; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g0765 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g0765
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionTranscription factor
Genome locationMC06:6359298..6361168
RNA-Seq ExpressionMC06g0765
SyntenyMC06g0765
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017884 - SANT domain
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589987.1 Transcription factor MYBS3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.52e-10962.61Show/hide
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KAG7023651.1 Transcription factor MYBS3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.31e-10761.78Show/hide
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         +    +  TTT   SQCLK+SSNSQ  S NK++    ++L LPLL+   TT+F S+      MEV+N             A+SSSS +W+YGLID SQL
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        K +S        CSSS   S A GPDLELTLAAP  ASNLE + +KKA
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XP_022147581.1 myb-like protein J [Momordica charantia]2.55e-22296.41Show/hide
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XP_022960686.1 uncharacterized protein DDB_G0271670-like [Cucurbita moschata]2.21e-10862.43Show/hide
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XP_023515620.1 uncharacterized protein DDB_G0271670-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.86e-10962.43Show/hide
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        +S        CSSS   S A GPDLELTLAAP  ASNLE + +KKA
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BR73 probable serine/threonine-protein kinase DDB_G0282963 isoform X19.74e-9554.57Show/hide
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        M RKCSHCGNIGHNSRTCSN R S         ++   IRLFGVHLD     SS+SSS  SSS N +       F+IKKSFSTDCLS         SSS 
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        SSSRIH+D            +K P NGYLSDGLL  +Q+RKKGVPWTEEEHR FLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQST+NKKN
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        RRSSLFDMV   Y T      TTTA  SQCLK+SSNSQ    N DD      ++D           TT+F S+             N MEVIN K ++  
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              ++SSSS +W+YGLI+ S LK  S P   N+Y +S         S++SS    P LELTLA+P MASNLE    K PP
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A0A6J1D2T3 myb-like protein J1.24e-22296.41Show/hide
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        TKPPINGYLSDGLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMV  T     +  
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A0A6J1H8A8 uncharacterized protein DDB_G0271670-like1.07e-10862.43Show/hide
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        +S        CSSS   S A GPDLELTLAAP  ASNLE + +KKA
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A0A6J1IDI5 transcription factor KUA1-like1.19e-8854.65Show/hide
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        MGRKCSHCGNIGHNSRTC+NF PS  N V +       IRLFGVHLD SSSSSS         F IKKSFSTDCL  PSS  PSSSSSFSSS R+H+D +
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        STTT                    + + + L L + T S     + MEV+    + +L+   A+++SS S VW+Y                         
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                DLELTL AP  A NLE ++ KKAPP
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A0A6J1JFB4 uncharacterized protein DDB_G0271670-like4.81e-10761.85Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPS-NNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHN-------FAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSS
        MGRKCSHCGNIGHNSRTC+NFRPS   NF   +      IRLFGVHLD SSSSSS+ SSS +         FAIKKSFSTDCLS  SSS     SSFS+S
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPS-NNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHN-------FAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSS

Query:  RIHVDAD-DTKPPINGYLSDGLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMVYS
        RI +D + +     NGYLSDGLL  +Q+RKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTT+TPTQVASHAQKY+LRQSTINKKNRRSSLFDMV +
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Query:  TSLLSTSTTTANFSQCLKLSSNSQELSKNKDD----RQLTLPLLDR--TTSFGSAYNY---MEVINKKLDDQLMADAAAAASSSSGVWIYGLIDDSQLKC
            +  TTT   SQCLK+SSNSQ  S NK++    ++L LPLL+   TT+F S+      MEV+N              ASSSS +W+YGLID SQLK 
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Query:  SSSPKKPNSYCSSSTNSSAAAGPDLELTLAAPSMASNLEQNSKKAP
        +S        CSSS   S A GPDLELTLAAP  ASNLE    K P
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8A9B2 Transcription factor MYBS15.0e-2564.94Show/hide
Query:  EQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMVYSTS
        EQ+R+KG+PWTEEEHR+FL+GL+K G+GDWR ISRN+V +RTPTQVASHAQKYF+R +++N+  RRSS+ D+   T+
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Q2V9B0 Transcription factor MYB1R11.7e-2547.44Show/hide
Query:  GPPIRLFGVH--LDPSSSS-SSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADDTKPPINGYLSDGLLTREQDRKKGVPWTEEEHR
        G  I LFGV   +DP   S S N  S   H  A   +   D          + SS  +    +  ADD    +    + G     ++RK+GVPWTEEEH+
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Query:  IFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDM
        +FL+GL+K+G+GDWRGISRN+V TRTPTQVASHAQKYFLR+S +N++ RRSSLFD+
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Q7XC57 Transcription factor MYBS32.1e-3648.74Show/hide
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        M R+CSHC + GHNSRTC N                  +++FGV L   S               I+KS S   LSL SS+  S+S   S +    D  D
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD

Query:  TKP-PINGYLSD----GLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMVYSTSL
          P   +GY SD    G  +  +DRKKGVPWTEEEHR FL+GL+KLG+GDWRGISRN+V +RTPTQVASHAQKYF+RQS + ++ RRSSLFDMV   S+
Subjt:  TKP-PINGYLSD----GLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMVYSTSL

