; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC05g1072 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC05g1072
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionTTHA0068-like domain containing protein
Genome locationMC05:14584874..14586026
RNA-Seq ExpressionMC05g1072
SyntenyMC05g1072
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005500 - Protein of unknown function DUF309
IPR023203 - TTHA0068-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7027740.1 hypothetical protein SDJN02_08917, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.66e-9180.11Show/hide
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XP_022152041.1 uncharacterized protein LOC111019851, partial [Momordica charantia]4.67e-122100Show/hide
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XP_022945654.1 uncharacterized protein LOC111449825 [Cucurbita moschata]5.44e-9581.22Show/hide
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XP_022971602.1 uncharacterized protein LOC111470277 [Cucurbita maxima]1.27e-9380.66Show/hide
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XP_023539066.1 uncharacterized protein LOC111799819 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.10e-9279.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LC38 Uncharacterized protein1.25e-8375.14Show/hide
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A0A5A7UHC0 Uncharacterized ypuF3.11e-8274.03Show/hide
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A0A6J1DGF9 uncharacterized protein LOC1110198512.26e-122100Show/hide
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A0A6J1G1I9 uncharacterized protein LOC1114498252.64e-9581.22Show/hide
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A0A6J1I2E8 uncharacterized protein LOC1114702776.16e-9480.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41120.1 unknown protein2.1e-4456.22Show/hide
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        HD LE LW  AE+PTRTLIHGILQCAVG HHLFN NHKGAMMELGEG+CKLRKM F  GPF  FER++SAVL+FVYQTQ+ELAAC
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCCTTTCATCGCTGTACGTTTCCTCCTCCTCCTCATCCCCTCTTCCACCTCACCGCAATTTGAACTCCTTTTTCCGCCATGGAAGCAATCTCCCAAACCCTAC
AAGAAGCAGCAGCAGCAGCACCAGACGAAGCAGATCCACAATCTCGCTCTCCTTCCGTACCTCCTACCGATTCTCTGTCGATCACGAAGACGAAGACGAGGAGGAGGATC
AGATCGCTAGAGATTCCTGCTTCGACGAAGCGGTCGATCTCTTCAATCGAGGGGCATATTACGATTGCCACGACGTGCTCGAGATTCTGTGGAACGGAGCCGAAGACCCT
ACCAGAACCCTAATCCATGGCATTCTTCAGTGCGCCGTGGGGCTTCATCACCTCTTCAATCGGAACCATAAAGGGGCGATGATGGAGCTGGGAGAGGGGCTGTGTAAGCT
ACGGAAGATGGAGTTTAGAAGTGGCCCTTTCTTTACTTTTGAGAGGGAGATTTCTGCAGTTCTGGACTTCGTTTACCAGACCCAGATTGAATTAGCTGCTTGTAAGTACT
TTTTTCCCACTTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAATGTCGTTGTCGATGGATATTCCTATAAAAGTTAGAGAAATTAAAAAACCGTAAAACATATTTAAATTAATAAATAAATATTTTTCTATTTCTAAATAACTTGAAAA
TAATTAATATTAATATCAGGTATATATTAATGATATTTTGTATCATGAATGCCACACGGCAGCACACGAAACTCCTAACCCCATTGTCCCAAAAAAATCACACCAAAACG
AAGAAGAAATGGCTCCAAATTCACGAGCTTCTGCAGTCAATCGCCAATGGCTTCCCTTTCATCGCTGTACGTTTCCTCCTCCTCCTCATCCCCTCTTCCACCTCACCGCA
ATTTGAACTCCTTTTTCCGCCATGGAAGCAATCTCCCAAACCCTACAAGAAGCAGCAGCAGCAGCACCAGACGAAGCAGATCCACAATCTCGCTCTCCTTCCGTACCTCC
TACCGATTCTCTGTCGATCACGAAGACGAAGACGAGGAGGAGGATCAGATCGCTAGAGATTCCTGCTTCGACGAAGCGGTCGATCTCTTCAATCGAGGGGCATATTACGA
TTGCCACGACGTGCTCGAGATTCTGTGGAACGGAGCCGAAGACCCTACCAGAACCCTAATCCATGGCATTCTTCAGTGCGCCGTGGGGCTTCATCACCTCTTCAATCGGA
ACCATAAAGGGGCGATGATGGAGCTGGGAGAGGGGCTGTGTAAGCTACGGAAGATGGAGTTTAGAAGTGGCCCTTTCTTTACTTTTGAGAGGGAGATTTCTGCAGTTCTG
GACTTCGTTTACCAGACCCAGATTGAATTAGCTGCTTGTAAGTACTTTTTTCCCACTTTTTGAAAGTCAAATTCATTCAAGACACAGATACTATTCAACTCTGTTAGGTA
GTGCCTATTTAGTCTTTAGACTTCTTTCAAAAAGTTGTTGATATCATTGAACTTTGACAACGATTATGAACATGAGCTGGGTAGCTATTCTCTTAGTCTGTTCTTTAAAT
AGGATTTCTTTGCTCGATGGATAAGCATTTGTGTTGTTATCAATGGAGCATTCTTCCTAAACATGTGAAAAAGTGAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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TRTLIHGILQCAVGLHHLFNRNHKGAMMELGEGLCKLRKMEFRSGPFFTFEREISAVLDFVYQTQIELAACKYFFPTF