CuGenDBv2

Gene ID	MC02g1273
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	U2 small nuclear ribonucleoprotein auxiliary factor-like protein
Genome location	MC02:11953282..11963240
RNA-Seq Expression	MC02g1273
Synteny	MC02g1273
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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e value

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Alignment

KAG6605331.1 hypothetical protein SDJN03_02648, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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e value

%identity

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A0A6J1D4D2 uncharacterized protein LOC111017494 isoform X1

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A0A6J1D6X2 uncharacterized protein LOC111017494 isoform X2

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A0A6J1G7H1 uncharacterized protein LOC111451522 isoform X1

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A0A6J1G7U7 uncharacterized protein LOC111451522 isoform X2

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A0A6J1L739 uncharacterized protein LOC111499771 isoform X5

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT5G64010.1 unknown protein

3.2e-38

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        + F PIFGE   E  + GS  +RR +F+V+  +  +L   VTDF S  W  I SV QL DMRD +GIGG  SEF++Y + SLK  +VKL L         
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          A+L SQK+KGMP  ++PLTK+V+S+ASEA+A+LS  LF + K  +       +  +  +   + EK+K ++  + L +Y++K  +      N  +SP 
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGCTTCAAGATTTCCCACCCATTTTTGGAGAACCCAAATTGGAGTGGTTAAACAGCGGTTCGCTTCCTGTGCGCCGATTTGTGTTCTATGTTCACAATCCCAATCC
TTCGCACCTCAGATTTTGTGTTACCGATTTCCATTCCAACACTTGGGAAGCCATCAGATCGGTTCCGCAGCTTCAGGACATGAGGGATGACATTGGAATTGGAGGGGATA
TGTCCGAGTTTCTTAACTATCTCATTACTTCCCTGAAACTTGGAGATGTAAAGCTTCGTCTTGAAGGACACTGGGGGAAGGAAGTTGCAACACATGCCAAATTAAGTTCC
CAGAAATCAAAAGGAATGCCTGTTTTTTCTATTCCTCTCACAAAACTCGTGGACTCAGCTGCTTCTGAAGCTGTGGCAAGTCTGTCCTTTGGGCTCTTTAACTCATTGAA
AGACATGGAATGTTCACTTATAAAAGAGCAAGAGCACTCCCTTCAGTTGACAAACATGATATCATCAGAAAAGGAAAAATACGAAAGTATTCAGAGCCATCTCGGGCAAT
ATACAAAGAAACAGAAGTTGCAAAATATGAATGCCTCAAATTCTCCAGATAAGTCTGTTCATAATATTGGCTCGACAAAAGTAGCCAATCGTGTAGTGCCAGCGCATCGC
AGGGCAAAAACAAGAGGAGCCCTTTTGCAAGACTCTGAAGATGACACTGGTAGGTATGACTTGATATGTTTTGTGCTTAGTTTTAAGTTTCAAGTCTTGAAAAGCTCTGC
TCCAGCCATCATTCTCACCCTTTTAACTGGCAAAAATCTCCATGGGTTTGGTCCTTGTGGGTTTTGCTCCAAACACGATGGAGAATCATCATCTGAAGCGGGATTTGGGG
TCGAGAGGGCTATCTCTCTCCTCCATAAAACTTTTCCAAAGTTTACAAACTTATGCTTATTCCTTGCAAGTTCTATTTTTTGCACAACAACGTTGAATATAGCATTATTA
