; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC04g1906 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC04g1906
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationMC04:26070028..26072324
RNA-Seq ExpressionMC04g1906
SyntenyMC04g1906
Gene Ontology termsGO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133545.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]3.44e-147100Show/hide
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XP_022133546.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]3.56e-14197.71Show/hide
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XP_022955559.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita moschata]2.75e-13089.91Show/hide
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XP_023552471.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.91e-13090.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BVE7 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X21.72e-14197.71Show/hide
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A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X11.66e-147100Show/hide
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A0A6J1GU31 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X15.41e-13089.45Show/hide
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A0A6J1GWM1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X21.33e-13089.91Show/hide
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A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X21.27e-12889.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr321.3e-1342.86Show/hide
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        + + LC  ADGVNP TG +TR++L C
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O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic4.4e-7872.44Show/hide
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Q8H1Q1 Thylakoid lumenal protein TL20.3, chloroplastic2.6e-0930.96Show/hide
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Q8Z4G9 Secreted effector protein PipB27.7e-0635.51Show/hide
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        +  A   +  KG    GA +T       DLSG D  G  L   D        ANFKGA L GAS  D++LT A L D+ + GA    AN+T ANL     
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                  S AN++ A  +G+T  R    G+T++GA
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Q9SE95 FH protein interacting protein FIP21.8e-0737.84Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ ++ A  
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          V LRE   E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.1 Pentapeptide repeat-containing protein1.8e-1030.96Show/hide
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        +++ S N       SA   T+  +LSA+  +A   +A   G P  A +      TRG+            DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+
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           GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+ IEGADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR +L C
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AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein5.3e-1032.93Show/hide
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        AS +   A+   + F AD    F  G     G     DLS    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + 
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        +ANL+NA L  ++ T  +   G+ IEGADF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR +L C
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AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein6.8e-5868.62Show/hide
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        GKDFSG+TLI+QDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA
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AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein3.1e-7972.44Show/hide
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         YLCKVADGVN TTGNATRDTLLCN
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AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein1.3e-0837.84Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ ++ A  
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          V LRE   E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCGTCACTTAAAAAAACCAAAGGTAAAATATTGGGTTGGATTAGTTTTGCAACACGTGGCGGAACCCAAGTGGAGAAAGGACCAGAAGAAAGATGTAAGCGGGTGCATAG
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