; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC02g0745 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC02g0745
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog A2B
Genome locationMC02:5949610..5951411
RNA-Seq ExpressionMC02g0745
SyntenyMC02g0745
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022148474.1 ras-related protein Rab11C [Momordica charantia]1.92e-144100Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCST
        DSNKRGCCST
Subjt:  DSNKRGCCST

XP_022946941.1 ras-related protein Rab11C [Cucurbita moschata]9.82e-13895.22Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQE+AASV HPGQGTTINV++ SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

XP_023007279.1 ras-related protein Rab11C [Cucurbita maxima]1.98e-13795.22Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAF TILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTTINV++ SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

XP_023532299.1 ras-related protein Rab11C [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.42e-13895.69Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTTINV++ SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

XP_038901318.1 ras-related protein Rab11C [Benincasa hispida]1.39e-13795.22Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF+NVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDL+HLRSVSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTTINVSD SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE61 Uncharacterized protein5.55e-13794.26Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF+NVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDL+HLRSVSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+ HPGQGTTINVSD SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

A0A5A7V7L9 Ras-related protein Rab2BV5.55e-13794.26Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF+NVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDL+HLRSVSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+ HPGQGTTINVSD SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

A0A6J1D439 ras-related protein Rab11C9.31e-145100Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCST
        DSNKRGCCST
Subjt:  DSNKRGCCST

A0A6J1G4Z7 ras-related protein Rab11C4.75e-13895.22Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQE+AASV HPGQGTTINV++ SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

A0A6J1L4I1 ras-related protein Rab11C9.59e-13895.22Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAF TILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTTINV++ SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
        DSN+RGCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39434 Ras-related protein Rab2BV1.6e-9887.62Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVI+M GNKSDL HLR+VSE+DGQA+AEKEGLSF+ETSAL+A NIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEA++++  PGQGTTINV+DAS 
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCST
         + +R CCST
Subjt:  DSNKRGCCST

Q40193 Ras-related protein Rab11C3.5e-10188.57Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TFDNVQRWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLR+VSEDDG A++EKEGLSF+ETSAL+ATNIEKAFQTILTEIYHI+SKKALAAQEA A    PGQGTTINV+D SG
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCST
        ++ K+GCCST
Subjt:  DSNKRGCCST

Q96283 Ras-related protein RABA2c5.3e-9786.26Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRT +VEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TFDNV RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS
        RELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLRSV+E+DGQ++AEKEGLSF+ETSAL+ATN+EKAFQTIL EIYHIISKKALAAQE AAA+   PGQGTTINV D S
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS

Query:  GDSNKRGCCST
        G + KR CCS+
Subjt:  GDSNKRGCCST

Q9FIF9 Ras-related protein RABA2d4.1e-9785.78Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TFDNV RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS
        RELRDHADSNIVI+M GNK+DLNHLRSV+E+DGQ +AE EGLSF+ETSAL+ATN+EKAFQT+L EIYHIISKKALAAQE AAA+   PGQGTTINV D S
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS

Query:  GDSNKRGCCST
        G + KRGCCST
Subjt:  GDSNKRGCCST

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b1.8e-9785.71Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF+NV RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLRSV+++DG+++AEKEGLSF+ETSAL+ATNIEKAFQTIL+EIYHIISKKALAAQEAA ++  PGQGT IN+SD+S 
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCST
         +N++GCCST
Subjt:  DSNKRGCCST

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B1.3e-9885.71Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF+NV RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLRSV+++DG+++AEKEGLSF+ETSAL+ATNIEKAFQTIL+EIYHIISKKALAAQEAA ++  PGQGT IN+SD+S 
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCST
         +N++GCCST
Subjt:  DSNKRGCCST

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C1.1e-8472.86Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF+NV RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        +ELRDHADSNIVI+++GNK+DL HLR+V+ +D Q+ AEKEGLSFIETSAL+A N+EKAFQTIL+E+Y IISKK++++ +  A+  +  +G TI+V+  S 
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCST
         + K+ CCS+
Subjt:  DSNKRGCCST

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C3.8e-9886.26Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRT +VEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TFDNV RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS
        RELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLRSV+E+DGQ++AEKEGLSF+ETSAL+ATN+EKAFQTIL EIYHIISKKALAAQE AAA+   PGQGTTINV D S
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS

Query:  GDSNKRGCCST
        G + KR CCS+
Subjt:  GDSNKRGCCST

AT4G18800.1 RAB GTPase homolog A1D1.8e-7666.51Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEF LESKSTIGVEF+TR+L V  K +KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+T+  TF+NV+RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG
        RELRDH D NIV+++VGNKSDL HL +V  +D ++ AE E L F+ETSAL++TN+E AF  +LT+IYH++SKKA+ A E + +V   G+   ++VS    
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASG

Query:  DSNKRGCCS
           K GCCS
Subjt:  DSNKRGCCS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D2.9e-9885.78Show/hide
Query:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL
        +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TFDNV RWL
Subjt:  EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWL

Query:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS
        RELRDHADSNIVI+M GNK+DLNHLRSV+E+DGQ +AE EGLSF+ETSAL+ATN+EKAFQT+L EIYHIISKKALAAQE AAA+   PGQGTTINV D S
Subjt:  RELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTTINVSDAS

Query:  GDSNKRGCCST
        G + KRGCCST
Subjt:  GDSNKRGCCST


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAGTACGACTATTTGTTCAAGATTGTCCTGATCGGGGATTCCGGCGTCGGCAAGTCCAACATTCTTTCTAGATTTACCAGAAATGAGTTCTGCTTGGAGTCCAAATCCAC
CATTGGCGTTGAGTTCTCTACCAGGACTCTCGAGGTAGAAGGAAAGACAGTAAAGGCACAGATCTGGGACACAGCAGGTCAGGAGCGATACCGTGCGATTACTAGTGCTT
ATTATAGGGGAGCTGTTGGTGCTCTTCTTGTTTATGATCTCACGAAGAGACCGACTTTCGACAACGTGCAAAGGTGGCTCCGGGAACTGAGAGATCATGCAGATTCCAAC
ATTGTGATTGTGATGGTTGGAAACAAGTCTGACCTAAATCATCTTAGATCGGTCTCGGAGGATGATGGGCAGGCCATGGCTGAGAAGGAAGGCCTATCATTTATCGAGAC
GTCAGCCCTGGATGCTACTAATATCGAGAAGGCGTTCCAAACCATCTTGACAGAGATCTACCACATCATCAGCAAAAAGGCATTGGCTGCCCAGGAGGCAGCTGCGAGCG
TGGGCCATCCCGGTCAGGGAACCACCATCAACGTTTCGGATGCTTCTGGGGACTCGAACAAAAGAGGTTGCTGTTCTACT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGTACGACTATTTGTTCAAGATTGTCCTGATCGGGGATTCCGGCGTCGGCAAGTCCAACATTCTTTCTAGATTTACCAGAAATGAGTTCTGCTTGGAGTCCAAATCCAC
CATTGGCGTTGAGTTCTCTACCAGGACTCTCGAGGTAGAAGGAAAGACAGTAAAGGCACAGATCTGGGACACAGCAGGTCAGGAGCGATACCGTGCGATTACTAGTGCTT
ATTATAGGGGAGCTGTTGGTGCTCTTCTTGTTTATGATCTCACGAAGAGACCGACTTTCGACAACGTGCAAAGGTGGCTCCGGGAACTGAGAGATCATGCAGATTCCAAC
ATTGTGATTGTGATGGTTGGAAACAAGTCTGACCTAAATCATCTTAGATCGGTCTCGGAGGATGATGGGCAGGCCATGGCTGAGAAGGAAGGCCTATCATTTATCGAGAC
GTCAGCCCTGGATGCTACTAATATCGAGAAGGCGTTCCAAACCATCTTGACAGAGATCTACCACATCATCAGCAAAAAGGCATTGGCTGCCCAGGAGGCAGCTGCGAGCG
TGGGCCATCCCGGTCAGGGAACCACCATCAACGTTTCGGATGCTTCTGGGGACTCGAACAAAAGAGGTTGCTGTTCTACT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWLRELRDHADSN
IVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASGDSNKRGCCST