; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC03g0214 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC03g0214
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationMC03:4710792..4710961
RNA-Seq ExpressionMC03g0214
SyntenyMC03g0214
Gene Ontology termsGO:0042138 - meiotic DNA double-strand break formation (biological process)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042357.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold795G00650 [Cucumis melo var. makuwa]2.33e-0961.82Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL
        SL + KS   ELLRF+S SII +T EK DDQKLLV++FL RAFAL GD E+ + L
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL

KAG6583341.1 Protein DOUBLE-STRAND BREAK FORMATION, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.55e-1065.38Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEAS
        SL++ KS + ELLRF+S SII +T+EK DDQKLLV++FL RAFAL GD EA+
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEAS

KAG7019109.1 hypothetical protein SDJN02_18067, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.31e-1064.15Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASI
        SL++ KS + ELLRF+S SII +T+EK DDQKLLV++FL RAFAL GD EA++
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASI

XP_022154860.1 uncharacterized protein LOC111022017 isoform X1 [Momordica charantia]1.18e-1270.91Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL
        SLIEAKS++ ELLRF+S SII +T+EK DDQKLLVL+FL RAFAL GDTE+ + L
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL

XP_022154861.1 uncharacterized protein LOC111022017 isoform X2 [Momordica charantia]6.37e-1370.91Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL
        SLIEAKS++ ELLRF+S SII +T+EK DDQKLLVL+FL RAFAL GDTE+ + L
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CL48 uncharacterized protein LOC103502216 isoform X13.39e-0961.82Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL
        SL + KS   ELLRF+S SII +T EK DDQKLLV++FL RAFAL GD E+ + L
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL

A0A1S3CL50 uncharacterized protein LOC103502216 isoform X21.43e-0966.67Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEA
        SL + KS   ELLRF+S SII +T EK DDQKLLV++FL RAFAL GD EA
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEA

A0A5A7TKX6 Uncharacterized protein1.13e-0961.82Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL
        SL + KS   ELLRF+S SII +T EK DDQKLLV++FL RAFAL GD E+ + L
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL

A0A6J1DKU7 uncharacterized protein LOC111022017 isoform X15.70e-1370.91Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL
        SLIEAKS++ ELLRF+S SII +T+EK DDQKLLVL+FL RAFAL GDTE+ + L
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL

A0A6J1DPZ7 uncharacterized protein LOC111022017 isoform X23.08e-1370.91Show/hide
Query:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL
        SLIEAKS++ ELLRF+S SII +T+EK DDQKLLVL+FL RAFAL GDTE+ + L
Subjt:  SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFAL-GDTEASILL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCGTTGATCGAAGCCAAATCCAAAATTGATGAACTACTCAGATTTAAATCAGCTTCTATCATTAGCAAAACCATCGAAAAAGCTGATGATCAAAAGCTTCTAGTCCTCAA
ATTTCTGTTTCGAGCTTTCGCCTTGGGAGACACTGAGGCAAGTATTCTTTTGCATAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCGTTGATCGAAGCCAAATCCAAAATTGATGAACTACTCAGATTTAAATCAGCTTCTATCATTAGCAAAACCATCGAAAAAGCTGATGATCAAAAGCTTCTAGTCCTCAA
ATTTCTGTTTCGAGCTTTCGCCTTGGGAGACACTGAGGCAAGTATTCTTTTGCATAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SLIEAKSKIDELLRFKSASIISKTIEKADDQKLLVLKFLFRAFALGDTEASILLHN