; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC05g0286 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC05g0286
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationMC05:2096132..2097745
RNA-Seq ExpressionMC05g0286
SyntenyMC05g0286
Gene Ontology termsGO:0016556 - mRNA modification (biological process)
GO:1900865 - chloroplast RNA modification (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004133915.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic [Cucumis sativus]0.086.22Show/hide
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XP_022146972.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic [Momordica charantia]0.0100Show/hide
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XP_038877671.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic [Benincasa hispida]0.089.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4E1 Uncharacterized protein0.086.22Show/hide
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A0A1S3AWC2 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic0.086.41Show/hide
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A0A5A7TZK8 Pentatricopeptide repeat-containing protein0.086.41Show/hide
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A0A6J1D128 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic0.0100Show/hide
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A0A6J1ID28 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic0.087.71Show/hide
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        TK+PG SWIEL+GVVHEFLVHDKSHP VTEIY VLDG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22137 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350, chloroplastic8.5e-20865Show/hide
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        +DSVSYNSMIDGYVK G++ SARELFD MP+E KNLISWNSMI G+AQT DGV+ A +LF  MPE+DL+SWN++I G+ K GRIE A  LF+ MPRRDV+
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        +W+ +IDGYAKLG +  A+ LFD+MP +DVVA N+MMAGYVQN Y  +AL+IF+ M+ +S+L PD TTLVI L A++QLGR+ KA  +H Y++E  F L 
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        GK+GVALIDMYSKCGSI +AM +FEGIE K IDHWNAMI G+A +GLGESAFDML+++++LS+KPDDITF+GVLNAC+H+GLVKEG++CFELMR+ HK+E
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        P+LQHYGCMVDIL ++G IE A   IEEMP+EPND+IWRT L+AC +H+ F  GE +A+HL+     N SSYVLLSN+YA  G+W    +VRTMMK+R +
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         K+PG SWIEL+G VHEF V
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O82380 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g29760, chloroplastic1.1e-11438.59Show/hide
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        F WN +I++Y+ G DP+ ++  F  M+ E+    +K++F  ++KA A V  +  G+ +HG+ +K  +GS++F+ N LI  Y  CGD++ A +VF  +  +
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        D VS+NSMI+G+V+ G  D A ELF  M  ED       ++   S        E G +    + E     +L   N ++  + KCG IE A  LF+ M  
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        +D ++W+ ++DGYA   + E AR + + MP+KD+VA NA+++ Y QNG   +AL +F+ +Q Q N+  ++ TLV  LSA +Q+G ++    IHSY+ ++G
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          +   V  ALI MYSKCG +  +  +F  +E++ +  W+AMI G+A +G G  A DM  +MQ+ +VKP+ +TF  V  AC+H GLV E    F  M   
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        + + P+ +HY C+VD+LG++G +E A+KFIE MPI P+  +W  LL AC+ H N  + E     L+ L+  N  ++VLLSNIYA LG W   S++R  M+
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           L K PG S IE++G++HEFL  D +HP   ++Y  L
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Q9LN01 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g08070, chloroplastic2.2e-11538.86Show/hide
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        +WN + + ++  +DP+ AL L+  M+  G   + ++F  +LK+CA+    ++G+QIHG ++KL    +L++   LI+MY++ G +E A +VFD+ P +D 
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        VSY ++I GY   G +++A++LFD +P++D  ++SWN+MI G+A+T +  E ALELF+ M +     D  +  TV+   A+ G IE    +   +     
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Query:  IS----WSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIE-
         S     + LID Y+K G +E A  LF+ +P KDV++ N ++ GY       +AL +F  M  +S  +P+  T++  L A + LG ID    IH Y+ + 
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          G +    +  +LIDMY+KCG I  A  +F  I  K +  WNAMI G A +G  +++FD+   M+K+ ++PDDITF+G+L+AC+H+G++  G   F  M
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Query:  RKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRT
         + +K+ PKL+HYGCM+D+LG +GL + A + I  M +EP+ +IW +LL AC+ H N  +GES A +L++++  N  SYVLLSNIYA  G W+  +K R 
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Query:  MMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLD
        ++  + + KVPG S IE++ VVHEF++ DK HP   EIY +L+
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Q9SJZ3 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g22410, mitochondrial6.5e-10738.24Show/hide
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        F WN  I+ +S   +P  + +L+  ML +G      D F++ ++ K CA + L   G  I G ++KL +     + N  I M+  CGD+E AR+VFD  P
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Query:  RQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDK--------NLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLF
         +D VS+N +I+GY K G  + A  ++  M  E           L+S  SM+G   + ++  E+  E   +M    +   N ++  F+KCG I  A  +F
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Query:  NQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSY
        + + +R ++SW+ +I GYA+ G ++V+R LFD+M EKDVV  NAM+ G VQ      AL +F  MQ+ SN  PD+ T++  LSA SQLG +D    IH Y
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Query:  LIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFE
        + +   SL   +G +L+DMY+KCG+I+ A+S+F GI+ +    + A+I G+A +G   +A     EM    + PD+ITFIG+L+AC H G+++ G   F 
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Query:  LMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKV
         M+    L P+L+HY  MVD+LG+AGL+E A + +E MP+E +  +W  LL  C+ H N  +GE  A+ L+ LD  +S  YVLL  +Y    +W  A + 
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Query:  RTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL
        R MM +R + K+PG S IE+ G+V EF+V DKS P   +IY  L
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Q9SY02 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g027505.0e-10738.76Show/hide
Query:  WNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSV
        WN ++  Y+       A  +F  M E     +  S++ +L A  +   +E+      +L K      L   NCL+  +++   I  ARQ FD M  +D V
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Query:  SYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSN
        S+N++I GY +SG +D AR+LFD  P++D  + +W +M+ G+ Q    VE A ELF+KMPER+ VSWN ++ G+ +  R+E A  LF+ MP R+V +W+ 
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Query:  LIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENGFSLMGKVG
        +I GYA+ G I  A+NLFD+MP++D V+  AM+AGY Q+G+  +AL++F  M+ +     ++++   ALS  + +  ++    +H  L++ G+     VG
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Query:  VALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKVHKLEPKLQ
         AL+ MY KCGSI  A  +F+ +  K I  WN MI+G +R+G GE A      M++  +KPDD T + VL+AC+H GLV +G   F  M + + + P  Q
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Query:  HYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVP
        HY CMVD+LG+AGL+E A   ++ MP EP+  IW TLL A + H N  + E+ A  +  ++  NS  YVLLSN+YA  G W    K+R  M+ + + KVP
Subjt:  HYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVP

Query:  GRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL
        G SWIE++   H F V D+ HP   EI++ L+ L
Subjt:  GRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08070.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.6e-11638.86Show/hide
Query:  LWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDS
        +WN + + ++  +DP+ AL L+  M+  G   + ++F  +LK+CA+    ++G+QIHG ++KL    +L++   LI+MY++ G +E A +VFD+ P +D 
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Query:  VSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPER----DLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDV
        VSY ++I GY   G +++A++LFD +P++D  ++SWN+MI G+A+T +  E ALELF+ M +     D  +  TV+   A+ G IE    +   +     
Subjt:  VSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPER----DLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDV

Query:  IS----WSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIE-
         S     + LID Y+K G +E A  LF+ +P KDV++ N ++ GY       +AL +F  M  +S  +P+  T++  L A + LG ID    IH Y+ + 
Subjt:  IS----WSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIE-

Query:  -NGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELM
          G +    +  +LIDMY+KCG I  A  +F  I  K +  WNAMI G A +G  +++FD+   M+K+ ++PDDITF+G+L+AC+H+G++  G   F  M
Subjt:  -NGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELM

Query:  RKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRT
         + +K+ PKL+HYGCM+D+LG +GL + A + I  M +EP+ +IW +LL AC+ H N  +GES A +L++++  N  SYVLLSNIYA  G W+  +K R 
Subjt:  RKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRT

Query:  MMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLD
        ++  + + KVPG S IE++ VVHEF++ DK HP   EIY +L+
Subjt:  MMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLD

AT2G22410.1 SLOW GROWTH 14.6e-10838.24Show/hide
Query:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENG---FSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMP
        F WN  I+ +S   +P  + +L+  ML +G      D F++ ++ K CA + L   G  I G ++KL +     + N  I M+  CGD+E AR+VFD  P
Subjt:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENG---FSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMP

Query:  RQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDK--------NLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLF
         +D VS+N +I+GY K G  + A  ++  M  E           L+S  SM+G   + ++  E+  E   +M    +   N ++  F+KCG I  A  +F
Subjt:  RQDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDK--------NLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLF

Query:  NQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSY
        + + +R ++SW+ +I GYA+ G ++V+R LFD+M EKDVV  NAM+ G VQ      AL +F  MQ+ SN  PD+ T++  LSA SQLG +D    IH Y
Subjt:  NQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSY

Query:  LIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFE
        + +   SL   +G +L+DMY+KCG+I+ A+S+F GI+ +    + A+I G+A +G   +A     EM    + PD+ITFIG+L+AC H G+++ G   F 
Subjt:  LIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFE

Query:  LMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKV
         M+    L P+L+HY  MVD+LG+AGL+E A + +E MP+E +  +W  LL  C+ H N  +GE  A+ L+ LD  +S  YVLL  +Y    +W  A + 
Subjt:  LMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKV

Query:  RTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL
        R MM +R + K+PG S IE+ G+V EF+V DKS P   +IY  L
Subjt:  RTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL

AT2G29760.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein7.8e-11638.59Show/hide
Query:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFC-MMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQ
        F WN +I++Y+ G DP+ ++  F  M+ E+    +K++F  ++KA A V  +  G+ +HG+ +K  +GS++F+ N LI  Y  CGD++ A +VF  +  +
Subjt:  FLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFC-MMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQ

Query:  DSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLED-----KNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPR
        D VS+NSMI+G+V+ G  D A ELF  M  ED       ++   S        E G +    + E     +L   N ++  + KCG IE A  LF+ M  
Subjt:  DSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLED-----KNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPR

Query:  RDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENG
        +D ++W+ ++DGYA   + E AR + + MP+KD+VA NA+++ Y QNG   +AL +F+ +Q Q N+  ++ TLV  LSA +Q+G ++    IHSY+ ++G
Subjt:  RDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENG

Query:  FSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKV
          +   V  ALI MYSKCG +  +  +F  +E++ +  W+AMI G+A +G G  A DM  +MQ+ +VKP+ +TF  V  AC+H GLV E    F  M   
Subjt:  FSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKV

Query:  HKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMK
        + + P+ +HY C+VD+LG++G +E A+KFIE MPI P+  +W  LL AC+ H N  + E     L+ L+  N  ++VLLSNIYA LG W   S++R  M+
Subjt:  HKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMK

Query:  KRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL
           L K PG S IE++G++HEFL  D +HP   ++Y  L
Subjt:  KRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVL

AT2G45350.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein6.0e-20965Show/hide
Query:  DPFLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPR
        DPFLWNAVIKS+SHG DP +AL+L C+MLENG SVDKFS SL+LKAC+R+  V+ G QIHG L K  + S+LFL NCLI +YL+CG +  +RQ+FDRMP+
Subjt:  DPFLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPR

Query:  QDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVI
        +DSVSYNSMIDGYVK G++ SARELFD MP+E KNLISWNSMI G+AQT DGV+ A +LF  MPE+DL+SWN++I G+ K GRIE A  LF+ MPRRDV+
Subjt:  QDSVSYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVI

Query:  SWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENGFSLM
        +W+ +IDGYAKLG +  A+ LFD+MP +DVVA N+MMAGYVQN Y  +AL+IF+ M+ +S+L PD TTLVI L A++QLGR+ KA  +H Y++E  F L 
Subjt:  SWSNLIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENGFSLM

Query:  GKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKVHKLE
        GK+GVALIDMYSKCGSI +AM +FEGIE K IDHWNAMI G+A +GLGESAFDML+++++LS+KPDDITF+GVLNAC+H+GLVKEG++CFELMR+ HK+E
Subjt:  GKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKVHKLE

Query:  PKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNL
        P+LQHYGCMVDIL ++G IE A   IEEMP+EPND+IWRT L+AC +H+ F  GE +A+HL+     N SSYVLLSN+YA  G+W    +VRTMMK+R +
Subjt:  PKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNL

Query:  TKVPGRSWIELEGVVHEFLV
         K+PG SWIEL+G VHEF V
Subjt:  TKVPGRSWIELEGVVHEFLV

AT4G02750.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein3.5e-10838.76Show/hide
Query:  WNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSV
        WN ++  Y+       A  +F  M E     +  S++ +L A  +   +E+      +L K      L   NCL+  +++   I  ARQ FD M  +D V
Subjt:  WNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSV

Query:  SYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSN
        S+N++I GY +SG +D AR+LFD  P++D  + +W +M+ G+ Q    VE A ELF+KMPER+ VSWN ++ G+ +  R+E A  LF+ MP R+V +W+ 
Subjt:  SYNSMIDGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSN

Query:  LIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENGFSLMGKVG
        +I GYA+ G I  A+NLFD+MP++D V+  AM+AGY Q+G+  +AL++F  M+ +     ++++   ALS  + +  ++    +H  L++ G+     VG
Subjt:  LIDGYAKLGNIEVARNLFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENGFSLMGKVG

Query:  VALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKVHKLEPKLQ
         AL+ MY KCGSI  A  +F+ +  K I  WN MI+G +R+G GE A      M++  +KPDD T + VL+AC+H GLV +G   F  M + + + P  Q
Subjt:  VALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEKGIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKVHKLEPKLQ

Query:  HYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVP
        HY CMVD+LG+AGL+E A   ++ MP EP+  IW TLL A + H N  + E+ A  +  ++  NS  YVLLSN+YA  G W    K+R  M+ + + KVP
Subjt:  HYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRTLLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVP

Query:  GRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL
        G SWIE++   H F V D+ HP   EI++ L+ L
Subjt:  GRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GACCCGTTTCTCTGGAATGCTGTGATCAAATCGTATTCACACGGGAATGACCCCATTCGAGCTCTGGTATTATTCTGTATGATGCTTGAAAATGGATTTTCTGTCGATAA
GTTCTCGTTTTCTTTGATTCTTAAAGCCTGTGCTCGAGTGTGTTTGGTGGAGCAAGGGAAGCAGATTCATGGGTTGTTGATGAAGTTAGAAATTGGGTCGAATTTGTTTC
TGCTTAATTGTTTGATTACTATGTATTTACGGTGCGGGGATATTGAGTTTGCACGGCAAGTGTTCGACAGAATGCCGAGGCAGGACTCTGTTTCGTATAATTCGATGATT
GATGGTTATGTTAAGTCTGGGATGGTCGATTCGGCTCGTGAATTGTTCGATTCTATGCCATTGGAGGATAAGAATTTGATCTCTTGGAACTCGATGATTGGTGGGTTTGC
TCAAACAGAAGACGGTGTGGAGTTTGCATTGGAACTGTTTGAGAAAATGCCTGAGAGAGATTTGGTTTCTTGGAACACGGTAATTGGTGGTTTTGCTAAATGTGGGCGCA
TAGAATTTGCTCATAGCTTGTTCAATCAAATGCCGAGAAGAGATGTAATCAGTTGGTCTAATTTGATTGATGGTTATGCCAAACTGGGTAATATCGAGGTTGCGAGGAAC
CTGTTTGATGAAATGCCTGAGAAAGATGTGGTTGCTTGTAATGCAATGATGGCTGGCTATGTGCAAAATGGTTATTGCACAAAAGCTTTAAAAATATTTAATATGATGCA
AAGCCAAAGCAACTTATCTCCTGATAAAACGACGTTGGTGATCGCGTTGTCTGCTGTTTCTCAGTTAGGACGCATTGACAAGGCTGCGAGTATACATAGTTATTTGATTG
AAAATGGCTTTTCTTTGATGGGTAAGGTTGGTGTTGCTCTCATTGACATGTATTCTAAATGCGGTAGTATCAATAATGCCATGTCAATATTCGAAGGCATCGAAGAAAAG
GGTATCGACCATTGGAATGCCATGATTAGTGGAATGGCAAGAAATGGTCTGGGTGAGTCGGCTTTTGATATGCTCGTGGAGATGCAGAAGCTTTCAGTGAAACCAGACGA
TATCACTTTCATCGGTGTGTTGAATGCATGTGCGCATGCCGGGTTGGTGAAAGAAGGGATGATTTGTTTCGAGTTGATGAGAAAAGTTCATAAGTTAGAGCCAAAGCTAC
AGCATTATGGATGCATGGTGGACATCCTTGGCAAAGCAGGGCTTATAGAAGGAGCATTGAAATTCATTGAAGAAATGCCCATTGAGCCCAATGATATCATATGGAGGACT
TTGCTTAGTGCTTGCCAAAACCATGAGAACTTTGCCATTGGAGAATCCATTGCTAGACATCTTATGAGGTTGGATTCTTGTAACTCGAGTTCTTATGTTCTTCTTTCGAA
TATCTACGCCGGTCTCGGCCTGTGGAGTGCGGCGAGCAAGGTACGAACAATGATGAAGAAGAGGAATTTAACGAAAGTTCCTGGGCGCAGTTGGATTGAACTTGAGGGAG
TTGTTCATGAGTTCTTGGTGCATGATAAATCCCATCCACATGTTACTGAAATATATTCTGTGTTGGATGGTTTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GACCCGTTTCTCTGGAATGCTGTGATCAAATCGTATTCACACGGGAATGACCCCATTCGAGCTCTGGTATTATTCTGTATGATGCTTGAAAATGGATTTTCTGTCGATAA
GTTCTCGTTTTCTTTGATTCTTAAAGCCTGTGCTCGAGTGTGTTTGGTGGAGCAAGGGAAGCAGATTCATGGGTTGTTGATGAAGTTAGAAATTGGGTCGAATTTGTTTC
TGCTTAATTGTTTGATTACTATGTATTTACGGTGCGGGGATATTGAGTTTGCACGGCAAGTGTTCGACAGAATGCCGAGGCAGGACTCTGTTTCGTATAATTCGATGATT
GATGGTTATGTTAAGTCTGGGATGGTCGATTCGGCTCGTGAATTGTTCGATTCTATGCCATTGGAGGATAAGAATTTGATCTCTTGGAACTCGATGATTGGTGGGTTTGC
TCAAACAGAAGACGGTGTGGAGTTTGCATTGGAACTGTTTGAGAAAATGCCTGAGAGAGATTTGGTTTCTTGGAACACGGTAATTGGTGGTTTTGCTAAATGTGGGCGCA
TAGAATTTGCTCATAGCTTGTTCAATCAAATGCCGAGAAGAGATGTAATCAGTTGGTCTAATTTGATTGATGGTTATGCCAAACTGGGTAATATCGAGGTTGCGAGGAAC
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AAGCCAAAGCAACTTATCTCCTGATAAAACGACGTTGGTGATCGCGTTGTCTGCTGTTTCTCAGTTAGGACGCATTGACAAGGCTGCGAGTATACATAGTTATTTGATTG
AAAATGGCTTTTCTTTGATGGGTAAGGTTGGTGTTGCTCTCATTGACATGTATTCTAAATGCGGTAGTATCAATAATGCCATGTCAATATTCGAAGGCATCGAAGAAAAG
GGTATCGACCATTGGAATGCCATGATTAGTGGAATGGCAAGAAATGGTCTGGGTGAGTCGGCTTTTGATATGCTCGTGGAGATGCAGAAGCTTTCAGTGAAACCAGACGA
TATCACTTTCATCGGTGTGTTGAATGCATGTGCGCATGCCGGGTTGGTGAAAGAAGGGATGATTTGTTTCGAGTTGATGAGAAAAGTTCATAAGTTAGAGCCAAAGCTAC
AGCATTATGGATGCATGGTGGACATCCTTGGCAAAGCAGGGCTTATAGAAGGAGCATTGAAATTCATTGAAGAAATGCCCATTGAGCCCAATGATATCATATGGAGGACT
TTGCTTAGTGCTTGCCAAAACCATGAGAACTTTGCCATTGGAGAATCCATTGCTAGACATCTTATGAGGTTGGATTCTTGTAACTCGAGTTCTTATGTTCTTCTTTCGAA
TATCTACGCCGGTCTCGGCCTGTGGAGTGCGGCGAGCAAGGTACGAACAATGATGAAGAAGAGGAATTTAACGAAAGTTCCTGGGCGCAGTTGGATTGAACTTGAGGGAG
TTGTTCATGAGTTCTTGGTGCATGATAAATCCCATCCACATGTTACTGAAATATATTCTGTGTTGGATGGTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
DPFLWNAVIKSYSHGNDPIRALVLFCMMLENGFSVDKFSFSLILKACARVCLVEQGKQIHGLLMKLEIGSNLFLLNCLITMYLRCGDIEFARQVFDRMPRQDSVSYNSMI
DGYVKSGMVDSARELFDSMPLEDKNLISWNSMIGGFAQTEDGVEFALELFEKMPERDLVSWNTVIGGFAKCGRIEFAHSLFNQMPRRDVISWSNLIDGYAKLGNIEVARN
LFDEMPEKDVVACNAMMAGYVQNGYCTKALKIFNMMQSQSNLSPDKTTLVIALSAVSQLGRIDKAASIHSYLIENGFSLMGKVGVALIDMYSKCGSINNAMSIFEGIEEK
GIDHWNAMISGMARNGLGESAFDMLVEMQKLSVKPDDITFIGVLNACAHAGLVKEGMICFELMRKVHKLEPKLQHYGCMVDILGKAGLIEGALKFIEEMPIEPNDIIWRT
LLSACQNHENFAIGESIARHLMRLDSCNSSSYVLLSNIYAGLGLWSAASKVRTMMKKRNLTKVPGRSWIELEGVVHEFLVHDKSHPHVTEIYSVLDGL