; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g1110 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g1110
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionATP synthase subunit beta, chloroplastic
Genome locationMC06:11758645..11758866
RNA-Seq ExpressionMC06g1110
SyntenyMC06g1110
Gene Ontology termsGO:0042776 - mitochondrial ATP synthesis coupled proton transport (biological process)
GO:0005753 - mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0045261 - proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0046933 - proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (molecular function)
InterPro domainsIPR004100 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain
IPR036121 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AOO76916.1 ATP synthase beta subunit, partial [Trichosanthes laceribractea]2.73e-3889.19Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG++VID + PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

KCW53483.1 hypothetical protein EUGRSUZ_J02738, partial [Eucalyptus grandis]7.31e-3887.67Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFN
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG++VID   PL+VPVGG TLGRIFN
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFN

VDD22435.1 unnamed protein product [Brassica rapa]6.19e-3886.49Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSAT+GL RG+DV+DM  PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

VVW88051.1 unnamed protein product, partial [Nymphaea colorata]8.70e-3886.49Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYN+LVVKG+DTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGL RG++VID   PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

YP_009456068.1 ATP synthase CF1 beta subunit [Momordica charantia]1.42e-3997.3Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG+DVID KGPLNVPVGGTTLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A059AI38 ATP-synt_ab_N domain-containing protein (Fragment)3.54e-3887.67Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFN
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG++VID   PL+VPVGG TLGRIFN
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFN

A0A1C9HCF5 ATP synthase beta subunit (Fragment)1.32e-3889.19Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNAL+VKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG++VID + PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

A0A2I6BZY4 ATP synthase subunit beta, chloroplastic6.89e-4097.3Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG+DVID KGPLNVPVGGTTLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

A0A3P6DJP9 ATP-synt_ab_N domain-containing protein3.00e-3886.49Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSAT+GL RG+DV+DM  PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

A0A5K1HFI9 ATP-synt_ab_N domain-containing protein (Fragment)4.21e-3886.49Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYN+LVVKG+DTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGL RG++VID   PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4QK25 ATP synthase subunit beta, chloroplastic2.6e-3086.49Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSAT+GL RG+DV+DM  PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

P19366 ATP synthase subunit beta, chloroplastic2.6e-3086.49Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSAT+GL RG+DV+DM  PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

Q09FV4 ATP synthase subunit beta, chloroplastic1.2e-3087.84Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKGQDT GQ+INVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG++VID   PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

Q49KZ1 ATP synthase subunit beta, chloroplastic2.0e-3087.84Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG++VID   PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

Q6QBP2 ATP synthase subunit beta, chloroplastic1.2e-3087.84Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKG+DTAGQ+INVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRG++VID   PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G08670.1 ATP synthase alpha/beta family protein5.7e-0943.24Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG  V++   P+ VPVG  TLGRI NV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

AT5G08680.1 ATP synthase alpha/beta family protein5.7e-0943.24Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG  V++   P+ VPVG  TLGRI NV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

AT5G08690.1 ATP synthase alpha/beta family protein5.7e-0943.24Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG  V++   P+ VPVG  TLGRI NV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV

ATCG00480.1 ATP synthase subunit beta1.8e-3186.49Show/hide
Query:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV
        MPNIYNALVVKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSAT+GL RG+DV+DM  PL+VPVGG TLGRIFNV
Subjt:  MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTAATATTTACAACGCTTTGGTAGTTAAGGGTCAAGATACTGCCGGTCAAGAAATTAATGTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGC
TGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGTCTAATGAGAGGAATTGACGTGATTGACATGAAAGGTCCTCTAAATGTTCCAGTCGGCGGAACGACTCTCGGCCGAATTTTCAACG
TG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTAATATTTACAACGCTTTGGTAGTTAAGGGTCAAGATACTGCCGGTCAAGAAATTAATGTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAGTTAGAGC
TGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGTCTAATGAGAGGAATTGACGTGATTGACATGAAAGGTCCTCTAAATGTTCCAGTCGGCGGAACGACTCTCGGCCGAATTTTCAACG
TG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPNIYNALVVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGIDVIDMKGPLNVPVGGTTLGRIFNV