; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC04g1093 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g1093
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionProtein SIS2
Genome locationMC04:19034105..19036221
RNA-Seq ExpressionMC04g1093
SyntenyMC04g1093
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601944.1 hypothetical protein SDJN03_07177, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.02e-5876.39Show/hide
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KAG7032638.1 hypothetical protein SDJN02_06688 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.46e-5977.08Show/hide
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XP_022146328.1 uncharacterized protein LOC111015566 [Momordica charantia]3.46e-91100Show/hide
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XP_022961614.1 uncharacterized protein LOC111462310 [Cucurbita moschata]5.71e-5875.69Show/hide
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XP_023525740.1 uncharacterized protein LOC111789252 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.99e-5879.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQ37 uncharacterized protein LOC1035034022.38e-5274.07Show/hide
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A0A6J1CYA7 uncharacterized protein LOC1110155661.67e-91100Show/hide
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A0A6J1FJ66 uncharacterized protein LOC1114447531.05e-5376.3Show/hide
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A0A6J1HEK5 uncharacterized protein LOC1114623102.77e-5875.69Show/hide
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A0A6J1JTZ0 uncharacterized protein LOC1114874911.23e-5374.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G31560.1 high chlorophyll fluorescence 1537.2e-1641.84Show/hide
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        ARL +S      P+ P  ++ P    +P    PA  F+       C  R +R   + TRAG STSSY+ AF+IP +LI  TV T++KI D LD+ FLE++
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Query:  TLNEAIMEADEENKDDNSEISFE---PKPALPRTRNRPKRE
         LN+AI +A E+ ++   +IS +    +P L RTRNRPKRE
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCATTCCCTTCTCAAGCGCTATGGCGAGCGCCAGGCTCCTTATCTCATTCCAAATCCGAACCTTTCCCATTCCCCCTCTCCCCGTCGCTCCTCCGCGGTTGTTCTT
CAGACCCTCCACTCCCTCGCCGGCGCTCAGATTCTCCTGCGACCCCAGACCCCTGCGCCTGCGACTGCTGACCACTCGTGCCGGCGCCAGCACCAGCAGCTACATCTTCG
CCTTCTCCATCCCCTTCTCTCTCATTCTCATCACTGTTCTCACCGCTCTTAAAATCGGCGATAACCTCGACAAGAAATTTCTCGAGGAGGTTACTCTGAATGAAGCCATT
ATGGAAGCAGATGAGGAGAACAAAGATGATAATTCAGAAATATCCTTCGAACCAAAACCTGCTCTTCCACGAACTCGCAACCGCCCTAAAAGGGAAGCTGAGGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTGATTAAAGCATATATTTTCGACTGACTTTAATCTTATCCTTGGGTTGGGCCGCTTAGATTCAATTGGATGTGGGTAAAGAGGGTCTCATAGGGCTATGCCGATCCA
ATACTACGCGATGGACGATACAACTTCAGCCTTCCACCATGTCCATTCCCTTCTCAAGCGCTATGGCGAGCGCCAGGCTCCTTATCTCATTCCAAATCCGAACCTTTCCC
ATTCCCCCTCTCCCCGTCGCTCCTCCGCGGTTGTTCTTCAGACCCTCCACTCCCTCGCCGGCGCTCAGATTCTCCTGCGACCCCAGACCCCTGCGCCTGCGACTGCTGAC
CACTCGTGCCGGCGCCAGCACCAGCAGCTACATCTTCGCCTTCTCCATCCCCTTCTCTCTCATTCTCATCACTGTTCTCACCGCTCTTAAAATCGGCGATAACCTCGACA
AGAAATTTCTCGAGGAGGTTACTCTGAATGAAGCCATTATGGAAGCAGATGAGGAGAACAAAGATGATAATTCAGAAATATCCTTCGAACCAAAACCTGCTCTTCCACGA
ACTCGCAACCGCCCTAAAAGGGAAGCTGAGGTGTAAATAATGGCAGAGCTTTCGAAGGTGCCACAATCAGACGGTAGAGAAATGGCTCAAAGAATGCTTCCATGTATTAT
TATTGTATGTAAATTTTTCTTCGTAATAACATTAGTAAAAGAAAAAAAAAATTAACAATATTGTTGTATATTCTTCCAAGTTAAATAATTTTTCGCTAATATGAACATAA
TTCAATGATAATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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