; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC03g0700 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC03g0700
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationMC03:13878961..13881239
RNA-Seq ExpressionMC03g0700
SyntenyMC03g0700
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147409.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]3.26e-9998.68Show/hide
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XP_011625944.1 40S ribosomal protein S14 [Amborella trichopoda]4.48e-9996.03Show/hide
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XP_020106366.1 40S ribosomal protein S14-like [Ananas comosus]6.37e-9996.69Show/hide
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XP_038893713.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Benincasa hispida]1.14e-9999.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B9H6 40S ribosomal protein S14-2-like1.58e-9998.68Show/hide
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A0A6J1CHJ7 40S ribosomal protein S147.87e-102100Show/hide
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A0A6J1GTR2 40S ribosomal protein S14-2-like1.58e-9998.68Show/hide
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A0A6J1KQN4 40S ribosomal protein S14-2-like1.58e-9998.68Show/hide
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W1PY91 Uncharacterized protein2.17e-9996.03Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S143.8e-7395.27Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S143.1e-7594.7Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-36.5e-7391.89Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-25.9e-7493.92Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-15.0e-7392.57Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein3.6e-7492.57Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein4.2e-7593.92Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein4.6e-7491.89Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S112.8e-1030.61Show/hide
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        +  R+ TR    + V   P         GV H+ ASFN+T + VTD+ GR       G    +  R   +P+AA  AA +  +   + G+    +++   
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             K PG G  +ALRA+ RSG+ +  + DVTP+P +  R    RR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAATGATACATTTATCCATGTGACTGATCTTTCTGGGAGGGAAACCCTTGTCCGCATCACAGGTGGTATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCGTCCCCATATGCAG
CTATGCTTGCAGCACAGGATGTTTCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGTATTACTGCCCTCCACATTAAACTGCGTGCCACTGGAGGAAACAAGACCAAAACGCCTGGTCCA
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AGGAAGAAGGCTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCCGACAGCCGCGAACCCTTCTCCTCGCACGAAGGATTTCTGCAGGCGACGTAGAGCTCCACAAAGCGGCTACTTCGTTTTCGTCTTTTGGAAAACATGTCTGGAAGGA
GAAAGACCAGGGAGCCCAAGGAAGAAACTGTGACTCTTGGACCTTCTGTGAGGGAAGGCGAGCATGTTTTCGGCGTGGCTCACATTTTTGCCTCATTTAATGATACATTT
ATCCATGTGACTGATCTTTCTGGGAGGGAAACCCTTGTCCGCATCACAGGTGGTATGAAGGTGAAAGCTGACAGGGATGAGTCGTCCCCATATGCAGCTATGCTTGCAGC
ACAGGATGTTTCTCAGAGATGCAAGGAGCTTGGTATTACTGCCCTCCACATTAAACTGCGTGCCACTGGAGGAAACAAGACCAAAACGCCTGGTCCAGGTGCCCAGTCTG
CACTACGTGCCCTTGCCCGTTCTGGAATGAGGATTGGTCGTATAGAGGATGTGACTCCAATTCCGACAGACAGCACCCGCAGAAAGGGTGGTAGGAGAGGAAGAAGGCTG
TAGGCTTGCTCCCGGATTCCTTCTGTTATGGCTGTGTTAGTGGTTTTTCCATGGGGTGCAATAGAATATATGGGTACTTTCGGATCTATTAATTTAATTATTGGCTATAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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