Q9FKF9 Probable transcription factor At5g616201.9e-2942.49Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD
        + + CSHCG+ GHN+RTC N              +   ++LFGV++       S+    P    A++KS S   L    ++  S+ S    + +    DD
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD

Query:  TKPPINGYLSDGLLTREQ-----DRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDM
        T     GY SDG +  ++     ++KKG PWTEEEHR FLIGL KLG+GDWRGI++++V+TRTPTQVASHAQKYF+R +  +K+ RR+SLFD+
Subjt:  TKPPINGYLSDGLLTREQ-----DRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDM

Q9LVS0 Transcription factor KUA12.6e-3446.91Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD
        M R+CSHC + GHNSRTC N                  ++LFGV L   S               I+KS S   LS  + S   S    + S       D
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Query:  TKPPI--NGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMV
            +  +GY S+  +   +  ++RKKG PWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYF+RQS ++++ RRSSLFDMV
Subjt:  TKPPI--NGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70000.1 myb-like transcription factor family protein3.9e-3345.88Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSG---PPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVD
        M R CS CGN GHNSRTC    P++          G     I LFGV +  +SSS              +KS S + LS    +P  + +          
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSG---PPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVD

Query:  ADDTKPPINGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDM
         DD      GY SD ++    R ++RK+G PWTEEEHR+FL GL K+G+GDWRGISRN+V TRTPTQVASHAQKYFLR++  N++ RRSSLFD+
Subjt:  ADDTKPPINGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDM

AT1G70000.2 myb-like transcription factor family protein3.9e-3345.88Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSG---PPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVD
        M R CS CGN GHNSRTC    P++          G     I LFGV +  +SSS              +KS S + LS    +P  + +          
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSG---PPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVD

Query:  ADDTKPPINGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDM
         DD      GY SD ++    R ++RK+G PWTEEEHR+FL GL K+G+GDWRGISRN+V TRTPTQVASHAQKYFLR++  N++ RRSSLFD+
Subjt:  ADDTKPPINGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDM

AT3G16350.1 Homeodomain-like superfamily protein2.9e-3642.97Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSR--------TCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSS
        M R+CSHC N GHNSR        TC              + S   ++LFGV L   S    + S       A+  + +T     PSS  P ++S+ + S
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSR--------TCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSS

Query:  RIHVDADDTKPPIN-GYLSD------GLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSL
         +   A  +    N GYLSD      G   R  +RK+GVPWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVT+RTPTQVASHAQKYF+R ++ +++ RRSSL
Subjt:  RIHVDADDTKPPIN-GYLSD------GLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSL

Query:  FDMVYSTSLLSTSTTTANFSQCLKLSSNSQELSKNKDDRQLTLPLLDRT
        FDMV  T  + T ++     Q L  SS S+E  K      L L L + T
Subjt:  FDMVYSTSLLSTSTTTANFSQCLKLSSNSQELSKNKDDRQLTLPLLDRT

AT5G47390.1 myb-like transcription factor family protein1.9e-3546.91Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD
        M R+CSHC + GHNSRTC N                  ++LFGV L   S               I+KS S   LS  + S   S    + S       D
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD

Query:  TKPPI--NGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMV
            +  +GY S+  +   +  ++RKKG PWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYF+RQS ++++ RRSSLFDMV
Subjt:  TKPPI--NGYLSDGLL---TREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMV

AT5G56840.1 myb-like transcription factor family protein5.6e-4856.72Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD
        MGR+CSHCGN+GHNSRTCS+++                +RLFGVHLD +SSS            AIKKSFS DC  LP+ S  SSSSSF+          
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADD

Query:  TKPPINGYLSDGLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQ-STINKKNRRSSLFDMVYSTSLLSTST
              GYLSDGL  +  DRKKGVPWT EEHR FLIGLEKLG+GDWRGISRN+V T++PTQVASHAQKYFLRQ +T++ K RR+SLFDMV + ++   ST
Subjt:  TKPPINGYLSDGLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQ-STINKKNRRSSLFDMVYSTSLLSTST

