CuGenDBv2

Gene ID	MC02g0351
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	Rhomboid domain-containing protein
Genome location	MC02:3093777..3094218
RNA-Seq Expression	MC02g0351
Synteny	MC02g0351
Gene Ontology terms	GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022145106.1 RHOMBOID-like protein 13 [Momordica charantia]

1.79e-21

60.19

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK +GYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        V+L GVLV
Subjt:  VILFGVLV

XP_022954125.1 RHOMBOID-like protein 13 [Cucurbita moschata]

1.27e-21

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL G+LV
Subjt:  VILFGVLV

XP_022992351.1 RHOMBOID-like protein 13 isoform X1 [Cucurbita maxima]

1.59e-21

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL G+LV
Subjt:  VILFGVLV

XP_022992352.1 RHOMBOID-like protein 13 isoform X2 [Cucurbita maxima]

1.27e-21

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL G+LV
Subjt:  VILFGVLV

XP_023520865.1 RHOMBOID-like protein 13 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.59e-21

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL G+LV
Subjt:  VILFGVLV

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A5A7TFB1 RHOMBOID-like protein 13

2.39e-21

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL       +E+L          IGL   G+ YYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL GVLV
Subjt:  VILFGVLV

A0A6J1CVD1 RHOMBOID-like protein 13

8.64e-22

60.19

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK +GYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        V+L GVLV
Subjt:  VILFGVLV

A0A6J1GQ61 RHOMBOID-like protein 13

6.16e-22

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL G+LV
Subjt:  VILFGVLV

A0A6J1JPK2 RHOMBOID-like protein 13 isoform X2

6.16e-22

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL G+LV
Subjt:  VILFGVLV

A0A6J1JTB3 RHOMBOID-like protein 13 isoform X1

7.71e-22

61.11

Show/hide

Query:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL
        GIIGI CAIWFYIQKK IGYSHVGL  +       W IITSAF   SVIHLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G+AYYLHYTLVL
Subjt:  GIIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVL

Query:  VILFGVLV
        VIL G+LV
Subjt:  VILFGVLV

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9M1B5 RHOMBOID-like protein 13

3.3e-12

50.47

Show/hide

Query:  IIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVLV
        I+ +   IWF IQKK IGYS VGL  +       W +ITSA    SV+HLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G AYYLHYTLVLV
Subjt:  IIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVLV

Query:  ILFGVLV
        +  GVLV
Subjt:  ILFGVLV

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G59520.1 RHOMBOID-like protein 13

2.4e-13

50.47

Show/hide

Query:  IIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVLV
        I+ +   IWF IQKK IGYS VGL  +       W +ITSA    SV+HLV NMSALWSL V     +E+L          +GL   G AYYLHYTLVLV
Subjt:  IIGIFCAIWFYIQKK-IGYSHVGLYMKLP-----WSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVLV

Query:  ILFGVLV
        +  GVLV
Subjt:  ILFGVLV

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

GGGATTATAGGGATTTTCTGTGCTATATGGTTTTACATCCAGAAGAAAATTGGATACTCACATGTGGGGTTGTATATGAAACTGCCATGGAGCATAATAACTTCGGCCTT
TTACCGTACAAGTGTTATTCATCTGGTTCTCAACATGAGTGCTCTTTGGAGTCTTTGGGTTTTTGGTATTAAACACATCGAAAAGTTGGAACTTCAGATCTCTAAGCCTC
CCTTACCAATTGGGCTGCCCCTTGGGGGCATTGCATATTATCTCCACTACACTCTTGTACTGGTCATACTATTTGGAGTGCTAGTA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

GIIGIFCAIWFYIQKKIGYSHVGLYMKLPWSIITSAFYRTSVIHLVLNMSALWSLWVFGIKHIEKLELQISKPPLPIGLPLGGIAYYLHYTLVLVILFGVLV

MC02g0351 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome