CuGenDBv2

Gene ID	MC03g0082
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	VARLMGL domain-containing protein
Genome location	MC03:1211053..1212825
RNA-Seq Expression	MC03g0082
Synteny	MC03g0082
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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e value

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KAA0031834.1 transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]

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A0A0A0LY94 VARLMGL domain-containing protein

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A0A1S3C6M1 uncharacterized protein LOC103497072

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A0A5A7SKY9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2

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A0A5D3BBU9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2

1.74e-171

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A0A6J1DBZ9 uncharacterized protein LOC111018930

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G58630.1 unknown protein

2.7e-23

31.82

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Query:  MKLLPSPSCSSSSSFSTSTFDANVCNPRATPSCLSGILRRILCSGSLPTHPSDQIMEEANSVKSDSDKVLQVKDVSAIKATNEGKPSAGIVARLMGLDPM
        MK  PSP+ S S    T +F            C+S IL+R LCSG+  T+PSD I E   S KS        +D         G    G VARLMGLD +
Subjt:  MKLLPSPSCSSSSSFSTSTFDANVCNPRATPSCLSGILRRILCSGSLPTHPSDQIMEEANSVKSDSDKVLQVKDVSAIKATNEGKPSAGIVARLMGLDPM

Query:  PEMKLNQNLISRSQSMNSLEHFYKHLEGKHQRIRSTLSFREIPTFLELENEDYFILSFEGESRSKEFRPKERRRSERRSGEFKQRKEEEERCKNGGSNKT
        P +      +SRS S+N L+     ++GKH+R++STL       ++ELE++D+FILSFE +   KE     R   +RR     Q K E++    G  N  
Subjt:  PEMKLNQNLISRSQSMNSLEHFYKHLEGKHQRIRSTLSFREIPTFLELENEDYFILSFEGESRSKEFRPKERRRSERRSGEFKQRKEEEERCKNGGSNKT

Query:  EQLSASKTKKKKTLDPEEAKEFVLIDLKEQKKSRRRVSNKRTSKISTKEHRHGRLRGGG--SVPERVTNGRKATRRVESDCSS-DESSPVSVLDCSQFLR
          ++ S  +++  +        ++   KE++KSRR+   ++ +K+     +   ++  G  S  E + N    + + E +C S D+SSPVSVLD  ++  
Subjt:  EQLSASKTKKKKTLDPEEAKEFVLIDLKEQKKSRRRVSNKRTSKISTKEHRHGRLRGGG--SVPERVTNGRKATRRVESDCSS-DESSPVSVLDCSQFLR

Query:  DSGAPSSGDAASSSSPTHPRRKLSPELEISQ-SPSPRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGII-EG
            PS G+ +        RR+LS ELE S+ + +   D   + +  K  + +  G    QE W   IC++T ++L  S+W F+    + ED  GII E 
Subjt:  DSGAPSSGDAASSSSPTHPRRKLSPELEISQ-SPSPRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGII-EG

Query:  FDSYILQGLIEEFVEQLN
          S IL  L+EE +  L+
Subjt:  FDSYILQGLIEEFVEQLN

Sequences

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ATGAAGTTGTTGCCTTCTCCTTCTTGCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCCACTTCCACTTTCGATGCCAATGTCTGCAACCCCAGAGCTACACCCAGCTGCCTTTCGGGAAT
TCTCCGTCGAATTCTCTGCTCCGGCAGCCTCCCGACGCACCCGTCTGACCAGATCATGGAAGAAGCTAACTCAGTGAAGTCTGATAGTGACAAGGTTCTTCAAGTCAAGG
ATGTGAGTGCCATCAAGGCAACAAATGAGGGCAAGCCCAGTGCTGGAATTGTGGCGAGGTTGATGGGTTTGGATCCCATGCCAGAGATGAAGCTGAATCAGAATTTGATA
TCAAGGAGCCAATCCATGAACTCATTGGAGCATTTCTACAAACACTTGGAGGGCAAGCATCAGCGGATCAGATCAACGCTCTCATTCAGGGAAATCCCAACCTTTCTTGA
GCTTGAAAATGAGGATTACTTCATCCTTAGCTTTGAGGGAGAAAGCAGAAGCAAAGAATTCAGACCCAAAGAAAGAAGAAGAAGCGAAAGGAGGAGTGGAGAATTCAAGC
AAAGAAAGGAAGAGGAAGAGAGATGTAAGAACGGGGGAAGCAACAAAACAGAGCAGCTTTCAGCGAGCAAAACGAAGAAGAAGAAGACACTGGATCCAGAAGAAGCCAAA
GAGTTTGTTCTAATAGATTTGAAAGAACAGAAGAAATCAAGAAGGAGAGTCTCCAATAAACGTACCTCCAAAATTTCAACGAAGGAGCACCGCCATGGGAGACTCCGAGG
CGGAGGATCAGTACCTGAAAGAGTCACCAATGGCAGAAAAGCAACCAGAAGAGTAGAATCAGACTGCAGTTCCGACGAATCAAGCCCGGTTTCAGTTCTCGATTGCAGTC
AATTCCTCAGAGATTCCGGAGCCCCATCATCAGGAGACGCCGCTTCAAGCTCCTCCCCCACACACCCGAGAAGGAAACTATCGCCGGAGCTCGAAATTTCTCAGAGCCCA
TCTCCTCGAAACGACGATGATTTGATAATCAACGAAGTAAAAATTGCGAAGGCGAAAGGGGGCGGCGATGGAACGCAGCAAGAAAGATGGGAAGAAGAGATTTGCAGGAT
GACTGAGACTGAATTGGCCGAGTCAAATTGGAAATTCAGCAAAATTTGTGAAGAACACGAAGATTTTGGAGGTATAATTGAAGGCTTTGACTCGTATATTCTTCAAGGAT
TGATTGAGGAGTTTGTAGAACAATTGAATGATCTTCGACCAAAGATCATCACATGA

mRNA sequence

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CGCCACTTTCTCTTTTTCTCTTCTCTTTCTTACTTTCTATCATAACCCATTCAAATTTTTCTTCTTCACTTTGTTTTCTGTAATTGCTTTACCAGGAAAAAGAAAAAGAA
AAACGAAGAATCCCCCCTTAGTGGAAATCCCAATTTCAACACAACCCCTCTTAACTTAGATTTCCTTTTACTCATTTTCCTAAGCATTACTGACCTGAAATCAGCATGAA
GTTGTTGCCTTCTCCTTCTTGCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCCACTTCCACTTTCGATGCCAATGTCTGCAACCCCAGAGCTACACCCAGCTGCCTTTCGGGAATTCTCC
GTCGAATTCTCTGCTCCGGCAGCCTCCCGACGCACCCGTCTGACCAGATCATGGAAGAAGCTAACTCAGTGAAGTCTGATAGTGACAAGGTTCTTCAAGTCAAGGATGTG
AGTGCCATCAAGGCAACAAATGAGGGCAAGCCCAGTGCTGGAATTGTGGCGAGGTTGATGGGTTTGGATCCCATGCCAGAGATGAAGCTGAATCAGAATTTGATATCAAG
GAGCCAATCCATGAACTCATTGGAGCATTTCTACAAACACTTGGAGGGCAAGCATCAGCGGATCAGATCAACGCTCTCATTCAGGGAAATCCCAACCTTTCTTGAGCTTG
AAAATGAGGATTACTTCATCCTTAGCTTTGAGGGAGAAAGCAGAAGCAAAGAATTCAGACCCAAAGAAAGAAGAAGAAGCGAAAGGAGGAGTGGAGAATTCAAGCAAAGA
AAGGAAGAGGAAGAGAGATGTAAGAACGGGGGAAGCAACAAAACAGAGCAGCTTTCAGCGAGCAAAACGAAGAAGAAGAAGACACTGGATCCAGAAGAAGCCAAAGAGTT
TGTTCTAATAGATTTGAAAGAACAGAAGAAATCAAGAAGGAGAGTCTCCAATAAACGTACCTCCAAAATTTCAACGAAGGAGCACCGCCATGGGAGACTCCGAGGCGGAG
GATCAGTACCTGAAAGAGTCACCAATGGCAGAAAAGCAACCAGAAGAGTAGAATCAGACTGCAGTTCCGACGAATCAAGCCCGGTTTCAGTTCTCGATTGCAGTCAATTC
CTCAGAGATTCCGGAGCCCCATCATCAGGAGACGCCGCTTCAAGCTCCTCCCCCACACACCCGAGAAGGAAACTATCGCCGGAGCTCGAAATTTCTCAGAGCCCATCTCC
TCGAAACGACGATGATTTGATAATCAACGAAGTAAAAATTGCGAAGGCGAAAGGGGGCGGCGATGGAACGCAGCAAGAAAGATGGGAAGAAGAGATTTGCAGGATGACTG
AGACTGAATTGGCCGAGTCAAATTGGAAATTCAGCAAAATTTGTGAAGAACACGAAGATTTTGGAGGTATAATTGAAGGCTTTGACTCGTATATTCTTCAAGGATTGATT
GAGGAGTTTGTAGAACAATTGAATGATCTTCGACCAAAGATCATCACATGAACTAACACGTAAATTTCGAATTATAGTTACTAAATTTACCAGAAATTGAAACAGAATCA
AGAGGATGGAAGAGAAATCCGGTTCTAATTTCAAACTTACTGTTGCAATTTGAATTTGAATTTGAATTCACGATTCGTGAAGAACAGGGAATATCTGTTCTTTGAATTTT
CCTTCGAAGTAAAAAGAAATTTATGAAAGAATTTTTGTTCTCT

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SRSQSMNSLEHFYKHLEGKHQRIRSTLSFREIPTFLELENEDYFILSFEGESRSKEFRPKERRRSERRSGEFKQRKEEEERCKNGGSNKTEQLSASKTKKKKTLDPEEAK
EFVLIDLKEQKKSRRRVSNKRTSKISTKEHRHGRLRGGGSVPERVTNGRKATRRVESDCSSDESSPVSVLDCSQFLRDSGAPSSGDAASSSSPTHPRRKLSPELEISQSP
SPRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGIIEGFDSYILQGLIEEFVEQLNDLRPKIIT

MC03g0082 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome