; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC04g1542 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g1542
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description40S ribosomal protein S15a
Genome locationMC04:23256184..23257036
RNA-Seq ExpressionMC04g1542
SyntenyMC04g1542
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000630 - Ribosomal protein S8
IPR035987 - Ribosomal protein S8 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB3454343.1 unnamed protein product [Digitaria exilis]9.52e-8997.73Show/hide
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KAF5467254.1 hypothetical protein F2P56_017099, partial [Juglans regia]7.75e-8999.24Show/hide
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TKY71201.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Spatholobus suberectus]5.16e-8998.48Show/hide
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XP_022134546.1 40S ribosomal protein S15a-1 [Momordica charantia]4.78e-89100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1U8NNK5 40S ribosomal protein S15a-16.64e-8999.23Show/hide
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A0A6J1BY30 40S ribosomal protein S15a-12.32e-89100Show/hide
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A0A6J1FJB0 40S ribosomal protein S15a-12.32e-89100Show/hide
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A0A6J1I5M1 40S ribosomal protein S15a-1-like6.64e-8998.46Show/hide
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A0A6J1JX40 40S ribosomal protein S15a-12.32e-89100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80646 40S ribosomal protein S15a-32.8e-6490.77Show/hide
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P42798 40S ribosomal protein S15a-11.3e-6997.69Show/hide
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Q9AT34 40S ribosomal protein S15a3.2e-6896.15Show/hide
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Q9LX88 40S ribosomal protein S15a-41.7e-6997.69Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07770.1 ribosomal protein S15A9.4e-7197.69Show/hide
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AT1G07770.2 ribosomal protein S15A9.4e-7197.69Show/hide
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AT2G39590.1 Ribosomal protein S8 family protein2.0e-6590.77Show/hide
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AT3G46040.1 ribosomal protein S15A D1.2e-7097.69Show/hide
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AT5G59850.1 Ribosomal protein S8 family protein9.4e-7197.69Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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