; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC03g1005 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC03g1005
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like
Genome locationMC03:16593766..16597204
RNA-Seq ExpressionMC03g1005
SyntenyMC03g1005
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001857 - Ribosomal protein L19
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR038657 - Ribosomal protein L19 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022137703.1 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like [Momordica charantia]2.03e-18398.15Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
        FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR

Query:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

XP_022955269.1 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X1 [Cucurbita moschata]4.43e-14481.99Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFI-NMGSQVEFVSSRKHVSSTCS
        MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF  +MGSQ+EF+ S K VSSTC 
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFI-NMGSQVEFVSSRKHVSSTCS

Query:  VFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
         FQ P+  LFQLAE+A PFSSRGIAT SS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
Subjt:  VFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK

Query:  RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

XP_022955270.1 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita moschata]6.36e-14682.29Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VSSTC  
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ P+  LFQLAE+A PFSSRGIAT SS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

XP_023542739.1 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.36e-14682.29Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ+FR+INQLVRRQS DAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  RPFGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VSSTC  
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ PR  LFQLAE+A PFSSRGIAT SS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEI VL+KKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

XP_038896029.1 uncharacterized protein LOC120084206 [Benincasa hispida]1.10e-14682.35Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ FRRINQLVRRQSPDAHFK IRGYPLNG+AGCSCS PM MEN   I+  FGN Y S +GS LRSFS+L NQ PEAF NM SQ+EFV SRKHVSS CS 
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        F   RP LFQLAE+  PFSSRGIAT SS+ES  Q SP +  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKAQREIPDI+PGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV41 Uncharacterized protein4.98e-14280.88Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ FRRINQLVRRQ PDA+FK IRGYPLNGDAGCSCSAPMSMEN FTI   FG  YGSL GSFLRSFS+  NQYPEAF NM SQ+EFV  RKH SST S 
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ  RP  FQLAE A PFSSRGIAT SS+ES  Q SP +   I PRIKFKRLDKTS+HIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        R+STLKGIVIARRNAGLN+TFR+RR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVL+KKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A6J1CB38 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like9.82e-18498.15Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
        FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR

Query:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A6J1GUP7 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X23.08e-14682.29Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VSSTC  
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ P+  LFQLAE+A PFSSRGIAT SS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

A0A6J1GVN3 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X12.15e-14481.99Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFI-NMGSQVEFVSSRKHVSSTCS
        MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF  +MGSQ+EF+ S K VSSTC 
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFI-NMGSQVEFVSSRKHVSSTCS

Query:  VFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
         FQ P+  LFQLAE+A PFSSRGIAT SS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
Subjt:  VFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK

Query:  RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

A0A6J1K1Y5 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X26.89e-14381.85Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ+F RINQLVRRQS  AHFK IRGYPLNGDA   CSA MSMEN  T  R F NPYGSLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VSS C  
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ PR  LFQLAE+A PFSSRGIAT SS+ES  Q SP I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEAIEEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIAT-SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALK
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALK
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P82413 50S ribosomal protein L19, chloroplastic6.5e-3143.32Show/hide
Query:  VEFVSSRKHVSSTCSVFQRPRPLLFQL---AEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPD
        V   SS    S+  S+F  P    F +   AE +    +  +A  + E +  ES     +  PR +  +L          +  LNK+A+   +  R +P 
Subjt:  VEFVSSRKHVSSTCSVFQRPRPLLFQL---AEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPD

Query:  IKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        I+ G IVQ+++EVPENKRR+S  KGIVI+R+NAG++TT R+RR++AGVG+E +FPLYSPNIKEIKV+  +KVR+A+LYYLRDK+  L
Subjt:  IKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

Q2RV56 50S ribosomal protein L191.7e-1845.79Show/hide
Query:  MQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAK
        M  +    KE IE++  QR +P   PG  +++ V+V E N++RV   +G+ IARRNA LN++F +R++  G G+E +FPLY+P I  I+V+ + KVRRAK
Subjt:  MQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAK

