; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g0862 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g0862
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1
Genome locationMC06:7171057..7175722
RNA-Seq ExpressionMC06g0862
SyntenyMC06g0862
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023531642.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.25e-20195.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein1.30e-20195.75Show/hide
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A0A1S3BPW8 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X23.05e-20095.1Show/hide
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A0A6J1D0R2 transcription factor Pur-alpha 14.07e-21099.02Show/hide
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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like2.31e-20094.77Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like2.49e-20095.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O35295 Transcriptional activator protein Pur-beta5.7e-1528.67Show/hide
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        G  GGGG G GG         GG  G GG     EL  K L +++K FY D+K+N +GR+LKI+E     ++S + +  +    F D    +I       
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           PE                  E  +      Y D+ EN+RGRFL++ + +V+R         G     G            ++ +   LP Q   E  
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P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha1.3e-1428.17Show/hide
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        G+ GGGG G GG  +G     GG A GG      EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I       
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                   D+P      E  +      Y D+ EN+RGRFL++        R T+    G    +G T                 LP Q   E  + +
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          L DD G                           +++   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha1.5e-1528.37Show/hide
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        SGGGG G GG         GG +GGGGGG          EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I  
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Query:  ---------------SDDP-EVFSKELQLDTKASLYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFILPNQENSE
                        D+P      E  +      Y D+ EN+RGRFL++        R T+    G    +G T                 LP Q   E
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Query:  HSERIVGLSDDVGAGFISGHSSQSGPNSDLNVDRQVDLSAQDDMGNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILP
          + +  L DD G                           +++   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q6PHK6 Transcriptional activator protein Pur-beta5.1e-1627.12Show/hide
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        G   GG  GG           EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  S    F D    +I          PE        
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                   E  +      Y D+ EN+RGRFL++ +   + NR       G     G            +A +   LP Q   E  + +  L DD G 
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                  GP             A    G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +P     +F      + E  K+
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