; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g1503 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g1503
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationMC06:22347649..22352718
RNA-Seq ExpressionMC06g1503
SyntenyMC06g1503
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057418.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]4.01e-19690.76Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEV-IPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEV IPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGVQGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEV-IPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSALS
         LENFTKSLKSALS
Subjt:  ELENFTKSLKSALS

XP_004145375.1 tryptophan synthase alpha chain isoform X1 [Cucumis sativus]1.92e-19690.71Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDI  NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LENFTKSL SAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

XP_008449352.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]5.74e-19891.05Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGVQGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_022145935.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Momordica charantia]4.04e-219100Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALSQ
        LENFTKSLKSALSQ
Subjt:  LENFTKSLKSALSQ

XP_038888258.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.92e-19991.69Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDI+FNSSRLLRFNKIPTT LIFP H CKISVFQTKRF PMAA+TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST+GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLA GTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFMM IKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGAR SV+++VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTK+LKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKV4 Tryptophan synthase9.27e-19790.71Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDI  NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LENFTKSL SAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

A0A1S3BMG6 Tryptophan synthase2.78e-19891.05Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGVQGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A5A7UQL8 Tryptophan synthase1.94e-19690.76Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEV-IPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEV IPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGVQGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEV-IPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSALS
         LENFTKSLKSALS
Subjt:  ELENFTKSLKSALS

A0A5D3E1Z9 Tryptophan synthase2.78e-19891.05Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGVQGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A6J1CVV7 Tryptophan synthase1.96e-219100Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALSQ
        LENFTKSLKSALSQ
Subjt:  LENFTKSLKSALSQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain1.0e-8057.41Show/hide
Query:  LSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+ F  L+++ + A IP+ITAGDPDL TTA+AL++L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L RG     ++ ++KEV PE+  PI LF+YYN
Subjt:  LSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVT
        PI  RG+E F+  +K AGVQGLV+PD+PLEE E L K A +  I + LL  PT+P +R++AI   S+GFIYLVS  GVTG R+ V++RV+ LL  ++  T
Subjt:  PILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALSQ
        +KP+ VGFGISKPEH  QV  WGAD VIVGSA+VK L E  +PEEGLK +  F + LK AL +
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALSQ

B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain3.0e-8056.06Show/hide
Query:  VGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSY
        V +S  F+ L+++ + A IP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAAATR+L +GT   A++ M+  V P L  P+ LF+Y
Subjt:  VGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSY

Query:  YNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKE
        YNPI  RG+E F+  +  AGVQGLV+PD+PLEE + +  +A    IEL LL  PTTP+ R+ AI E S+GFIYLVS+ GVTG R+ V  RV  LL E+++
Subjt:  YNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKE

Query:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        VT+KP+ VGFGIS+PEH +QV  WGAD  IVGSA VK L E  +PE+GL  + +F +SLK+AL+
Subjt:  VTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain2.1e-11880.97Show/hide
Query:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF +LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL
        ALF+YYNPIL+RG+EN+M  IK+AGV GL++PDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGFIYLVSSVGVTG R SV+ +VQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSA+VK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic2.2e-8658.67Show/hide
Query:  AAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELS
        AA    R+  +S+T   L  +GK AFIPYITAGDPDL+TTAEAL++L   G+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA GT   A++ ML+EV PELS
Subjt:  AAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELS

Query:  CPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQ
        CP+ L SYY PI+ R +      +K+AGV GL++PD+P      L  EA  +++ELVLLTTP  P+DRMK I +ASEGF+YLVS  GVTG RA+V+ RV+
Subjt:  CPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQ

Query:  TLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        +L++E+K+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADGVI+GSA+V+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  TLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic1.0e-12072.2Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAI-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG
        M IAF S   + F + P + + F   +   S    KRF PMA++ T+S  +GL++TF +LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELG
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAI-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG

Query:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        VPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +I+  GVQGLV+PDVPLEETE+LRKEA+ +DIELVL
Subjt:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSS+GVTGAR+SVS +VQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADGVIVGSA+VKLLG+AKSP EGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSAL
        ELE  TKSLKSAL
Subjt:  ELENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain7.3e-12272.2Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAI-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG
        M IAF S   + F + P + + F   +   S    KRF PMA++ T+S  +GL++TF +LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELG
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAI-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG

Query:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        VPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +I+  GVQGLV+PDVPLEETE+LRKEA+ +DIELVL
Subjt:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSS+GVTGAR+SVS +VQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADGVIVGSA+VKLLG+AKSP EGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSAL
        ELE  TKSLKSAL
Subjt:  ELENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.5e-11980.97Show/hide
Query:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF +LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL
        ALF+YYNPIL+RG+EN+M  IK+AGV GL++PDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGFIYLVSSVGVTG R SV+ +VQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSA+VK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCGCTTCAACAAAATACCCACTACTCCGCTCATCTTTCCCCCTCATACTTGTAAGATTTCAGTATTCCAAACCAAGCG
GTTCGCTCCAATGGCTGCCATTACAGCCTCCCGTGCTGTTGGACTGTCCGAAACATTTAACAAGTTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTCATCCCCTACATCACTGCTG
GTGATCCTGATCTTTCTACCACGGCTGAAGCGTTGAAGGTTCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGCCCT
GTTATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGGGACAAACTTTAGTGCAATAATTTCTATGCTGAAGGAGGTGATTCCTGAACTATCTTGCCCAATTGCCCTTTT
TTCATACTATAACCCGATTCTTAAGCGTGGCATTGAGAACTTCATGATGACAATTAAAGATGCTGGTGTACAGGGGCTTGTTATTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTG
AAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTGAAGCACGATATTGAATTGGTACTGTTAACTACACCGACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATTGTGGAAGCTTCGGAGGGATTC
ATATATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTCACCGGTGCCCGTGCATCAGTGAGTAATAGGGTTCAAACTCTCCTAGAGGAAATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGT
AGGTTTCGGTATCTCGAAACCTGAGCACGTGAAACAGGTGGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTCATCGTTGGCAGTGCTATAGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCAAGTCTC
CTGAAGAAGGATTGAAGGAATTAGAAAACTTCACCAAATCCCTAAAATCTGCACTCTCACAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAATACGCACCTCTATCACATACTACAGAATGTAAAAACCACGTCTAAAATAAAAAATAATTCACGAGATAACAATAAAATTCTATTTACCTAAAGAATAAAATAAATTG
GAAATTATGTATTTGTCATATCCAAACAAAAAACCGAAATTAGGCTCATCAAAACAAGCATTCGGCCGCCAATTTTTCTACTCCGTTTCTTGTAAACTCGAGAAAAATCA
ACAGAACAGTGATTGTCCAATCGCTATATGCTTGTTTTCGAACAAAACGAGGATCGCCCCAATGCGAGCTGCCTTCCTGTTTTGAAAACTGCGGCCGTTGAAAATCAAAA
CTGAACTGCTTAGGGTTAAATACAAGTCTCTTGTTTTGGAACTTTGAACTCAGCGAGCGAACCCAATCTCAATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCGCTTC
AACAAAATACCCACTACTCCGCTCATCTTTCCCCCTCATACTTGTAAGATTTCAGTATTCCAAACCAAGCGGTTCGCTCCAATGGCTGCCATTACAGCCTCCCGTGCTGT
TGGACTGTCCGAAACATTTAACAAGTTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTCATCCCCTACATCACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCTACCACGGCTGAAGCGTTGAAGG
TTCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGCCCTGTTATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGGG
ACAAACTTTAGTGCAATAATTTCTATGCTGAAGGAGGTGATTCCTGAACTATCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTCATACTATAACCCGATTCTTAAGCGTGGCATTGAGAA
CTTCATGATGACAATTAAAGATGCTGGTGTACAGGGGCTTGTTATTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTGAAGCACGATATTGAAT
TGGTACTGTTAACTACACCGACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATTGTGGAAGCTTCGGAGGGATTCATATATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTCACCGGTGCCCGT
GCATCAGTGAGTAATAGGGTTCAAACTCTCCTAGAGGAAATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGTAGGTTTCGGTATCTCGAAACCTGAGCACGTGAAACAGGT
GGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTCATCGTTGGCAGTGCTATAGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCAAGTCTCCTGAAGAAGGATTGAAGGAATTAGAAAACTTCACCAAAT
CCCTAAAATCTGCACTCTCACAATAAGATTTTTGATGGAATAAACCAGGCTGTTCCTTTCATCTCTATGTCTGCTAGTGGCTTTCAAAGATTTCTTTTTCCTTTCAACAG
AATAATAAGACTGTGAGTTCATATTTTCTTGGAAGGTATTTGCCATTGTTTAAGTTATTGTAATGAGAATATTTTCTAGTATTTTCTTTCAATGAATTCTGTTCAAAGCT
TTTCTTTTTCTTTTATCTTTTCTATTACTTTAATTAAATTGAAGTGACGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAITASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGP
VIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVQGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGF
IYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALSQ