; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC04g1525 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g1525
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationMC04:23057763..23058320
RNA-Seq ExpressionMC04g1525
SyntenyMC04g1525
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578732.1 hypothetical protein SDJN03_23180, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.59e-9984.41Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL   SNSKPHK K LTFVTRAADPE+PAAD EP SDGDDFE+RLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AA+Y+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]1.78e-9984.49Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKP K K LTF+TRAADPE+PA D E PGSDGDDFE+RLAKVR++YRSGTGKKAEIRKARKS +GST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
         LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]6.47e-125100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.78e-10085.48Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL F SNSKPHK K LTFVTRAADPE+PAAD EP SDGDDFE+RLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AA+Y+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]1.24e-10086.02Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL     + P K K LTFVTRAADPE+PAAD E GSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA    SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein8.61e-10084.49Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKP K K LTF+TRAADPE+PA D E PGSDGDDFE+RLAKVR++YRSGTGKKAEIRKARKS +GST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPE-PGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
         LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016674.08e-9882.89Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSK HK + LTF+TRAADPE TP+   +PGSDGDDFE+RLAKVR +YRSGTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        PLKE VSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAV AVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein1.00e-9883.42Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSK HK + LTF+TRAADPE TP+   +PGSDGDDFE+RLAKVR +YRSGTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPE-TPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        PLKE VSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAAVY+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061193.13e-125100Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

A0A6J1FK14 uncharacterized protein LOC1114447343.81e-9883.87Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL    NSKPHK K LTFVTRAADPE+PAAD EP SDGDDFE+RLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS KGST  A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AA+Y+K+EKEKVSVWP +E+K+
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein4.6e-4757.87Show/hide
Query:  FPNSLPFPSNSKPHKTKPLTF------VTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVPLKEA
        FP SL F    KP+  +  T        T    P+      E G+D D FE+RL+ +RL+YRSGTGKKAE+RK++K + GS   + G+ +YLPPV LKEA
Subjt:  FPNSLPFPSNSKPHKTKPLTF------VTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVPLKEA

Query:  VSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPE
        VSGGLKVE GFSPFSERING IA LG++AL+LVELATGK V+NYHTP+++ +Q+YFVAAV+A++VK EKEKVSVWP +
Subjt:  VSGGLKVEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCGATTCCATCTTCCTCCCTGCAATTCCCAAACTCTCTCCCATTCCCTTCCAATTCGAAGCCTCACAAGACGAAGCCCCTCACCTTCGTAACTCGTGCAGCAGA
TCCGGAAACCCCTGCCGCCGATCCAGAGCCGGGATCGGACGGCGACGATTTCGAGAACCGCCTCGCCAAGGTCCGGCTAAAGTACCGGAGCGGAACGGGGAAGAAGGCGG
AGATACGGAAGGCGCGGAAGTCCAATAAAGGATCCACCGCCGGCGCCGGCGGCTCATCGGTGTACCTCCCGCCGGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGCCTTAAA
GTGGAATTCGGCTTCAGTCCGTTCAGCGAGAGGATAAATGGATGGATTGCGATCCTCGGAATCTCGGCTCTGGTGCTGGTGGAACTGGCTACCGGAAAAGGCGTCATAAA
TTACCACACGCCGGCGATAATTCTGATTCAGGTGTACTTCGTAGCGGCGGTTGCTGCTGTGTATGTTAAATTCGAGAAGGAGAAGGTTAGTGTTTGGCCGCCGGAGGAAG
TGAAAAAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGCGATTCCATCTTCCTCCCTGCAATTCCCAAACTCTCTCCCATTCCCTTCCAATTCGAAGCCTCACAAGACGAAGCCCCTCACCTTCGTAACTCGTGCAGCAGA
TCCGGAAACCCCTGCCGCCGATCCAGAGCCGGGATCGGACGGCGACGATTTCGAGAACCGCCTCGCCAAGGTCCGGCTAAAGTACCGGAGCGGAACGGGGAAGAAGGCGG
AGATACGGAAGGCGCGGAAGTCCAATAAAGGATCCACCGCCGGCGCCGGCGGCTCATCGGTGTACCTCCCGCCGGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGCCTTAAA
GTGGAATTCGGCTTCAGTCCGTTCAGCGAGAGGATAAATGGATGGATTGCGATCCTCGGAATCTCGGCTCTGGTGCTGGTGGAACTGGCTACCGGAAAAGGCGTCATAAA
TTACCACACGCCGGCGATAATTCTGATTCAGGTGTACTTCGTAGCGGCGGTTGCTGCTGTGTATGTTAAATTCGAGAAGGAGAAGGTTAGTGTTTGGCCGCCGGAGGAAG
TGAAAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLPFPSNSKPHKTKPLTFVTRAADPETPAADPEPGSDGDDFENRLAKVRLKYRSGTGKKAEIRKARKSNKGSTAGAGGSSVYLPPVPLKEAVSGGLK
VEFGFSPFSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAAVYVKFEKEKVSVWPPEEVKN