| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607292.1 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.40e-153 | 75 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS R+TRRELEKHFSAEGTV DVHLV DPWTRESRGFGFITMSSN+EAERC
Subjt: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
IKYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTVRVRRRS SYS R SPSYSPY RS S SS YSS+RSRSRSHSP R RRS SPYH+RSYSPYS
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
Query: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTL-RSYSRSPSSVRIYS
RRYDSPYYR HRSYSRS SP R PTRRHDRSYS Y DY S D YYRRHR RSVSRSVSPKAR+S R YSRSYSPR RR+ RSYSRS
Subjt: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTL-RSYSRSPSSVRIYS
Query: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
RSYSRS+SPERS+R S+ S RS RSRSRSHT R H + YSG S S V SRSVSPA
Subjt: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| XP_008457405.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucumis melo] | 5.53e-154 | 75 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
MSYSR+SRYSRSPS++RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTV DVHL+ADP TRESRGFGFITMSSN+EAE C
Subjt: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS---
IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRSRS S RHRRSYGSPYH RSYS
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS---
Query: -----PYSRRRYDSP-YYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRR-TLRSYSR
PY RRRYDSP YYR HRSYSRS S PY R DRSYS Y DYYS D YYRRHRYRSVSRS+SPK+R +GR YSRSYSP PRR TLR+YS
Subjt: -----PYSRRRYDSP-YYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRR-TLRSYSR
Query: SPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRS---SRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
SPS RSYSRS+SPERS+RSGS + S R RS RSRS SHT RRH E++ KR YS SRSRS+SV SRSVSPA
Subjt: SPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRS---SRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| XP_022150940.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 [Momordica charantia] | 5.96e-249 | 99.21 | Show/hide |
Query: MMSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAER
MMSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTV DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAER
Subjt: MMSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAER
Query: CIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
CIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
Subjt: CIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
Query: SRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYS
SRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYS
Subjt: SRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYS
Query: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSVVSRSVSPA
Subjt: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| XP_022150941.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 [Momordica charantia] | 5.83e-203 | 99.68 | Show/hide |
Query: DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSS
DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSS
Subjt: DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSS
Query: ERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG
ERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG
Subjt: ERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG
Query: RGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSV
RGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSV
Subjt: RGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSV
Query: VSRSVSPA
VSRSVSPA
Subjt: VSRSVSPA
|
|
| XP_038894517.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 [Benincasa hispida] | 6.39e-153 | 75.98 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
MS SR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTV DVHLV DP TRESRGFGFITMSSN+EA+ C
Subjt: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS RSRSRSHS RHRRSYGS Y++RSYS YS
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
Query: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRR-TLRSYSRSPSSVRIYS
RRRYDSP R H+SYSRS RSPY R R DRSYS Y DY D YYRRHRYRSVSRS+SPKARIS R YSRSYSP PRR TLR R YS
Subjt: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRR-TLRSYSRSPSSVRIYS
Query: RSPSLELR-SYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRS---RSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
RS S E R SYSRS+SPERS+RS S S RSRS RSRS+T RRHS+K+YE+ + SRSRSRSV SRSVSPA
Subjt: RSPSLELR-SYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRS---RSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C508 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 2.68e-154 | 75 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
MSYSR+SRYSRSPS++RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTV DVHL+ADP TRESRGFGFITMSSN+EAE C
Subjt: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS---
IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRSRS S RHRRSYGSPYH RSYS
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS---
Query: -----PYSRRRYDSP-YYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRR-TLRSYSR
PY RRRYDSP YYR HRSYSRS S PY R DRSYS Y DYYS D YYRRHRYRSVSRS+SPK+R +GR YSRSYSP PRR TLR+YS
Subjt: -----PYSRRRYDSP-YYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRR-TLRSYSR
Query: SPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRS---SRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
SPS RSYSRS+SPERS+RSGS + S R RS RSRS SHT RRH E++ KR YS SRSRS+SV SRSVSPA
Subjt: SPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRS---SRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| A0A6J1D9V3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 | 2.89e-249 | 99.21 | Show/hide |
Query: MMSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAER
MMSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTV DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAER
Subjt: MMSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAER
Query: CIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
CIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
Subjt: CIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
Query: SRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYS
SRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYS
Subjt: SRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYS
Query: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSVVSRSVSPA
Subjt: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| A0A6J1DD22 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 | 2.82e-203 | 99.68 | Show/hide |
Query: DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSS
DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSS
Subjt: DVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSS
Query: ERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG
ERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG
Subjt: ERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG
Query: RGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSV
RGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSV
Subjt: RGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSV
Query: VSRSVSPA
VSRSVSPA
Subjt: VSRSVSPA
|
|
| A0A6J1GAS3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X4 | 1.32e-149 | 73.95 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS R+TRRELEKHFSAEGTV DVHLV DPWTRESRGFGFITMSSN+EAERC
Subjt: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
IKYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTV VRRR SYS R SPSYSPY RS S SS YSS+RSRSRSHSP R RRS SPY +RSYSPYS
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
Query: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTL-RSYSRSPSSVRIYS
RRRYDSPYYR HRSYSRS SP R PTRRHDRSYS Y DY S D YYRRHR RSVSRSVSPKAR+S R YS SYSPR RR+ RS+SRS
Subjt: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTL-RSYSRSPSSVRIYS
Query: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
RSYSRS+SPERS+R S+ S RS RSRSRSHT R H + YSG S S V SRSVSPA
Subjt: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| A0A6J1GBJ2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X5 | 2.65e-149 | 73.95 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS R+TRRELEKHFSAEGTV DVHLV DPWTRESRGFGFITMSSN+EAERC
Subjt: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
IKYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTV VRRR SYS R SPSYSPY RS S SS YSS+RSRSRSHSP R RRS SPY +RSYSPYS
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
Query: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTL-RSYSRSPSSVRIYS
RRRYDSPYYR HRSYSRS SP RSPTRR DRSYS Y DY S D YYRRHR RSVSRSVSPKAR+S R YS SYSPR RR+ RS+SRS
Subjt: RRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTL-RSYSRSPSSVRIYS
Query: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
RSYSRS+SPERS+R S+ S RS RSRSRSHT R H + YSG S S V SRSVSPA
Subjt: RSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRS-RSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSPA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 3.4e-09 | 35.91 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEE
S SR R SRS SY R R S S S + V N N L V GLS T R+L + FS G + DV +V D +R SRGF F+ + ++
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEE
Query: AERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSP---YRRS---------SSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHR
A+ + N L+GR I V+ + +R TPTPG Y+G T RR Y + Y Y RS R+++ + R RS SPY R
Subjt: AERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSP---YRRS---------SSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHR
Query: RSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
Y S RSYSP RRY
Subjt: RSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
|
|
| P62996 Transformer-2 protein homolog beta | 3.4e-09 | 35.91 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEE
S SR R SRS SY R R S S S + V N N L V GLS T R+L + FS G + DV +V D +R SRGF F+ + ++
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEE
Query: AERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSP---YRRS---------SSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHR
A+ + N L+GR I V+ + +R TPTPG Y+G T RR Y + Y Y RS R+++ + R RS SPY R
Subjt: AERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSP---YRRS---------SSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHR
Query: RSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
Y S RSYSP RRY
Subjt: RSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
|
|
| Q10422 Uncharacterized RNA-binding protein C25G10.01 | 1.0e-13 | 32.87 | Show/hide |
Query: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKA
+ S + + +S EN GN+L+V+G++ RM EL++ FS GTV H V ++ +P T+ SRGFGF++ S+ EEA I LN GR++ V+KA
Subjt: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKA
Query: RRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRY--DSPYYRCHRSYSR
+R R +PTPG+Y+G RRR+ P S+++ Y R R + YR+ P S Y + RY DS R + R
Subjt: RRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRY--DSPYYRCHRSYSR
Query: SGSRSPYCRSPTRRHD
S + + + P R+D
Subjt: SGSRSPYCRSPTRRHD
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 3.4e-09 | 35.91 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEE
S SR R SRS SY R R S S S + V N N L V GLS T R+L + FS G + DV +V D +R SRGF F+ + ++
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEE
Query: AERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSP---YRRS---------SSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHR
A+ + N L+GR I V+ + +R TPTPG Y+G T RR Y + Y Y RS R+++ + R RS SPY R
Subjt: AERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSP---YRRS---------SSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHR
Query: RSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
Y S RSYSP RRY
Subjt: RSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
|
|
| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 2.7e-59 | 51.51 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
MSYSR+SRYS S S Y++ RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHLV DPWTRESRGFGFI+M S +A
Subjt: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
Query: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS
RCI+ L+ SVL+GR+ITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT R R +S SYSPR S S S SRS YSS+ R RS+SP SYG SYS
Subjt: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS
Query: PYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYY-----------DYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG-------RGYSRSYSP
P+ RRR R YS S S SP R RR DRSYS YY + +RD Y RYRS SRS SP+ R RG RSYSP
Subjt: PYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYY-----------DYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG-------RGYSRSYSP
Query: RPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSP
+ RSY SP S R Y R RS S SVSP S S + R R SRS+SR H R+ S +RS SRSVSP
Subjt: RPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G07350.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.9e-60 | 51.51 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
MSYSR+SRYS S S Y++ RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHLV DPWTRESRGFGFI+M S +A
Subjt: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
Query: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS
RCI+ L+ SVL+GR+ITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT R R +S SYSPR S S S SRS YSS+ R RS+SP SYG SYS
Subjt: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYS
Query: PYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYY-----------DYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG-------RGYSRSYSP
P+ RRR R YS S S SP R RR DRSYS YY + +RD Y RYRS SRS SP+ R RG RSYSP
Subjt: PYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYY-----------DYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISG-------RGYSRSYSP
Query: RPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSP
+ RSY SP S R Y R RS S SVSP S S + R R SRS+SR H R+ S +RS SRSVSP
Subjt: RPRRTLRSYSRSPSSVRIYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLEGRSSRSRSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSGASRSRSRSVVSRSVSP
|
|
| AT1G07350.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.1e-34 | 67.77 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
MSYSR+SRYS S S Y++ RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHLV DPWTRESRGFGFI+M S +A
Subjt: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
Query: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEK
RCI+ L+ SVL+GR+ITVEK
Subjt: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEK
|
|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.3e-36 | 51.79 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
S SR SRS S R +S S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TMSS ++AERCI
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
Query: KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-VRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
KYLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ R R S RH Y R Y RS R +SP RRS RSYSP+
Subjt: KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-VRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYS
Query: R---RRYDSPYYRCHRSYSRSGSR
R RR + R R Y GSR
Subjt: R---RRYDSPYYRCHRSYSRSGSR
|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-34 | 51.56 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
S SR SRS S R +S S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TMSS ++AERC
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-VRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
IKYLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ R R S RH Y R Y RS R +SP RRS RSYSP+
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-VRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPY
Query: SR---RRYDSPYYRCHRSYSRSGSR
R RR + R R Y GSR
Subjt: SR---RRYDSPYYRCHRSYSRSGSR
|
|
| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.3e-27 | 61.86 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
S SR SRS S R +S S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TMSS ++AERC
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVRHDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERC
Query: IKYLNRSVLEGRIITVEK
IKYLN+SVLEGR ITVE+
Subjt: IKYLNRSVLEGRIITVEK
|
|