Query:  LYYLRDK
        LYYLR +
Subjt:  LYYLRDK

Q2VZV5 50S ribosomal protein L192.6e-1949.5Show/hide
Query:  LNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRD
        L KE IE++ A R +P   PG  +++ V+V E N+ RV   +G+ IAR+N GLN++F +R++  G G+E +FPLYSPNI  I+V+ +  VRRAKLYYLRD
Subjt:  LNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRD

Query:  K
        +
Subjt:  K

Q8RXX5 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic5.0e-3156.03Show/hide
Query:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK
        KT   +   +  LNK+AIE  +  R +P ++ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +K
Subjt:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK

Query:  VRRAKLYYLRDKMNAL
        VRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VRRAKLYYLRDKMNAL

Q8W463 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic5.0e-3149.65Show/hide
Query:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL
        +  E   +E  E  P   PRIK          +   +  LN++AIE  +  R +P+I+ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR+
Subjt:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL

Query:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        +AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24240.1 Ribosomal protein L19 family protein4.8e-5373.2Show/hide
Query:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN
        FSSR  +T+  +SV Q SPE    +  RIKFKRLDKT+KHIMQ    ++KEA+EEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRRVS +KG+VIARRNAGLN
Subjt:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN

Query:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        +TFR+RRLVAGVG+ES+FPLYSPN++ IKV+DKKKVRRAKLYYLR+K+NALKK
Subjt:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT4G11630.1 Ribosomal protein L19 family protein1.5e-5473.2Show/hide
Query:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN
        ++SR  +T+   SV Q SPE    +  RIKFKRLDKT+KHIMQ    ++KEA+EEV++ REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRRVS +KG+VIARRNAGLN
Subjt:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN

Query:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        +TFR+RRLVAGVG+ES+FPLYSPN++EIKV+DKKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
Subjt:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT4G17560.1 Ribosomal protein L19 family protein3.5e-3249.65Show/hide
Query:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL
        +  E   +E  E  P   PRIK          +   +  LN++AIE  +  R +P+I+ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR+
Subjt:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL

Query:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        +AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

AT5G11750.1 Ribosomal protein L19 family protein8.7e-5573.86Show/hide
Query:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN
        FS+ G    SV+S  Q SPE    +  RIKFKRLDKT+KHIMQ    ++KEA+EEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRRVS +KG+VIARRNAGLN
Subjt:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN

Query:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        +TFR+RRLVAGVG+ES+FPLYSPN++EIKV+DKKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
Subjt:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT5G47190.1 Ribosomal protein L19 family protein3.5e-3256.03Show/hide
Query:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK
        KT   +   +  LNK+AIE  +  R +P ++ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +K
Subjt:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK

