; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g1686 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g1686
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionprotein SAMBA isoform X1
Genome locationMC06:24285364..24288586
RNA-Seq ExpressionMC06g1686
SyntenyMC06g1686
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136197.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucumis sativus]1.58e-6589.38Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQVVLS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKR+E NGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

XP_008466002.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X1 [Cucumis melo]1.52e-6387.61Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQV LS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKR KR+E NGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

XP_022131247.1 protein SAMBA isoform X1 [Momordica charantia]1.25e-71100Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKRREDNGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

XP_023553751.1 protein SAMBA isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.15e-6388.29Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQV++S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNG
        SKRQKR++DNG
Subjt:  SKRQKRREDNG

XP_038888367.1 protein SAMBA isoform X1 [Benincasa hispida]1.64e-6792.04Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MN+SSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMS+QGANC+AIPYQVV+S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKR+EDNGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQ80 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X17.34e-6487.61Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQV LS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKR KR+E NGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

A0A6J1BQF8 protein SAMBA isoform X16.04e-72100Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNGSD
        SKRQKRREDNGSD
Subjt:  SKRQKRREDNGSD

A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X23.04e-5197.75Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGAN
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG +
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGAN

A0A6J1HIC3 protein SAMBA isoform X16.04e-6387.39Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGANC+AIPYQV++S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNG
        SKRQKR++D+G
Subjt:  SKRQKRREDNG

A0A6J1HU80 protein SAMBA isoform X18.24e-6186.49Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS
        M +SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINL SRQGANC+AIPYQVV+S
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLS

Query:  SKRQKRREDNG
        SKR KR++DNG
Subjt:  SKRQKRREDNG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA8.8e-2262.5Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++DSWMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein6.2e-2362.5Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++DSWMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCAAATTT
AATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAGCTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAATCTTATGTCACGACAAGGTGCTAATTGCTATGCAATTCCCTATCAGGTGGTTCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAGAGAAGATAAT
GGGTCGGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCACCCAAGACTCAGGTTCGAACCGTCCAGTAATAAAAAGAAAATAAAATCGGGTCAGAATCGTCTGTTGCCACCGATTTCGCGTGAAGGAAGGAAGTGAGAGTCCCAA
TTGAACACGCTCGTAACTCCACTGATAATTCCGCCAACCACTTCAAATTACAGCACAAAATCCAATTCAAATTTCCTCTTCTCGTCTCCATCGCTGGATTTTTCCCTTCT
CGGACCTTCTCGTTGTATTTGGTGCCTCCATTGTTTCTAAACATTAATCAGGCTTCTGATTCGTGTATGGTTCTGGGGCTAAGTTCGTCGGAAAATTGGGGACGCAATGA
ATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCAAATTTAATT
TCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAGCTGGATGTTTGAAGG
TCCTCGCTCCCGTATCAATCTTATGTCACGACAAGGTGCTAATTGCTATGCAATTCCCTATCAGGTGGTTCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAGAGAAGATAATGGGT
CGGATTGATAAGACTGATTAAGAGATATTCACCCTGAAGACATCTTGTTATTGTGGTGGCTGGCACTGCGCCTGGACAACACTCGGTTTCATTAATCAAGTAATAGTTCT
TCTTTTCAAGTAACAATTTTTTCTTTAGGCATAAACGGTTTGAGAATGCTTGTCCAAATGCAATAATCTTGCTTACATAGGATTGCTAGGAAAACAAAAGATCTTACATC
TTAGATTGGCATTTTCTAGAGACAAATGTCCCAACATTGAAGTTATTAATGACTTGCTCGCTATAAACTTATAATACCTTGGCTAAGTCCATTATTACTTAGAGAAAGTT
GAAACACACAAAGAAGAAAAGGAAATGGTTGATTCAATCCATCCATTAGACATAGCACCTGATAGTTGACAATAACTGAAGATAACTGTATCATATTAGAACATCACATA
GGCCATAGCTGTACCAGTACCCAAATTGAAATTGTTTTGATTTTTAAAATACGAAATAATTGAATAGAAGACAATGAATGAATGGTTTGAGAGACAGGGTTGGATGGAAA
GAGGCAGATGTCTTGTTCCTCCCTCTTCAGTCTTCAACCGTTAGCTTTTTCCTCTTCCAATTTAGGGAGACTAGGAGAGTTATTACTTGTTGTAGAAATAAGCTGTTTCA
TATTTGAAAATTAAACTTGTTTTAGGAAGAACATAAATGGAATAGTAGTGTGACTTATAAATGGTAAAATTCTTACACATTTCATTAGGTTGCTTCCAAAAACATGTCAT
TCTGAAAAGAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAGAACTTGTGTAGGATTAGACTGAAAAAACTTGAAACTTGGACCAGGCTTCTACAGAAAACTTTTCAGTTTTCACTCTACT
GTACACAGCCATCAAATCATTAATAGGAGGATAATGCATAAAGTTCAATAATTCTTCATACCAAATGAAATTGTTAATCAATCACAATCACAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGANCYAIPYQVVLSSKRQKRREDN
GSD