Query:  T
        T
Subjt:  T


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAGAAAGTGTTCACATTGTGGCAACATAGGCCACAATTCAAGAACTTGCTCAAATTTCAGACCCTCAAACAACAATTTTGTTGCTGCTACTGCTACTTCTGGCCC
TCCCATCAGGCTATTTGGAGTTCATCTTGATCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTAATTATTCTTCTTCTCCCAATCATAATTTCGCCATTAAAAAGAGCTTCAGCACTGATT
GCTTGTCTTTGCCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTTCCTCCTCTTTCTCGTCGTCTCGAATTCACGTCGACGCCGACGATACGAAACCCCCCATCAATGGCTATCTCTCT
GATGGCCTCCTCACTAGAGAGCAGGACAGGAAGAAAGGGGTTCCATGGACTGAAGAGGAGCATAGAATATTTCTAATTGGGCTTGAAAAGCTTGGGAGAGGAGATTGGAG
AGGCATCTCTAGAAATTATGTCACCACTAGAACTCCAACTCAAGTTGCAAGCCATGCTCAGAAATATTTCCTTAGGCAATCCACAATCAACAAAAAGAATAGGCGTTCAA
GCCTCTTTGACATGGTATACTCTACTTCTCTTCTCTCTACCTCAACAACAACAGCTAATTTCTCTCAATGTCTGAAGCTATCTTCGAACTCACAAGAATTGTCGAAGAAT
AAGGATGATCGTCAGCTGACTTTGCCTCTTTTGGATAGAACCACTAGTTTTGGAAGTGCTTATAATTATATGGAAGTGATTAACAAGAAGTTAGATGATCAATTAATGGC
AGATGCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTCTTCTGGAGTTTGGATTTATGGATTGATTGATGATTCACAGCTGAAATGTTCTTCTTCTCCAAAAAAACCAAATTCTTATTGTT
CTTCTTCAACTAATTCTTCTGCAGCAGCTGGGCCAGATCTTGAGCTCACTTTGGCAGCTCCTTCAATGGCTTCTAATTTGGAACAAAATAGCAAAAAGGCACCCCCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCGAGTAACGCAGTGATCAATACAAAACTTGAAACCGAGATCCCACAAGGCCCAAAGACCTTTCCCACTGTGTCATCCCGAAGATCTCTCTTTGTCGCATAATCTTTTT
CTTATACACATACAAAATACTAATAGCTGATGCATGGAGAGAGAGAAATAGAGAGACCCAAGTTGGAAAAAGAAAACAAAAACCCAAAAACAAAAAAGGGAAAAAAAGTT
GTATATAAGGCCATCCAATCAGATTGTTCTCTTATGCGTCCATTTTGTTTTTTAAGGCATTGGCCCCATTCATCAAATTCATATAAACCACACCATTATATCACTTCTTT
TTGTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAACTTTTTTTTTATGTTTTTTGGGGTTTCATCATCATTATTGTGAGAAGAAGCATAAGAATATCAGAGAGATTTTACTTTAATT
CTAGAGGGGTTTTAATTTCTTGGGTGAAAAATGGGCAGAAAGTGTTCACATTGTGGCAACATAGGCCACAATTCAAGAACTTGCTCAAATTTCAGACCCTCAAACAACAA
TTTTGTTGCTGCTACTGCTACTTCTGGCCCTCCCATCAGGCTATTTGGAGTTCATCTTGATCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTAATTATTCTTCTTCTCCCAATCATAATT
TCGCCATTAAAAAGAGCTTCAGCACTGATTGCTTGTCTTTGCCTTCTTCTTCTCCTCCTTCTTCTTCCTCCTCTTTCTCGTCGTCTCGAATTCACGTCGACGCCGACGAT
ACGAAACCCCCCATCAATGGCTATCTCTCTGATGGCCTCCTCACTAGAGAGCAGGACAGGAAGAAAGGGGTTCCATGGACTGAAGAGGAGCATAGAATATTTCTAATTGG
GCTTGAAAAGCTTGGGAGAGGAGATTGGAGAGGCATCTCTAGAAATTATGTCACCACTAGAACTCCAACTCAAGTTGCAAGCCATGCTCAGAAATATTTCCTTAGGCAAT
CCACAATCAACAAAAAGAATAGGCGTTCAAGCCTCTTTGACATGGTATACTCTACTTCTCTTCTCTCTACCTCAACAACAACAGCTAATTTCTCTCAATGTCTGAAGCTA
TCTTCGAACTCACAAGAATTGTCGAAGAATAAGGATGATCGTCAGCTGACTTTGCCTCTTTTGGATAGAACCACTAGTTTTGGAAGTGCTTATAATTATATGGAAGTGAT
TAACAAGAAGTTAGATGATCAATTAATGGCAGATGCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTCTTCTGGAGTTTGGATTTATGGATTGATTGATGATTCACAGCTGAAATGTTCTT
CTTCTCCAAAAAAACCAAATTCTTATTGTTCTTCTTCAACTAATTCTTCTGCAGCAGCTGGGCCAGATCTTGAGCTCACTTTGGCAGCTCCTTCAATGGCTTCTAATTTG
GAACAAAATAGCAAAAAGGCACCCCCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRKCSHCGNIGHNSRTCSNFRPSNNNFVAATATSGPPIRLFGVHLDPSSSSSSNYSSSPNHNFAIKKSFSTDCLSLPSSSPPSSSSSFSSSRIHVDADDTKPPINGYLS
DGLLTREQDRKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFLRQSTINKKNRRSSLFDMVYSTSLLSTSTTTANFSQCLKLSSNSQELSKN
KDDRQLTLPLLDRTTSFGSAYNYMEVINKKLDDQLMADAAAAASSSSGVWIYGLIDDSQLKCSSSPKKPNSYCSSSTNSSAAAGPDLELTLAAPSMASNLEQNSKKAPP