Query:  VRRAKLYYLRDKMNAL
        VRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VRRAKLYYLRDKMNAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAAGTTTTCGCAGAATTAATCAGTTGGTACGAAGGCAAAGTCCCGATGCTCATTTCAAATCGATTAGAGGTTACCCACTTAATGGGGATGCTGGCTGTAGCTGCTC
GGCGCCAATGTCGATGGAAAACGGTTTTACTATTGCTCGGCCTTTTGGAAATCCATATGGGTCTTTGAATGGTTCCTTCTTGAGGTCTTTCTCAAAGTTGAGCAATCAAT
ATCCGGAAGCCTTCATAAATATGGGTTCTCAAGTGGAATTTGTGTCTTCGAGAAAGCATGTATCTTCAACTTGTTCAGTATTCCAGAGGCCTAGGCCACTTTTATTTCAG
TTGGCAGAAGTTGCCCCTCCTTTTTCTAGCAGGGGCATTGCGACTAGTTCCGTGGAATCAGTTTCACAAGAATCTCCTGAAATTACCCCTGATATAACTCCTCGCATCAA
ATTTAAGAGGCTGGATAAAACCTCAAAACACATAATGCAGGCACTCACATTTCTGAATAAGGAAGCTATTGAGGAGGTAAAAGCACAGAGAGAAATTCCAGATATTAAGC
CAGGCTATATTGTGCAGCTCAAAGTGGAAGTACCTGAGAACAAGCGCCGTGTCTCGACATTGAAAGGCATTGTAATAGCCAGACGCAATGCTGGTCTAAACACAACTTTT
AGACTAAGGAGGCTAGTTGCTGGTGTTGGGATTGAGTCGCTCTTTCCTCTATACTCACCAAACATAAAAGAGATTAAGGTGTTGGACAAGAAGAAAGTGCGGAGGGCCAA
GCTTTATTATCTTAGGGACAAAATGAACGCACTTAAGAAGCAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCAAAGCCCACTGATTGAGCCCGTAGTCCAAAGCGGTAAACTCAAGGTCCAGCTCAGTTGCATTGCAAGAGTGCCTGCTTTCTTCACCAAAAACCTCTCAGTCTCCTGAT
TTAGGGCTTTAGGCTTCAAGATTTCATCTCAACGAGGGGCTCTACTATTGCTCTCCCCGAGTAGGATCGTTCGAAATCTAGCGCGAAAATGCAAAGTTTTCGCAGAATTA
ATCAGTTGGTACGAAGGCAAAGTCCCGATGCTCATTTCAAATCGATTAGAGGTTACCCACTTAATGGGGATGCTGGCTGTAGCTGCTCGGCGCCAATGTCGATGGAAAAC
GGTTTTACTATTGCTCGGCCTTTTGGAAATCCATATGGGTCTTTGAATGGTTCCTTCTTGAGGTCTTTCTCAAAGTTGAGCAATCAATATCCGGAAGCCTTCATAAATAT
GGGTTCTCAAGTGGAATTTGTGTCTTCGAGAAAGCATGTATCTTCAACTTGTTCAGTATTCCAGAGGCCTAGGCCACTTTTATTTCAGTTGGCAGAAGTTGCCCCTCCTT
TTTCTAGCAGGGGCATTGCGACTAGTTCCGTGGAATCAGTTTCACAAGAATCTCCTGAAATTACCCCTGATATAACTCCTCGCATCAAATTTAAGAGGCTGGATAAAACC
TCAAAACACATAATGCAGGCACTCACATTTCTGAATAAGGAAGCTATTGAGGAGGTAAAAGCACAGAGAGAAATTCCAGATATTAAGCCAGGCTATATTGTGCAGCTCAA
AGTGGAAGTACCTGAGAACAAGCGCCGTGTCTCGACATTGAAAGGCATTGTAATAGCCAGACGCAATGCTGGTCTAAACACAACTTTTAGACTAAGGAGGCTAGTTGCTG
GTGTTGGGATTGAGTCGCTCTTTCCTCTATACTCACCAAACATAAAAGAGATTAAGGTGTTGGACAAGAAGAAAGTGCGGAGGGCCAAGCTTTATTATCTTAGGGACAAA
ATGAACGCACTTAAGAAGCAATAACAAGCTTTCTATCCAGTGGGATCAGAGGTGTGTACCTAACATGGTGCGTTGTAATCATTCTTAGCAAGAAACCTCATGAGTTTTCA
TGATTATCTTATCCTGTTTCATGCATGGAGGACCGACCTGAGAATTAATTTGGTGGAGCACTCAGCTTTGGCTGAAATAAAGAGAATGAAGTCTAACATTGATGGCCATA
TTCTTTCTTTCTTTTCTATGATCTCAAGCAAACCAAACCATGTTATTTCAATTATCAATTCGACAAGATTGTGCATGATTCTGATTTCTTGCTTATGAAATGGATAAAGC
TCAGTCTGTAAACTGCATTATTGGTATGCAATCTGGTTGGATGAGTTATTGATAGTATTTTGAGCCTATCCATGGTCAAACATAATCTTCTTTTGCTTAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSVFQRPRPLLFQ
LAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTF
RLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