AAACTAACCGTTTTCTCCAATCTTTTCCCCTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCTACTCTCCCTCCATAGCCAGCCTTCTTCGCCACTGCTGTCTCCGCCGGTAGGGTTTGTTTATAAAACATTTAAGAAAATTCCTACGTCGAAAATCTAAGGGTCGGGTT
CTCTCTGGTATCAGAACCGTTTCAGATTGGTCCAAAAGATCTCTTTAACCCAACCTGATCCAACCGATCGTTTTCCACAATCGCTGAATATATCTGATTGAGTAGAGAAC
AGAAACATTTGGGATAGTTGAAATTGAAATGGAGCTTCAAGATTTCCCACCCATTTTTGGAGAACCCAAATTGGAGTGGTTAAACAGCGGTTCGCTTCCTGTGCGCCGAT
TTGTGTTCTATGTTCACAATCCCAATCCTTCGCACCTCAGATTTTGTGTTACCGATTTCCATTCCAACACTTGGGAAGCCATCAGATCGGTTCCGCAGCTTCAGGACATG
AGGGATGACATTGGAATTGGAGGGGATATGTCCGAGTTTCTTAACTATCTCATTACTTCCCTGAAACTTGGAGATGTAAAGCTTCGTCTTGAAGGACACTGGGGGAAGGA
AGTTGCAACACATGCCAAATTAAGTTCCCAGAAATCAAAAGGAATGCCTGTTTTTTCTATTCCTCTCACAAAACTCGTGGACTCAGCTGCTTCTGAAGCTGTGGCAAGTC
TGTCCTTTGGGCTCTTTAACTCATTGAAAGACATGGAATGTTCACTTATAAAAGAGCAAGAGCACTCCCTTCAGTTGACAAACATGATATCATCAGAAAAGGAAAAATAC
GAAAGTATTCAGAGCCATCTCGGGCAATATACAAAGAAACAGAAGTTGCAAAATATGAATGCCTCAAATTCTCCAGATAAGTCTGTTCATAATATTGGCTCGACAAAAGT
AGCCAATCGTGTAGTGCCAGCGCATCGCAGGGCAAAAACAAGAGGAGCCCTTTTGCAAGACTCTGAAGATGACACTGGTAGGTATGACTTGATATGTTTTGTGCTTAGTT
TTAAGTTTCAAGTCTTGAAAAGCTCTGCTCCAGCCATCATTCTCACCCTTTTAACTGGCAAAAATCTCCATGGGTTTGGTCCTTGTGGGTTTTGCTCCAAACACGATGGA
GAATCATCATCTGAAGCGGGATTTGGGGTCGAGAGGGCTATCTCTCTCCTCCATAAAACTTTTCCAAAGTTTACAAACTTATGCTTATTCCTTGCAAGTTCTATTTTTTG
CACAACAACGTTGAATATAGCATTATTAAAACTAACCGTTTTCTCCAATCTTTTCCCCTAGAACAAGAGCGCTCCCTTCAGTCAACAAAAATCTCGGATGAAAAGGTATA
TTTGTCTCTCATTCACTTTTAAAAAAAGTTGCTGGTGAGTGTTTCTTTATGCTCTTATAGGTGCGTTTTTATTGTCTCGAGACCCCATTAGATAAGTAGAAATATAGTCG
TGATTGTCGTGTATCTTCTGTATCTTAGAGCGTATCTTGATCTTGCTTATTATTTGTTAATTCTGCACATATTTTGCAACTCTCGAACTTTCTTTTTAAAATGTTAGGAA
AAGAAACAGGAGTTGCATACTACAATTACCTCAGTCAATAAAGATGAGTTGCAAAAGTCTCCTGACAAACCTGTTAATGATATCAGCTCGACAAAGGTCACCAATCGTGT
CATGCCAGTACACCGCAGGGCCAGAACAAGAGGTGCCCTTCTACAAGATAATGAAGATGACGGTGGTCGGTAAAGCGATGTAGAATCATTCAGTGATAAACGAAAATATA
CGGATAACAGTGGATATTTCTTTCACAAAAGGGATTATGCAATGCAGATGTTTGTTCCAAAGTTTCATGAAAAATGAAATTGTTGTTTCTTATGGTAATATAAATATCAT
CCCACATTCTGTTTCGTTTGAATTTTACTTTCTAATGAACCTTATAAACGGCCTCTTTAAATTAGGCCTTAGAGTGTAATTAGGAATTTCTAATCGATCTTTGAACTTTT
AGGATGATATTTAATTAGTTCTCATACACAAAAGATTTTAATAAGTT

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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QKSKGMPVFSIPLTKLVDSAASEAVASLSFGLFNSLKDMECSLIKEQEHSLQLTNMISSEKEKYESIQSHLGQYTKKQKLQNMNASNSPDKSVHNIGSTKVANRVVPAHR
RAKTRGALLQDSEDDTGRYDLICFVLSFKFQVLKSSAPAIILTLLTGKNLHGFGPCGFCSKHDGESSSEAGFGVERAISLLHKTFPKFTNLCLFLASSIFCTTTLNIALL
KLTVFSNLFP

MC02g1273 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome