; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC05g0659 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC05g0659
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionleucine-rich repeat extensin-like protein 3
Genome locationMC05:5054258..5054785
RNA-Seq ExpressionMC05g0659
SyntenyMC05g0659
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6582188.1 hypothetical protein SDJN03_22190, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.66e-8076.4Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L AVLL FPA   SL   DRRT AGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSGTYYY  PPPP+QPT
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPP G  G  GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA  LT + ACSV T  LF  LLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF

KGN57146.1 hypothetical protein Csa_010613 [Cucumis sativus]4.09e-8277.65Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        ME   PL+FL+ L A+LL+FP+ + SLP    R+SAGA   KYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTY YYSPPPPAQP+
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA-HLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPP GIIG  GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAA   LT +  CSV T  LF+ LLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA-HLTATSACSVFTATLFTLLLALF

XP_022137790.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 [Momordica charantia]6.31e-118100Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF

XP_022955565.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita moschata]1.13e-8176.97Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L AVLL FPA   SLP  DRRT AGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSGTYYY  PPPP+QPT
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPP G  G  GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA  LT + ACSV T  LF  LLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF

XP_038906774.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Benincasa hispida]3.30e-8078.09Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        ME    LRF + L AVLL+FPA   SLP  DRR SAGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPP    PVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPP QPT
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIGG-YYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAH-LTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPPRGI GG YYQPPPY+NYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA   LT + A SV T  LF+ LL LF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIGG-YYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAH-LTATSACSVFTATLFTLLLALF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAN7 Nutrient reservoir1.98e-8277.65Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        ME   PL+FL+ L A+LL+FP+ + SLP    R+SAGA   KYQIECTMCSACDNPC QYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTY YYSPPPPAQP+
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA-HLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPP GIIG  GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF+YHTPPPGSSAA   LT +  CSV T  LF+ LLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA-HLTATSACSVFTATLFTLLLALF

A0A5A7U5R9 Nutrient reservoir5.07e-7675Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPP-AQP
        ME    L+ L+ L  +LL+      SLP    R+SAGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPP+SGTY YYSPPPP AQP
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPP-AQP

Query:  TYTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA-HLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        TYTYSSPPPPRGIIG  GYYQPPPY+NYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAA   LT +  CSV T  LF+ LL LF
Subjt:  TYTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAA-HLTATSACSVFTATLFTLLLALF

A0A6J1C7N8 leucine-rich repeat extensin-like protein 33.05e-118100Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF

A0A6J1GVF6 leucine-rich repeat extensin-like protein 65.48e-8276.97Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L AVLL FPA   SLP  DRRT AGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP +NCPPPPSPPSSGTYYY  PPPP+QPT
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPP G  G  GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA  LT + ACSV T  LF  LLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF

A0A6J1IXZ9 leucine-rich repeat extensin-like protein 67.42e-8075.84Show/hide
Query:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT
        ME    L+F + L AVLL F A   SLP  DRRT AGA   KYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPP ++CPPPPSPPSSGTYYY  PPPP+QPT
Subjt:  MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPT

Query:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF
        YTYSSPPPP G  G  GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFY+HTPPPGS+AA  LT + ACSV T  LF  LLALF
Subjt:  YTYSSPPPPRGIIG--GYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P06599 Extensin2.6e-0443.14Show/hide
Query:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQ------PTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPP--NPIVPYFPFYYHTPPPGSSA
        Y SPPPP  SPPPP + PPPP       Y+Y SPPPP        P Y Y SPPPP       + PPP  ++ +PPPP  +P  P   + Y +PPP   +
Subjt:  YLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQ------PTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPP--NPIVPYFPFYYHTPPPGSSA

Query:  AA
         A
Subjt:  AA

Q9LUI1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 64.3e-0746.73Show/hide
Query:  SKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF
        S Y I+C     C  P     SPPPPPP PPPP   PPPP PP         PPPP  P Y Y SPPPP      Y  PPP   Y  PPPP+P     P+
Subjt:  SKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF

Query:  YYHTPPP
         Y  PPP
Subjt:  YYHTPPP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 38.9e-0546.88Show/hide
Query:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP
        P   + +PP    PPPPSPPPPV  PPPP PP    Y    PPPP  P   YS PPPP         PPP     +PPPP+P  P  P Y   PPP
Subjt:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G06750.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein3.4e-2051.91Show/hide
Query:  VSSKYQ-IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPY
        V+SK + + CTMCS+CDNPC    +P P   SPP     PPPPS    G  YYYSPPPP+        PP      GGYY PP Y NY  PPPPNPIVPY
Subjt:  VSSKYQ-IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPY

Query:  FPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATL
        FPFYYHTPP G S +A L  +   ++F   L
Subjt:  FPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATL

AT3G22800.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein3.0e-0846.73Show/hide
Query:  SKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF
        S Y I+C     C  P     SPPPPPP PPPP   PPPP PP         PPPP  P Y Y SPPPP      Y  PPP   Y  PPPP+P     P+
Subjt:  SKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPF

Query:  YYHTPPP
         Y  PPP
Subjt:  YYHTPPP

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein6.3e-0646.88Show/hide
Query:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP
        P   + +PP    PPPPSPPPPV  PPPP PP    Y    PPPP  P   YS PPPP         PPP     +PPPP+P  P  P Y   PPP
Subjt:  PCGQYLSPP----PPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPP

AT4G16140.1 proline-rich family protein2.0e-2357.6Show/hide
Query:  TSAGAVSSKYQI-ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYS--N
        T    ++S  QI +CTMC++CDNPC    SPPPPP  PSPPPP      CPPPPS    G YYYY   PPA  + +Y   PPP    GGYY PPP S  N
Subjt:  TSAGAVSSKYQI-ECTMCSACDNPCGQYLSPPPPP--PSPPPP----VNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYS--N

Query:  YPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGS
        YP  PPPNPIVPYFPFYY+ PPP S
Subjt:  YPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGS

AT5G49280.1 hydroxyproline-rich glycoprotein family protein1.1e-2657.04Show/hide
Query:  VSSKYQ-IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPSS--GTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYS-NYPAPPP
        V+SK + + CTMCS+CDNPC    S  PPPPSPPPP      CPPPPSPPSS  G+ YYY  PPP+Q       PPP  G   GYY PPPYS NYP PPP
Subjt:  VSSKYQ-IECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPP----VNCPPPPSPPSS--GTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPRGIIGGYYQPPPYS-NYPAPPP

Query:  PNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLL
        PNPIVPYFPFYYHTPPPGS +   +++ S      A    L+
Subjt:  PNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAATGGTGCTCCTCTGAGATTCCTCCTCCCTCTCGCCGCCGTTCTCCTCATTTTTCCGGCCACATTGTGGTCTCTTCCGGCCACCGACCGCCGGACCTCCGCCGG
GGCTGTCTCCTCCAAGTACCAGATCGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGTGACAATCCCTGCGGCCAGTATCTGTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCCCCTCCTCCTCCCG
TCAACTGCCCGCCGCCGCCGTCTCCGCCCTCCTCCGGCACCTACTACTACTACTCCCCGCCCCCACCGGCCCAGCCCACTTACACCTACTCTTCCCCGCCGCCGCCACGT
GGAATCATCGGTGGGTACTACCAGCCGCCGCCGTACAGCAATTACCCGGCGCCGCCGCCGCCGAACCCGATTGTGCCGTATTTCCCATTTTACTACCACACTCCGCCGCC
GGGCTCCTCCGCCGCCGCCCATTTGACGGCCACTTCCGCTTGCTCTGTTTTTACTGCTACTTTATTTACTCTTTTACTCGCTTTGTTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAAATGGTGCTCCTCTGAGATTCCTCCTCCCTCTCGCCGCCGTTCTCCTCATTTTTCCGGCCACATTGTGGTCTCTTCCGGCCACCGACCGCCGGACCTCCGCCGG
GGCTGTCTCCTCCAAGTACCAGATCGAATGCACAATGTGCTCTGCTTGTGACAATCCCTGCGGCCAGTATCTGTCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCCCCTCCTCCTCCCG
TCAACTGCCCGCCGCCGCCGTCTCCGCCCTCCTCCGGCACCTACTACTACTACTCCCCGCCCCCACCGGCCCAGCCCACTTACACCTACTCTTCCCCGCCGCCGCCACGT
GGAATCATCGGTGGGTACTACCAGCCGCCGCCGTACAGCAATTACCCGGCGCCGCCGCCGCCGAACCCGATTGTGCCGTATTTCCCATTTTACTACCACACTCCGCCGCC
GGGCTCCTCCGCCGCCGCCCATTTGACGGCCACTTCCGCTTGCTCTGTTTTTACTGCTACTTTATTTACTCTTTTACTCGCTTTGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENGAPLRFLLPLAAVLLIFPATLWSLPATDRRTSAGAVSSKYQIECTMCSACDNPCGQYLSPPPPPPSPPPPVNCPPPPSPPSSGTYYYYSPPPPAQPTYTYSSPPPPR
GIIGGYYQPPPYSNYPAPPPPNPIVPYFPFYYHTPPPGSSAAAHLTATSACSVFTATLFTLLLALF