; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC03g_new0318 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC03g_new0318
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionChlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
Genome locationMC03:13782717..13784436
RNA-Seq ExpressionMC03g_new0318
SyntenyMC03g_new0318
Gene Ontology termsGO:0009416 - response to light stimulus (biological process)
GO:0009768 - photosynthesis, light harvesting in photosystem I (biological process)
GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process)
GO:0009522 - photosystem I (cellular component)
GO:0009523 - photosystem II (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001344 - Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista
IPR022796 - Chlorophyll A-B binding protein
IPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BAK6 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic5.87e-18696.92Show/hide
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A0A5D3DAQ5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic5.87e-18696.92Show/hide
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A0A6J1CDN4 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.05e-18799.23Show/hide
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A0A6J1CK60 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic1.41e-18695.91Show/hide
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A0A6J1CKT5 Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic5.46e-19199.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07370 Chlorophyll a-b binding protein 1B, chloroplastic6.9e-13990Show/hide
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P08221 Chlorophyll a-b binding protein of LHCII type I, chloroplastic (Fragment)2.5e-14193.33Show/hide
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P09756 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic1.3e-14294.62Show/hide
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P27493 Chlorophyll a-b binding protein 21, chloroplastic9.7e-14190.77Show/hide
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P27495 Chlorophyll a-b binding protein 40, chloroplastic1.1e-13990.84Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G29910.1 chlorophyll A/B binding protein 32.0e-13386.64Show/hide
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        MALSSP+ AGKAV L+P++ E+LG+GRV+MRK V+K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVIHSRW
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        AMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIF++GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGLA DP
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Query:  EAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATDFVPGK
        EAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+AT+FVPGK
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AT1G29920.1 chlorophyll A/B-binding protein 22.0e-13386.64Show/hide
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        MALSSP+ AGKAV L+P++ E+LG+GRV+MRK V+K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVIHSRW
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Query:  AMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFNEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDP
        AMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIF++GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGLA DP
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        EAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+AT+FVPGK
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AT1G29930.1 chlorophyll A/B binding protein 15.3e-13487.02Show/hide
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        MALSSP+ AGKAVKL+P++ E+LG+GRV+MRK V+K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGE PSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVIHSRW
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        AMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIF++GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGLA DP
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Query:  EAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATDFVPGK
        EAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGP+ENLADHLADPVNNNAWA+AT+FVPGK
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AT2G34420.1 photosystem II light harvesting complex gene B1B27.6e-13387.02Show/hide
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        MALSSP+ AGKAVK  P++ ++LG+GRV+MRK V+K    SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVIHSRW
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Query:  AMLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFNEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDP
        AMLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIF++GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGLA DP
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Query:  EAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATDFVPGK
        EAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+AT+FVPGK
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AT2G34430.1 light-harvesting chlorophyll-protein complex II subunit B12.4e-13486.59Show/hide
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        MALSSP+L GKAVKL+P++ E+ G GR++MRK    +  SGSPWYG DRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFA+NRELEVIHSRWA
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Query:  MLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFNEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPE
        MLGALGCVFPELL+RNGVKFGEAVWFKAGSQIF++GGLDYLGNPSL+HAQSILAIWA+QV+LMGAVEGYR+AG GPLGE  D +YPGGSFDPLGLA DPE
Subjt:  MLGALGCVFPELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFNEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAG-GPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPE

Query:  AFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATDFVPGK
        AFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWA+AT+FVPGK
Subjt:  AFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATDFVPGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCTCTCCTCTCCGTCACTCGCCGGAAAGGCGGTGAAGCTCACGCCCTCTTCCCCCGAGCTTCTCGGCAATGGGAGAGTCAGCATGAGAAAATTTGTCTCCAAGTC
CGTTTCTTCTGGGAGCCCATGGTACGGACCCGACCGTGTCAAATATTTGGGCCCATTCTCCGGTGAGCCTCCATCCTACCTCACCGGAGAATTCCCTGGAGACTATGGTT
GGGATACCGCCGGACTTTCTGCAGATCCCGAGACCTTTGCCAAGAATCGTGAGCTCGAAGTCATACACTCCAGGTGGGCTATGCTTGGGGCCTTGGGCTGCGTGTTCCCA
GAGCTTCTATCCCGCAACGGTGTGAAATTCGGGGAAGCGGTATGGTTCAAGGCTGGATCTCAGATCTTCAATGAAGGTGGGCTCGACTACTTGGGCAACCCCAGCTTGAT
CCACGCACAGAGCATTTTAGCCATTTGGGCTTCCCAAGTAGTTCTAATGGGAGCCGTCGAGGGATACCGTATTGCCGGTGGTCCACTCGGCGAGGTGACCGACCCGATCT
ACCCGGGTGGGAGCTTTGACCCGTTGGGACTTGCAGATGACCCGGAAGCATTTGCAGAGCTGAAGGTGAAGGAGCTTAAGAATGGAAGGTTGGCGATGTTCTCCATGTTT
GGTTTCTTCGTTCAGGCTATTGTCACCGGAAAAGGTCCATTGGAGAACCTTGCTGACCATTTGGCTGACCCAGTCAACAACAATGCTTGGGCTTACGCCACCGACTTTGT
TCCTGGAAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CGTTTCTTCTGGGAGCCCATGGTACGGACCCGACCGTGTCAAATATTTGGGCCCATTCTCCGGTGAGCCTCCATCCTACCTCACCGGAGAATTCCCTGGAGACTATGGTT
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CCACGCACAGAGCATTTTAGCCATTTGGGCTTCCCAAGTAGTTCTAATGGGAGCCGTCGAGGGATACCGTATTGCCGGTGGTCCACTCGGCGAGGTGACCGACCCGATCT
ACCCGGGTGGGAGCTTTGACCCGTTGGGACTTGCAGATGACCCGGAAGCATTTGCAGAGCTGAAGGTGAAGGAGCTTAAGAATGGAAGGTTGGCGATGTTCTCCATGTTT
GGTTTCTTCGTTCAGGCTATTGTCACCGGAAAAGGTCCATTGGAGAACCTTGCTGACCATTTGGCTGACCCAGTCAACAACAATGCTTGGGCTTACGCCACCGACTTTGT
TCCTGGAAAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALSSPSLAGKAVKLTPSSPELLGNGRVSMRKFVSKSVSSGSPWYGPDRVKYLGPFSGEPPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFAKNRELEVIHSRWAMLGALGCVFP
ELLSRNGVKFGEAVWFKAGSQIFNEGGLDYLGNPSLIHAQSILAIWASQVVLMGAVEGYRIAGGPLGEVTDPIYPGGSFDPLGLADDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMF
GFFVQAIVTGKGPLENLADHLADPVNNNAWAYATDFVPGK