; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC04g0492 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g0492
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationMC04:4135731..4139979
RNA-Seq ExpressionMC04g0492
SyntenyMC04g0492
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.65e-13096.72Show/hide
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XP_022931623.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita moschata]1.17e-13096.72Show/hide
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XP_023530137.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.09e-13197.27Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]4.97e-13297.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K481 UBC core domain-containing protein2.31e-13096.72Show/hide
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A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like2.31e-13096.72Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.76e-134100Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like5.67e-13196.72Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like5.67e-13196.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.7e-6563.93Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.6e-6563.93Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.6e-6563.93Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.1e-8985.87Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like8.2e-8682.7Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein5.8e-8782.7Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 11.5e-9085.87Show/hide
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 11.5e-9085.87Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAG
GTGGTACGTTTCTATTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAAT
GTCTGCCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACCATAATATACGGATTATTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGATCCCCTCAA
TCATGATGCCGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCCAAGTTGTTCGAATCCAATGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTACGTTGGGCAGACTTTCTTCACACGTTGCATGT
AG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAATGAAAAGTATGGTGCGACTGCGGGTGCAGAAGAACAAACGTGAACCATGAAACTGGAGATAGCTTCCACACATCTCTATTCTCTGGTCCGGTGGTCCCGTAAACG
GCGCAGTGTCGCAGTAAATCGACCGAGCTGTCACTCACCGTCCTTCGTGGCGCTCTCTGATTGGCCGTCCCGTCCGAACAAGCTTTGTAATAAGACGGATGACGCCGGTC
CTCGGTCGAAACTCGAAAGCGAAGGGAGCCCGGCTTTGGCCTGCACAGCGTACGACGATAATTGACACAGACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAG
AGGGAGAGTGAGTTCCGAATCAGATCCAGCTCCCTCCTTCTTTCTCTCTCACTTTCTACACGCTTTCGGGCCTGCTTCAGCTCTATCCTCTCCAGACTCTGTGCTCGTTC
AAATCCAGGTTGAAATCGAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAGGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGGAAACCCCCTGTCAAGAAGCAAAGTG
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