; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g0571 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g0571
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionArmadillo-like helical
Genome locationMC06:4627647..4628846
RNA-Seq ExpressionMC06g0571
SyntenyMC06g0571
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050093.1 Armadillo-like helical [Cucumis melo var. makuwa]1.79e-22985.04Show/hide
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KAG6587872.1 hypothetical protein SDJN03_16437, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.49e-23887.72Show/hide
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KAG6589816.1 hypothetical protein SDJN03_15239, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.35e-23587.28Show/hide
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KAG7021757.1 hypothetical protein SDJN02_15484, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.10e-23887.97Show/hide
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XP_022134648.1 uncharacterized protein LOC111006872 [Momordica charantia]4.10e-276100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT75 Uncharacterized protein5.60e-22884.54Show/hide
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A0A5A7U2F9 Armadillo-like helical8.65e-23085.04Show/hide
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A0A5D3C7L4 Armadillo-like helical2.48e-22984.79Show/hide
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A0A6J1C2L5 uncharacterized protein LOC1110068721.99e-276100Show/hide
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A0A6P6FUS8 uncharacterized protein LOC1124901052.10e-18770.27Show/hide
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        MDD SKE+ PRVL+VLEALKQ SHELQAHP    DE +S AIKALLELE ESD ILS DPNLS LS HL +LK+LVET QK RG+  +RSF TRR +T+S
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Query:  VSQVAGSIESEIQAWIDRESLETLVRALKEPSID-ENESIKLLTQFENRLDQGFNRELQDLMLKSKVFSLLESIVCSPNFSKTIREHSAYAIGAMVRFNK
        +S+VAGSIE+EIQAWIDRES+E L   L+EP  D E E+++LLTQFE+RL +GFNRELQDL+LKSKVFSLLES +C P+ SK IREHSA+AIGA++RFNK
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Query:  DVFVGQVLTGPTIHALVQMASSHSLKVLCSLIRLIRSPLVEEIESNGDIPKIISLLNCQDLQIRVLAMDCIVEIGYFGRKEAVDTMLDEGLIDRLVELQR
        DVFVGQVL GPT  AL+ MAS HS+KVLC LIR I+SPLV+ IESNG+IP+II+ LNCQD+Q+RV+AMDCI+EIGYFGRKEA+D ML+EGLI +LVELQR
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Query:  SELGGDLIGLGRQTAE-----EGTGVAAGEVEGRREGRESREKKFLERHPFASCVARFTVQLEVGEGLRQREKRAIKPEILKRVTKACVSDAEAATIMAE
        SELGGDLI LGR +++     E   V+A  VE  ++ RESRE++FLE HPFASCVARF VQLEVGEGLRQRE+RA K +I+ RV +A  SDAEAATI+AE
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Query:  VLWGSSP
        VLWG+SP
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGATTCTTCGAAGGAGGATACCCCGCGAGTTCTCAGAGTCCTCGAAGCTCTCAAACAAGTTTCTCATGAGTTGCAGGCACATCCGAGTCCTGGCTCCGACGAGTT
CGATTCGCCCGCCATTAAAGCTCTGCTCGAGCTCGAGGTTGAATCCGACAAAATCCTTTCCAGTGATCCGAATCTCTCCACTCTTTCTCACCACCTCGCGAACCTCAAAT
CATTGGTGGAGACGCTTCAGAAGTCCAGAGGTTACGGCCTCAGGTCCTTCTTCACCCGCCGTTTCGCGACTAATTCGGTGTCTCAAGTCGCGGGTTCAATCGAGTCGGAG
ATTCAAGCCTGGATTGACCGCGAGAGCTTGGAGACTCTGGTTCGAGCTCTTAAAGAGCCCTCAATCGACGAGAACGAATCGATTAAGCTACTGACTCAGTTCGAAAATCG
ACTTGATCAAGGCTTCAACCGCGAGCTACAGGATCTCATGCTCAAATCCAAGGTGTTTTCGCTGCTCGAATCGATCGTTTGCAGCCCTAATTTCTCGAAAACGATCCGAG
AGCACTCAGCGTACGCGATTGGGGCTATGGTCCGTTTCAACAAAGACGTATTCGTCGGTCAAGTACTAACGGGACCCACGATTCACGCTCTAGTTCAAATGGCCTCCTCG
CACTCATTAAAAGTCCTCTGTTCCTTGATCAGATTGATTAGGTCTCCGCTGGTCGAGGAGATCGAGTCAAACGGCGACATACCAAAAATCATAAGCTTATTGAATTGCCA
AGACCTACAAATTAGGGTACTAGCGATGGATTGCATTGTTGAAATCGGTTATTTTGGGCGAAAAGAAGCGGTGGACACTATGCTGGACGAGGGTCTGATAGACAGGCTAG
TGGAGTTGCAGAGGTCGGAATTGGGCGGAGATTTGATCGGATTGGGAAGGCAGACGGCGGAGGAGGGCACAGGGGTGGCCGCCGGCGAGGTGGAGGGAAGGAGAGAAGGC
AGAGAAAGCAGAGAGAAGAAGTTTTTGGAGAGGCATCCATTTGCGAGCTGTGTAGCAAGATTTACAGTGCAATTGGAGGTAGGAGAGGGGCTGAGGCAGAGGGAAAAGAG
GGCCATTAAGCCTGAAATATTGAAGAGAGTTACAAAAGCTTGTGTTTCTGATGCTGAGGCTGCCACTATAATGGCTGAGGTTTTGTGGGGTTCTAGTCCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATGATTCTTCGAAGGAGGATACCCCGCGAGTTCTCAGAGTCCTCGAAGCTCTCAAACAAGTTTCTCATGAGTTGCAGGCACATCCGAGTCCTGGCTCCGACGAGTT
CGATTCGCCCGCCATTAAAGCTCTGCTCGAGCTCGAGGTTGAATCCGACAAAATCCTTTCCAGTGATCCGAATCTCTCCACTCTTTCTCACCACCTCGCGAACCTCAAAT
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GGCCATTAAGCCTGAAATATTGAAGAGAGTTACAAAAGCTTGTGTTTCTGATGCTGAGGCTGCCACTATAATGGCTGAGGTTTTGTGGGGTTCTAGTCCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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