CuGenDBv2

Gene ID	MC02g1052
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	Photosystem II D2 protein
Genome location	MC02:8613372..8613662
RNA-Seq Expression	MC02g1052
Synteny	MC02g1052
Gene Ontology terms	GO:0009772 - photosynthetic electron transport in photosystem II (biological process) GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0009523 - photosystem II (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0042170 - plastid membrane (cellular component) GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function) GO:0045156 - electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity (molecular function) GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000484 - Photosynthetic reaction centre, L/M IPR036854 - Photosystem II protein D1/D2 superfamily

Homology

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e value

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KAB2011708.1 hypothetical protein ES319_D09G038800v1 [Gossypium barbadense]

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KAE9584798.1 Photosystem II D2 protein [Lupinus albus]

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PLY85049.1 hypothetical protein LSAT_7X5761 [Lactuca sativa]

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QGA85785.1 photosystem II protein D2, partial [Albizia adianthifolia]

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WP_206630711.1 hypothetical protein, partial [Vibrio vulnificus]

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A0A2J6LCI6 Uncharacterized protein

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A0A5J5PYM0 Uncharacterized protein

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A0A5Q0UWB1 Photosystem II protein D2 (Fragment)

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A0A5Q0UWU4 Photosystem II protein D2 (Fragment)

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A0A6A4NDR2 Photosystem II D2 protein

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A1E9Z3 Photosystem II D2 protein

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A4QJB0 Photosystem II D2 protein

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A4QJJ4 Photosystem II D2 protein

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Q3V539 Photosystem II D2 protein

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Q4FFP4 Photosystem II D2 protein

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ATCG00020.1 photosystem II reaction center protein A

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ATCG00270.1 photosystem II reaction center protein D

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Sequences

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CDS sequence

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CTAGGTCAGTCTGGTTGGTTCTTTGCGCCTAGTTTTGGTGTAGCAGCTATATTTCGATTCATCCTCTTTTTCCAAGGGTTTCATAATTGGACATTGAACCCATTTCATAT
GATGGGAGTTGCCGGTGTATTGGGCGCTGCTCTGCTATGCGCTATTCATGGTGCTACCGTAGAAAATACCTTATTTGAAGATGGTGATGGTGCAAATACATTCCGTGCTT
TTAACCCAACTCAAGCTGAAGAAACTTATTCAATGGTCACTGCTAACCGCTTTTGGTCCCTACACATATAT

mRNA sequence

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Protein sequence

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LGQSGWFFAPSFGVAAIFRFILFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGATVENTLFEDGDGANTFRAFNPTQAEETYSMVTANRFWSLHIY

MC02g1052 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome