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MC04g1698 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g1698
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionmini zinc finger protein 2-like
Genome locationMC04:24466624..24466854
RNA-Seq ExpressionMC04g1698
SyntenyMC04g1698
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148693.1 mini zinc finger protein 2 [Cucumis sativus]4.18e-4592.11Show/hide
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]1.16e-4593.42Show/hide
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XP_022134197.1 mini zinc finger protein 2-like [Momordica charantia]1.04e-50100Show/hide
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XP_022989831.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita maxima]6.86e-4389.47Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]3.88e-4490.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor2.02e-4592.11Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 25.60e-4693.42Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 25.60e-4693.42Show/hide
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A0A6J1BYZ4 mini zinc finger protein 2-like5.01e-51100Show/hide
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A0A6J1JL94 mini zinc finger protein 2-like3.32e-4389.47Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 13.0e-2171.88Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 35.4e-2370.67Show/hide
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Q2RB28 Mini zinc finger protein 13.0e-2171.88Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 17.5e-2568Show/hide
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        ++++SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT   L CAACGCHRNFHR++V TEVVC+ S P
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 27.8e-3078.95Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14440.1 homeobox protein 312.7e-1756.25Show/hide
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AT1G18835.1 mini zinc finger3.8e-2470.67Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 15.4e-2668Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 25.5e-3178.95Show/hide
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AT3G50890.1 homeobox protein 281.2e-1765.45Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCAAGAAACACAGCGGCTTCATCCTTCACAGTGAGGAGTGTTAGATACGGGGAGTGCCAGAAGAATCATGCCGCCGGGGTCGGAGGGTACGCCGTGGACGGGTGCCGAGA
ATTCATGGCGAGCGGTGATGAAGGGACGAGCGGCGAGCTGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCGGAACTTCCATAGACGACAGGTCGGAACCGAGGTAGTTTGTGATT
GCTCTTCACCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCAAGAAACACAGCGGCTTCATCCTTCACAGTGAGGAGTGTTAGATACGGGGAGTGCCAGAAGAATCATGCCGCCGGGGTCGGAGGGTACGCCGTGGACGGGTGCCGAGA
ATTCATGGCGAGCGGTGATGAAGGGACGAGCGGCGAGCTGACTTGCGCCGCCTGCGGTTGCCACCGGAACTTCCATAGACGACAGGTCGGAACCGAGGTAGTTTGTGATT
GCTCTTCACCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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