; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC04g1215 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g1215
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description60S ribosomal protein L30-like
Genome locationMC04:20231119..20233494
RNA-Seq ExpressionMC04g1215
SyntenyMC04g1215
Gene Ontology termsGO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000231 - Ribosomal protein L30e
IPR004038 - Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45
IPR022991 - Ribosomal protein L30e, conserved site
IPR029064 - 50S ribosomal protein L30e-like
IPR039109 - Ribosomal protein L30/YlxQ


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140311.1 60S ribosomal protein L30 [Cucumis sativus]2.85e-7296.43Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIR SKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_008460497.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L30-like [Cucumis melo]6.98e-7397.32Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_022141723.1 60S ribosomal protein L30-like [Momordica charantia]2.96e-74100Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_022952815.1 60S ribosomal protein L30-like [Cucurbita moschata]5.74e-7297.32Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLP +Q
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

XP_022990953.1 60S ribosomal protein L30-like [Cucurbita maxima]1.16e-7196.43Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTV+RTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLP +Q
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CCQ4 60S ribosomal protein L30-like3.38e-7397.32Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A5D3DSZ7 60S ribosomal protein L30-like3.38e-7397.32Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A6J1CLC5 60S ribosomal protein L30-like1.43e-74100Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A6J1FH91 60S ribosomal protein L30-like3.38e-7397.32Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

A0A6J1JWW8 60S ribosomal protein L30-like3.38e-7397.32Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        MA AKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGSNVDLGTACGKY+RVSCLSIIDPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49884 60S ribosomal protein L301.0e-5490.18Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVL+++RSSKGKLII++NNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKY+RV CLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIK+LPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q8VZ19 60S ribosomal protein L30-22.3e-5183.93Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M   KKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++R SKGKLI++S NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKS+PGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q9C8F7 Putative 60S ribosomal protein L30-12.8e-5286.61Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYN +NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q9LSA3 60S ribosomal protein L30-38.9e-5183.93Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M A KK KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVH YNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIK+LPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

Q9M5M6 60S ribosomal protein L303.6e-5288.29Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKKTHESIN+RLALVMKSGK+TLGYKTVL ++RS+KGKLII++NNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKYFRV CLSIID G
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGD
        DSDIIKS+PGD
Subjt:  DSDIIKSLPGD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G36240.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein2.0e-5386.61Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M AAKKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYN +NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKSLPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

AT1G77940.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein1.7e-5283.93Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M   KKTKK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++R SKGKLI++S NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIKS+PGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ

AT3G18740.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein6.3e-5283.93Show/hide
Query:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG
        M A KK KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVH YNG+NVDLGTACGKYFRVSCLSI+DPG
Subjt:  MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPG

Query:  DSDIIKSLPGDQ
        DSDIIK+LPGDQ
Subjt:  DSDIIKSLPGDQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGACTCATGAGAGCATTAACAACAGGCTCGCCCTTGTGATGAAGAGCGGCAAGTACACACTGGGCTATAAAACCGTCCTACGCAC
TATTCGCAGCTCCAAAGGGAAGCTTATAATCCTATCGAACAACTGCCCGCCGCTGCGTAAGTCTGAAATTGAGTACTACGCGATGCTTGCTAAAGTTGGGGTTCACCACT
ACAACGGAAGCAATGTTGATCTTGGAACCGCCTGTGGCAAGTATTTCCGCGTGTCATGCCTCAGCATTATTGACCCAGGTGACTCTGATATTATCAAGTCGCTTCCTGGT
GATCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCTAACTTTCACATTCCTCTTCTTCGCAGTACCTCCACCTTTGGTCGTCAAAAATCTTCAGCGTAGGGCAAGGGGACGATGGCGGCGGCGAAGAAGACGAAGAAGACTC
ATGAGAGCATTAACAACAGGCTCGCCCTTGTGATGAAGAGCGGCAAGTACACACTGGGCTATAAAACCGTCCTACGCACTATTCGCAGCTCCAAAGGGAAGCTTATAATC
CTATCGAACAACTGCCCGCCGCTGCGTAAGTCTGAAATTGAGTACTACGCGATGCTTGCTAAAGTTGGGGTTCACCACTACAACGGAAGCAATGTTGATCTTGGAACCGC
CTGTGGCAAGTATTTCCGCGTGTCATGCCTCAGCATTATTGACCCAGGTGACTCTGATATTATCAAGTCGCTTCCTGGTGATCAGTGATAGTACCCTTTAGAAGCTGTCT
TTTTTGCGGCATCTTTTATCTTCAGCAAACGGTGGAATTTCCATCTTTTAATGTCCTCAGAATAGCAACCTACTTTCTGCAGTCAATTTTTAAAAATGTTAATGGTACTT
GTGTAAAAAACCCAGATTTTGTTGATGTCTTTGAGGTTTTGTTTAGTTGAGATGTGGTCTAAAGTGGAATGTTCAAGTATTTTTATCTATTTATGCCTAGACGATTGAGA
ATTCAGAATTTCCTTGTCTTCCGCATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAAKKTKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSNVDLGTACGKYFRVSCLSIIDPGDSDIIKSLPG
DQ