| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004134179.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis sativus] | 1.53e-149 | 93.55 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRR RSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
RRDYSRSP+PK+NGRSPREVD RSRSRS + DSRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| XP_008438778.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucumis melo] | 2.65e-150 | 93.55 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
R+DYSRSP+PK+NGRSPREVD RSRSRS + DSRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| XP_022137875.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Momordica charantia] | 1.20e-162 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| XP_022979912.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 3.09e-149 | 93.95 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSISRS SP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
RRDYSRSP+PKENGRSPR VDI RSRSRS RA SRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| XP_038878233.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Benincasa hispida] | 3.35e-151 | 94.35 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
M RYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKR+DDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGAR+EYLSPARSRSISRSRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
RRDYSRSP+PKENGRSPREVD RSRSRS RADSRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.28e-150 | 93.55 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
R+DYSRSP+PK+NGRSPREVD RSRSRS + DSRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 5.30e-148 | 93.47 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSIS SRSP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSY
R+DYSRSP+PK+NGRSPREVD RSRSRS + DSRSPSGSRS+SY
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSY
|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 5.81e-163 | 100 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 2.48e-148 | 93.15 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MA+YRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSISRS SP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
RRDYSRSP+PKENGRSPR VD RSRSRS RA SRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.50e-149 | 93.95 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDRY ESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRS RRRSPARSPRRRY SYSRSPSPARHDSR+RGARDEYLSPARSRSISRS SP D
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
RRDYSRSP+PKENGRSPR VDI RSRSRS RA SRSPSGSRS+SYSPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 9.1e-64 | 63.37 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR+ R++ Y RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
Query: SPHDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ERSRSRSL
P + R+Y N RSPRE + RSRSRSL
Subjt: SPHDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ERSRSRSL
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 2.4e-32 | 45.63 | Show/hide |
Query: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
YSP RR RGR PR Y RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G+PRGF FV+F A DA EA++
Subjt: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQ
Query: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS------------RSSGRSYRRR-SPARSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRS
+N GREI +V A E+RK P+EMRV + RS GRS R S +RSPRR RYRS S SP+P R RG DE S
Subjt: LNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTS------------RSSGRSYRRR-SPARSPRR------RYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRS
Query: ISRSRSPHDRRDYSRSPSPKENG----RSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQS--YSPR
RS SP + +P NG R + E R R RA SRSPSGSRS+S SPR
Subjt: ISRSRSPHDRRDYSRSPSPKENG----RSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQS--YSPR
|
|
| Q8WXF0 Serine/arginine-rich splicing factor 12 | 3.6e-20 | 40.2 | Show/hide |
Query: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSR--SSG
P + L +RN+ RPEDLR F R+GP+ DVY+P ++YT PRGF +V+F DA +A LN + GR+I I FA+ +RKTP +M+ R S
Subjt: PAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSR--SSG
Query: RSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQS
+RR +RSP +R R+ SRS S RNR R + L +R R S S+S + R + R+PR R RSRS RS S +SQS
Subjt: RSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQS
Query: YSPR
SP+
Subjt: YSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 2.3e-38 | 49.59 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P SPPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHDRR--
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R R+R Y SP R SRS SP DRR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHDRR--
Query: -DYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSP
+ S S SP NG R R +S S R+ RS S +++SY+P
Subjt: -DYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSP
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 3.3e-37 | 47.1 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SR+R +Y SP R RS SP +
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD-----
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRAD-----------SRSPSGSRSQSYSPR
RR YSRSP+ +G R + R +SRSL SRSPS R++S SPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRAD-----------SRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.3e-38 | 47.1 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SR+R +Y SP R RS SP +
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD-----
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRAD-----------SRSPSGSRSQSYSPR
RR YSRSP+ +G R + R +SRSL SRSPS R++S SPR
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRAD-----------SRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 5.7e-37 | 48.7 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
R RSY+P SPPRG R P R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGFV+F DAA+
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDAAE
Query: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD-----
AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GR RRR+P RY S SRSP P R SR+R +Y SP R RS SP +
Subjt: AKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR-SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHD-----
Query: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSL
RR YSRSP+ +G R + R +SRSL
Subjt: RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSL
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 5.3e-35 | 44.44 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
R RSY+P SPPRG R P R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG +PRGFG
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTG------------EPRGFG
Query: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISR
FV+F DAA+AK ++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R G +R R R RY S SRSP P R SR+R +Y SP R R
Subjt: FVKFRFAEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISR
Query: SRSPHD-----RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRAD-----------SRSPSGSRSQSYSPR
S SP + RR YSRSP+ +G R + R +SRSL SRSPS R++S SPR
Subjt: SRSPHD-----RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRAD-----------SRSPSGSRSQSYSPR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.6e-39 | 49.59 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
R RSY+P SPPR GR+ PR R+ SR S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG+PRGFGF++F DA
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPR--GRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRFAEDA
Query: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHDRR--
AEAK Q++ ++ GRE+ +VFAEENRK P EMR R GRS R + RSP R YSRSP P R R+R Y SP R SRS SP DRR
Subjt: AEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGRSYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDEYLSPARSRSISRSRSPHDRR--
Query: -DYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSP
+ S S SP NG R R +S S R+ RS S +++SY+P
Subjt: -DYSRSPSPKENGRSPREVDIERSRSRSLRADSRSPSGSRSQSYSP
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 6.5e-65 | 63.37 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R E S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTGEPRGFGFVK+R+
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRYHESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRTPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRF
Query: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
AEDAAEA +++NH VIGGREI IVFAEENRKTPQEMR T+ +SGR Y+R S RSPRRRYRS+SRS SP R +SR+ R++ Y RSRSISRS
Subjt: AEDAAEAKQQLNHTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRVTSRSSGR--SYRRRSPARSPRRRYRSYSRSPSPARHDSRNRGARDE--YLSPARSRSISRSR
Query: SPHDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ERSRSRSL
P + R+Y N RSPRE + RSRSRSL
Subjt: SPHDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ERSRSRSL
|
|
