; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g1397 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g1397
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionProtein TIC 214
Genome locationMC06:21200398..21200538
RNA-Seq ExpressionMC06g1397
SyntenyMC06g1397
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008896 - Protein TIC214


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
YP_009753847.1 Ycf1 protein [Trichosanthes pilosa]4.48e-1397.83Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
YP_010141178.1 hypothetical chloroplast RF19 [Rubus peltatus]2.24e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
YP_010141349.1 hypothetical chloroplast RF19 [Rubus innominatus]2.39e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
YP_010141605.1 hypothetical chloroplast RF19 [Rubus corchorifolius]2.34e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
YP_010142031.1 hypothetical chloroplast RF19 [Rubus pileatus]2.24e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6H0ETT1 Protein TIC 2142.17e-1397.83Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
A0A7T6ZTG6 Hypothetical chloroplast RF191.16e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
A0A7T6ZTS8 Hypothetical chloroplast RF191.13e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
A0A7T6ZUF6 Hypothetical chloroplast RF191.08e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
A0A7T7CNP5 Hypothetical chloroplast RF191.08e-1395.65Show/hide
Query:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  LKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6MM95 Protein TIC 2141.2e-0987.23Show/hide
Query:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        +LKET +TEERGESEEE DVEIETTSETKGTKQEQE STEED SPSL
Subjt:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
Q06GT8 Protein TIC 2145.5e-1093.18Show/hide
Query:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTS
        +LKET ETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEED S
Subjt:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTS
Q0ZIW0 Protein TIC 2147.1e-1087.23Show/hide
Query:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        ++KET ETEERGESEEETDVEIE TSETKGTKQEQE STEED SPSL
Subjt:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
Q4VZL0 Protein TIC 2146.0e-0985.11Show/hide
Query:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        E  +T ET E  ESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
Subjt:  ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
Q68RU8 Protein TIC 2146.0e-0988.64Show/hide
Query:  ETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
        ET  TEERGESEEETDVEIET SETKG KQEQEGSTEED SPSL
Subjt:  ETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAACTAAAAGAAACGGAGGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAGATGTAGAAATAGAAACCACTTCCGAAACGAAGGGGACTAAACAGGAACAAGAGGG
ATCCACCGAAGAAGATACTTCTCCTTCCCTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAACTAAAAGAAACGGAGGAAACGGAGGAAAGGGGGGAAAGCGAGGAAGAAACAGATGTAGAAATAGAAACCACTTCCGAAACGAAGGGGACTAAACAGGAACAAGAGGG
ATCCACCGAAGAAGATACTTCTCCTTCCCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
ELKETEETEERGESEEETDVEIETTSETKGTKQEQEGSTEEDTSPSL