; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g2137 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g2137
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL19
Genome locationMC06:28829510..28834063
RNA-Seq ExpressionMC06g2137
SyntenyMC06g2137
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016937.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.36e-11084.19Show/hide
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XP_038906882.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Benincasa hispida]4.99e-11686.3Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL191.66e-11586.32Show/hide
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A0A6J1DRG2 agamous-like MADS-box protein AGL192.69e-13799.53Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X14.44e-10983.26Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.33e-11083.72Show/hide
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A0A6J1I349 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X28.35e-10983.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC11.6e-5359.52Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL199.0e-6061.75Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL141.2e-5659.36Show/hide
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL421.6e-4856.04Show/hide
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 502.0e-5157.92Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 201.2e-5459.52Show/hide
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        VET+LFIG P
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 148.6e-5859.36Show/hide
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        +V T+LFIGPPE+R    F
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 196.4e-6161.75Show/hide
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T
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