGCACCAAAATCCAATTCCAATTCACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCCTGCCTTC
CAAAGCTCCGAAAGATCGCCACGCTAAGGTTCACGGGCGTGATCGTCGTATCCGCCTTCCACCGTTGTGTGCAGCTCGAGTGTTTCAGCTCACTCGAGAGCTCGGAAACA
AAACGGATGGTCAGACTGTGGAGTGGCTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCCATTATTGCTATAACTGGTAAAGATATTGCCTCTGCTGCTCTAAACTTGGCTGCCTGCAAC
CCCTCTCCATCTTCATCAAACCTTTCTGCTACTACAAGTTGTTTTCAACAAGAAACTAACAACTACACGTTCCCAATGCCTAACATACCTTTGCCAAATTATGAATTCGA
TTTGGTCTCCGATTTTGATATGGAGCTTTTTGCTCATCATATCACCACGCTGCAAGAAGTGGCAGAAAATTTGGAGCAGGACGACGGCCAAGAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGATCAAAAAACATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAGCTCTCCAAGAAATGCACCAAAATCCAATTCCAATTCACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCCTGCCTTC
CAAAGCTCCGAAAGATCGCCACGCTAAGGTTCACGGGCGTGATCGTCGTATCCGCCTTCCACCGTTGTGTGCAGCTCGAGTGTTTCAGCTCACTCGAGAGCTCGGAAACA
AAACGGATGGTCAGACTGTGGAGTGGCTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCCATTATTGCTATAACTGGTAAAGATATTGCCTCTGCTGCTCTAAACTTGGCTGCCTGCAAC
CCCTCTCCATCTTCATCAAACCTTTCTGCTACTACAAGTTGTTTTCAACAAGAAACTAACAACTACACGTTCCCAATGCCTAACATACCTTTGCCAAATTATGAATTCGA
TTTGGTCTCCGATTTTGATATGGAGCTTTTTGCTCATCATATCACCACGCTGCAAGAAGTGGCAGAAAATTTGGAGCAGGACGACGGCCAAGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSKNMRVKKATSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN
PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPNIPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHITTLQEVAENLEQDDGQD