; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC05g1534 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC05g1534
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionRibosomal protein L23
Genome locationMC05:19121948..19122145
RNA-Seq ExpressionMC05g1534
SyntenyMC05g1534
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GFQ08762.1 hypothetical protein PHJA_003020200 [Phtheirospermum japonicum]1.03e-3686.36Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYRKLW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

PHU05660.1 hypothetical protein BC332_26482 [Capsicum chinense]9.12e-3883.33Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G+ENPSLSRLCYRKLW+SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTW P +YHGH++WYTRG SFLV+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

YP_009342976.1 ribosomal protein L23 [Carpinus putoensis]8.17e-3784.85Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYR+LW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

YP_010046255.1 ribosomal protein L23 [Dolichandrone spathacea]2.93e-3786.36Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYRKLW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

YP_010143470.1 ribosomal protein L23 [Peganum harmala]8.41e-3784.85Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYR+LW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1L6V072 Ribosomal protein L233.95e-3784.85Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYR+LW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

A0A2G2X0M7 Uncharacterized protein5.13e-3786.36Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYRKLW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

A0A2G3BGQ9 Uncharacterized protein4.41e-3883.33Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G+ENPSLSRLCYRKLW+SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTW P +YHGH++WYTRG SFLV+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

A0A6B9QQT2 Ribosomal protein L234.07e-3784.85Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYR+LW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

A0A7T6XCJ4 Ribosomal protein L231.42e-3786.36Show/hide
Query:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY
        G ENPSLSRLCYRKLW SRNRRALI+GWAYYLDA SSYPLRTWLP VY GHD+WYTRGASF V+SY
Subjt:  GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GGGATAGAGAATCCATCGCTGTCTCGGCTGTGCTATCGAAAGCTTTGGAGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCATAGGGTGGGCTTACTACTTGGATGCTTTGAGCAG
TTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCGAAGTTTATCATGGGCACGATAGCTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCTGGTCATCTCATAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGATAGAGAATCCATCGCTGTCTCGGCTGTGCTATCGAAAGCTTTGGAGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATCATAGGGTGGGCTTACTACTTGGATGCTTTGAGCAG
TTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCGAAGTTTATCATGGGCACGATAGCTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCTGGTCATCTCATAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
GIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPEVYHGHDSWYTRGASFLVISY