; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g0317 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g0317
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationMC06:2523983..2524720
RNA-Seq ExpressionMC06g0317
SyntenyMC06g0317
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0006952 - defense response (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039607 - VQ motif-containing protein 8/17/18/20/21/25
IPR039832 - VQ motif-containing protein 20


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587652.1 VQ motif-containing protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.69e-11175.59Show/hide
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KAG7021613.1 VQ motif-containing protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.40e-11276.77Show/hide
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XP_022135386.1 VQ motif-containing protein 20 [Momordica charantia]2.67e-174100Show/hide
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XP_022933476.1 VQ motif-containing protein 20-like [Cucurbita moschata]1.83e-11176.77Show/hide
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XP_023007145.1 VQ motif-containing protein 20-like [Cucurbita maxima]1.58e-11277.95Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKA6 VQ domain-containing protein2.04e-9570.08Show/hide
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        NIPVY PNST+FLC N QP FNY+DS LLFG+ NI SLSS     NG++DF ++
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A0A1S3BCI6 VQ motif-containing protein 20-like5.36e-9169.53Show/hide
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A0A6J1C0L6 VQ motif-containing protein 201.29e-174100Show/hide
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A0A6J1EZ55 VQ motif-containing protein 20-like8.86e-11276.77Show/hide
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A0A6J1L266 VQ motif-containing protein 20-like7.63e-11377.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HWF9 Nuclear speckle RNA-binding protein B4.7e-0432.38Show/hide
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        P PLK+  DSH  I+K   +   P      T            ++PP   PV IYT +P+IIHTHP +FM LVQ+LTG + +   + ++S + ++  + +
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Query:  KIISS
         ++ +
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Q9CA36 VQ motif-containing protein 8, chloroplastic2.3e-0635.83Show/hide
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        NG  P  LK+  +SH I+K+SS  S P     ++                   PVIIY HSPK+IHT   DFMALVQ+LTGL   D+    N+       
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Query:  EENKIISSKVVVTSDDNESS
        E +  + ++ V   DDN ++
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Q9LS54 VQ motif-containing protein 202.1e-2839.62Show/hide
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        PP LK+NKDSH I+K      SPSS SS+             AKP  RHPVIIYTH+P+IIHT+P+DFMALVQKLTG++ SD++ G  +           
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Query:  -------------NATKCGEEN------------KIISSKVVVTSDDNESSSVVTTDENCCGSGVVEGQV--NSCFAPPM--FEPPPPPPPPQV------
                     N  +CG  N            K I     + S+D+ESSSV+TT+EN    G V   +  ++   PP     PPPPPPPP +      
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Query:  -ASSYLTNIPVYRP-NSTD-FLCSNHQPFFNYNDSSLLFGAPNIHS--LSSANSTLNGINDFCDY
           +YL   P++ P N  D FLC N QPF N++D   LF APN+ S   SS++S  +G+ +F D+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21320.1 nucleotide binding;nucleic acid binding3.4e-0532.38Show/hide
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        P PLK+  DSH  I+K   +   P      T            ++PP   PV IYT +P+IIHTHP +FM LVQ+LTG + +   + ++S + ++  + +
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Query:  KIISS
         ++ +
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AT1G21326.1 VQ motif-containing protein5.2e-0638.3Show/hide
Query:  PPPLKINKDSH-FIRKSSSSSSSPSSSSSSTSSLVNGVVGAGCAKPPQRHPVIIYTHSPKIIHTHPRDFMALVQKLTGLSRSDDEAGANSPNAT
        P PLK+  DSH  I+K   +   P      T            ++PP   PVIIYT SP+IIHTHP +FM LVQ+LTG + +   + + S + +
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AT1G68450.1 VQ motif-containing protein1.6e-0735.83Show/hide
Query:  NGLCPPPLKINKDSHFIRKSSSSSSSPSSSSSSTSSLVNGVVGAGCAKPPQRHPVIIYTHSPKIIHTHPRDFMALVQKLTGLSRSDDEAGANSPNATKCG
        NG  P  LK+  +SH I+K+SS  S P     ++                   PVIIY HSPK+IHT   DFMALVQ+LTGL   D+    N+       
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Query:  EENKIISSKVVVTSDDNESS
        E +  + ++ V   DDN ++
Subjt:  EENKIISSKVVVTSDDNESS

AT3G18360.1 VQ motif-containing protein1.5e-2939.62Show/hide
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        PP LK+NKDSH I+K      SPSS SS+             AKP  RHPVIIYTH+P+IIHT+P+DFMALVQKLTG++ SD++ G  +           
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Query:  -------------NATKCGEEN------------KIISSKVVVTSDDNESSSVVTTDENCCGSGVVEGQV--NSCFAPPM--FEPPPPPPPPQV------
                     N  +CG  N            K I     + S+D+ESSSV+TT+EN    G V   +  ++   PP     PPPPPPPP +      
Subjt:  -------------NATKCGEEN------------KIISSKVVVTSDDNESSSVVTTDENCCGSGVVEGQV--NSCFAPPM--FEPPPPPPPPQV------

Query:  -ASSYLTNIPVYRP-NSTD-FLCSNHQPFFNYNDSSLLFGAPNIHS--LSSANSTLNGINDFCDY
           +YL   P++ P N  D FLC N QPF N++D   LF APN+ S   SS++S  +G+ +F D+
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AT3G18690.1 MAP kinase substrate 17.5e-0533.33Show/hide
Query:  PPPLKINKDSHFIRKSSSSSSSPSSSSSSTSSLVNGVVGAGCAKPP--QRHPVIIYTHSPKIIHTHPRDFMALVQKLTGLSR----SDDEAGANSPNATK
        P PL ++KDSH I+K     + P +                   PP   R PV+IY  SPK++H    +FM +VQ+LTG+S          G  SP A  
Subjt:  PPPLKINKDSHFIRKSSSSSSSPSSSSSSTSSLVNGVVGAGCAKPP--QRHPVIIYTHSPKIIHTHPRDFMALVQKLTGLSR----SDDEAGANSPNATK

Query:  CGEEN
           EN
Subjt:  CGEEN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCCCTCAACAGCTCCATGGGAAGAGGGATAATGGCAGTACCACCGCCAATAATGGCAACGGCAATGGCAATGGATTGTGTCCGCCTCCGTTGAAGATCAATAAGGA
TTCTCATTTCATCAGAAAATCCTCGTCGTCTTCCTCTTCTCCTTCCTCGTCTTCCTCTTCCACCTCGTCGCTCGTCAATGGCGTCGTAGGCGCCGGCTGCGCCAAGCCGC
CGCAGCGGCATCCGGTGATTATATACACGCATTCTCCCAAAATCATCCACACGCATCCTCGAGACTTCATGGCGTTGGTTCAGAAGCTCACCGGATTGTCTCGCTCCGAT
GACGAAGCGGGAGCTAATTCTCCGAACGCGACGAAATGTGGCGAGGAGAATAAAATCATTAGCTCCAAAGTCGTGGTGACGAGTGACGATAATGAGTCGTCGTCCGTTGT
GACGACGGATGAAAATTGCTGCGGCAGCGGCGTGGTGGAAGGTCAGGTTAATTCGTGTTTCGCTCCGCCGATGTTCGAGCCACCGCCGCCGCCACCGCCACCGCAAGTAG
CGAGTTCTTACCTAACGAACATCCCTGTTTACAGGCCGAATTCGACGGACTTTTTGTGCTCTAATCATCAACCGTTTTTTAACTACAACGATTCTTCTTTGCTTTTTGGT
GCTCCAAATATCCATTCTCTTTCGTCCGCTAATTCAACATTGAATGGAATTAATGATTTCTGCGACTATAGCGAATAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCCCTCAACAGCTCCATGGGAAGAGGGATAATGGCAGTACCACCGCCAATAATGGCAACGGCAATGGCAATGGATTGTGTCCGCCTCCGTTGAAGATCAATAAGGA
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CGCAGCGGCATCCGGTGATTATATACACGCATTCTCCCAAAATCATCCACACGCATCCTCGAGACTTCATGGCGTTGGTTCAGAAGCTCACCGGATTGTCTCGCTCCGAT
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