; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC04g1406 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g1406
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationMC04:22040956..22047571
RNA-Seq ExpressionMC04g1406
SyntenyMC04g1406
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022134271.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Momordica charantia]2.29e-250100Show/hide
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XP_022992660.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita maxima]2.27e-21689.83Show/hide
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XP_023550435.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.60e-21689.55Show/hide
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XP_038885315.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]4.41e-21688.89Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE83 Uncharacterized protein1.74e-21387.75Show/hide
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A0A1S3C3P2 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X12.20e-21488.39Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.11e-250100Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic5.45e-21789.83Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.10e-21689.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D2WKD9 Farnesol dehydrogenase3.4e-1932.47Show/hide
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         L EV+ TN +GL++C ++A + M  +   GHI +I+   G      P+   Y A+K +V  +T++++ ELR      + V ++SPG+V T++L
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic7.2e-5446.36Show/hide
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        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD VVI SRS E V  ++  L E   E                 V GT CDV + EDVK LV F +  L  IDIWI
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Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PLV  SDED+ ++V+TN +G ++C REA+ +M +Q +GGH+FN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     SL  E R      V VH
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          SPGMV TDLL+SG++ +  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      I +LT
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic5.4e-13483.81Show/hide
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        +R  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAK+FLKAGDNVVICSRSAERVES+V  L++EFGEQHVWG  CDVREG+DVK LV F +  +KYIDIWINNAGSNAY
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Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic1.4e-13781.08Show/hide
Query:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ
        +N  V   SA+++A +  +REPM PPYN+LITGSTKGIGYALA++FLKAGDNVVICSRSAERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LV + Q
Subjt:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ

Query:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR
        KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MM  Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+
Subjt:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR

Query:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED
        MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+N+Y+ E+
Subjt:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED

Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic2.8e-5044Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
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Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +MS Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10310.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein3.4e-1430.69Show/hide
Query:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP
        +V    VLITG +KG+G ALA +  K G  V+ C+RS E++ +    L       H+  T  DV+    V+ +   + +     DI +NNAG+   + K 
Subjt:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP

Query:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL
        + E S ED   V+ TN  G+    R  I +M  + +G  +    G G  G      A Y A+K ++  L++++  E+    V+ + V  L+PG++ T+LL
Subjt:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL

Query:  MS
         S
Subjt:  MS

AT1G24360.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein2.9e-1329.29Show/hide
Query:  VLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEAS
        V+ITG+++GIG A+A    KAG  V++  +RSA+  E   + + E  G+   +G   DV +  DV  ++         ID+ +NNAG    +   L+   
Subjt:  VLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEAS

Query:  DEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL
             EV+  N  G+ +C + A+K+M  + R G I NI       G+ G+     A Y A K  V+  +K+   E      +N+ V+ + PG + +D+
Subjt:  DEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL

AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein2.0e-5144Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +MS Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein7.2e-4943.2Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITG  +G+G ALA++FL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
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Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +MS Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
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Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT5G04900.1 NYC1-like9.8e-13981.08Show/hide
Query:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ
        +N  V   SA+++A +  +REPM PPYN+LITGSTKGIGYALA++FLKAGDNVVICSRSAERVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LV + Q
Subjt:  RNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLKAGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQ

Query:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR
        KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MM  Q RGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+
Subjt:  KNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELR

Query:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED
        MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+N+Y+ E+
Subjt:  MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AAAACTTTCTACCGCGCCAAAATGGCTTCCTCTTCATCTTCTTCCCTCCTCTCTCCGTCTCCGTTCCTCTCCCGGAACCATGGCTTCTTCTTCTCTCATCCTTCCGGCCG
ACGTATATCAATCTGCAAATCGGAGTACAGCTCCAGTCTTCCAGCAGTTCGTTCGCGCCAGATATCCAACATTCCGAGGAATGGCGACGTGAATTCCTATTCTGCATCCA
TAAAGGCCGAATTATTTCAGCAGAGGGAGCCCATGGTTCCTCCTTATAACGTTTTGATCACCGGCTCTACCAAAGGAATAGGATATGCATTGGCTAAACAGTTTCTGAAA
GCAGGTGACAATGTTGTAATCTGTTCACGATCAGCTGAGAGGGTAGAATCTTCTGTTCAAAGCCTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGA
CGTACGAGAAGGAGAGGATGTAAAGAATTTAGTCACATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATACATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGC
CTTTGGTTGAGGCTTCAGATGAGGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTCAAACCAACCTCGA
GGGGGTCATATTTTCAACATTGATGGGGCTGGTTCTGATGGACGACCCACCCCTAGGTTTGCTGCCTATGGGGCAACCAAAAGAAGTGTTGTTCATTTAACGAAGTCATT
ACAGGCGGAATTGCGGATGCAGGATGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAGCAGGCGA
AATTTTTCATCAATGTCTTGGCAGAACCACCTGAAGTGGTCGCAGAATACCTTGTTCCAAACATAAGATCTATCCCAACCAATGGTTCAACAAGGCCCACGTACATTCGT
TTCCTCACTGGACTGAAAGCTTATTCCCAGATATTTTCAAGACTTGCCTTTGGTGCAAGAAGAAACAAATATCTTCTAGAAGAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAACTTTCTACCGCGCCAAAATGGCTTCCTCTTCATCTTCTTCCCTCCTCTCTCCGTCTCCGTTCCTCTCCCGGAACCATGGCTTCTTCTTCTCTCATCCTTCCGGCCG
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TTCCTCACTGGACTGAAAGCTTATTCCCAGATATTTTCAAGACTTGCCTTTGGTGCAAGAAGAAACAAATATCTTCTAGAAGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
KTFYRAKMASSSSSSLLSPSPFLSRNHGFFFSHPSGRRISICKSEYSSSLPAVRSRQISNIPRNGDVNSYSASIKAELFQQREPMVPPYNVLITGSTKGIGYALAKQFLK
AGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVTFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMSNQPR
GGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIR
FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNKYLLED