CuGenDBv2

Gene ID	MC06g2162
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	ATP citrate synthase
Genome location	MC06:29031768..29038332
RNA-Seq Expression	MC06g2162
Synteny	MC06g2162
Gene Ontology terms	GO:0000166 - nucleotide binding (molecular function) GO:0003878 - ATP citrate synthase activity (molecular function) GO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain

Homology

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GenBank top hits

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A0A0A0LY92 ATP citrate synthase

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A0A1S3BNS4 ATP citrate synthase

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A0A6J1HYY6 ATP citrate synthase

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O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 3

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK  LG +VEM GCKA
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG FAVFQDLDFSF+EMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFKNFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTA FKNF KWG+IEFPLPFGRVLS TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT++PDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIM
        V+GPEATMTGICK+AIDCIM
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 3

2.8e-222

89.13

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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRLA IDL I SAQV +STDF EL N EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK  LGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKT+FLPTEK  T +ACAPLIATLPLE+R KIGDFI GV++VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTA FKNF KWGNI+FPLPFGRVLSP+ESF+H LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT++PDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKESKLKAARM+IYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAIDCIM+ A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2

2.1e-225

90.54

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK  LGV+VEMGGCKA
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVFAVFQDLDFSFLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFKNFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTA FKNF KWGNIEFPLPFGRVLS TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT++PDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAI+C+M+AA
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Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 1

1.5e-207

85.38

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK  LGV+VEMGGCKA
Subjt:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFAELTNNEPWLSSTRLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKIHLGVQVEMGGCKA

Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFL TEKP T +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVFAVFQDLDFSFLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFK-NFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELG
        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTA FK +  KWGNIEFPLPFGRVLS TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGG                 EL 
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFK-NFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELG

Query:  NYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPL
        NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT++PDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+
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Query:  EVFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA
        EV+GPEATMTGICKQAI+C+M+AA
Subjt:  EVFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA

Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 1

5.0e-203

80.61

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Query:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFAELTNNEPWLSSTRLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKIHLGVQVEMGGCKA
        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK  LG +VEM GCK 
Subjt:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFAELTNNEPWLSSTRLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKIHLGVQVEMGGCKA

Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
Subjt:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN

Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFKNFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTA FKNF KWG+IEFPLPFGRV+SPTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT+ PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI  I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-3

2.3e-224

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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK  LG +VEM GCKA
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG FAVFQDLDFSF+EMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFKNFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTA FKNF KWG+IEFPLPFGRVLS TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT++PDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIM
        V+GPEATMTGICK+AIDCIM
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIDCIM

AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-1

3.5e-204

80.61

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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK  LG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTA FKNF KWG+IEFPLPFGRV+SPTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT+ PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI  I +AA
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-1

3.5e-204

80.61

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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK  LG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTA FKNF KWG+IEFPLPFGRV+SPTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT+ PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI  I +AA
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AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-1

3.5e-204

80.61

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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK  LG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +F +FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTA FKNF KWG+IEFPLPFGRV+SPTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT+ PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI  I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA

AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-2

3.0e-203

79.91

Show/hide

Query:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFAELTNNEPWLSSTRLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKIHLGVQVEMGGCKA
        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+NQ TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK  LG +VEM GCK 
Subjt:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFAELTNNEPWLSSTRLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKIHLGVQVEMGGCKA

Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN
        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC+ISFSECGGI+IEENWDKVKTI +PT    T E CAPL+ATLPLEI+G++ DFI  +F +F+DLDF+FLEMN
Subjt:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLEIRGKIGDFIMGVFAVFQDLDFSFLEMN

Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFKNFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+G+PYPLDMRGELDDTA FKNF KWG+IEFP+PFGRV+S TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAGFKNFMKWGNIEFPLPFGRVLSPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT+ PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMR+LG+E+GVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSEPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI  I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIDCIMSAA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCAGGAAGAAGATTAGAGAGTATGACTCCAAGAGGCTTCTGAAGGAGCATCTCAAACGCCTCGCCAATATTGACCTCCAGATCTGCTCTGCTCAGGTAAATCAATC
GACTGACTTTGCTGAGCTGACAAATAATGAACCATGGTTGTCATCCACTAGGTTGGTAGTGAAACCGGACATGTTATTTGGGAAACGTGGAAAAAGTGGTTTGGTAGCTT
TGAATTTGGATCTAGCTCAAGTTGCCGAGTTTGTGAAGATACACCTTGGTGTGCAGGTTGAGATGGGTGGTTGCAAGGCCCCAATCACTACATTCATCGTTGAGCCATTT
GTTCCCCATGATCAAGAGTACTACCTATCTATTGTCTCTGAAAGGCTTGGCTGCACCATAAGTTTTTCAGAGTGTGGTGGTATTGAAATTGAAGAGAACTGGGATAAAGT
CAAGACTATTTTCCTTCCAACGGAAAAACCTTTTACACTTGAGGCGTGTGCTCCTTTAATAGCCACACTTCCTTTGGAGATTCGAGGAAAGATTGGTGACTTCATAATGG
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ACTGCTGGCTTCAAAAACTTTATGAAATGGGGAAACATTGAATTTCCACTGCCCTTTGGTCGAGTGCTAAGCCCTACAGAAAGCTTTGTCCACTCTTTAGATGAAAAGAC
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MC06g2162 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome