; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC06g2257 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC06g2257
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH69-like
Genome locationMC06:29812135..29816085
RNA-Seq ExpressionMC06g2257
SyntenyMC06g2257
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036370.1 Transcription factor bHLH69 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.67e-15079.29Show/hide
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XP_022995863.1 transcription factor bHLH69-like isoform X1 [Cucurbita maxima]8.26e-14877.58Show/hide
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XP_023533990.1 transcription factor bHLH69-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.17e-14778.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DMR9 transcription factor bHLH69-like isoform X21.65e-18094.98Show/hide
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A0A6J1DNA1 transcription factor bHLH69-like isoform X12.64e-18595.09Show/hide
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A0A6J1ESR3 transcription factor bHLH69-like2.76e-14477.06Show/hide
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A0A6J1K067 transcription factor bHLH69-like isoform X37.16e-14777.42Show/hide
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A0A6J1K988 transcription factor bHLH69-like isoform X14.00e-14877.58Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D0PX88 bHLH transcription factor RHL18.0e-1333.89Show/hide
Query:  GSDSSKPTDSRKNKAPGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLA----FALIY
        G+ +  P  S      G   + +    +RRG +TD      R RR RIAER++ALQEL+P ++K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV  ++     A + 
Subjt:  GSDSSKPTDSRKNKAPGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLA----FALIY

Query:  TVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEP--------LEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
         ++ D+S    GG    +      G G  +                  E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  TVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEP--------LEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

O22768 Transcription factor UNE121.5e-1133.52Show/hide
Query:  KPTDSRKNKAPGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQS
        +P       AP   +  R    +RRG +TD      R RR RIAER+ ALQEL+P  +K ++A+++D+++D+VK L+LQ+KV              LS S
Subjt:  KPTDSRKNKAPGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQS

Query:  KLGG-------------ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
        +LGG              SS E      G     + ++   +  E  V KL+E +  AA QLL++K L +MP+  A
Subjt:  KLGG-------------ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

Q8S3D5 Transcription factor LRL22.0e-1632.35Show/hide
Query:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSSSS--SRRG
        T W  +V   T P   +    T      A ++  +  +P S     D +      G   ++ P GS     T S+   +    G  ++P++     +RRG
Subjt:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSSSS--SRRG

Query:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE
         +TD      R RR RIAER+++LQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              LS S+LGG  S+S       G  H  +   
Subjt:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE

Query:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
         + +  E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

Q9LSQ3 Transcription factor LRL31.5e-1435.84Show/hide
Query:  APGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--
        AP +  KPR    +RRG +TD      R RR RIAER+++LQEL+P ++K ++AS+LD++I++V+ LQLQ+KV              LS S+LGG  S  
Subjt:  APGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--

Query:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
                         + P   + G G+            E+ V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

Q9ZUG9 Transcription factor LRL11.1e-1436.87Show/hide
Query:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD
        ++P  S      G ++ P   R+   +RRG +TD      R RR RIAER++ALQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              
Subjt:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD

Query:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
        LS S+LGG +S        G  H  +   M G               E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G24260.1 LJRHL1-like 18.0e-1636.87Show/hide
Query:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD
        ++P  S      G ++ P   R+   +RRG +TD      R RR RIAER++ALQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              
Subjt:  SKPTDSRKNKAPGILSKP---RSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQD

Query:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
        LS S+LGG +S        G  H  +   M G               E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  LSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQG------------EPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

AT4G02590.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.1e-1233.52Show/hide
Query:  KPTDSRKNKAPGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQS
        +P       AP   +  R    +RRG +TD      R RR RIAER+ ALQEL+P  +K ++A+++D+++D+VK L+LQ+KV              LS S
Subjt:  KPTDSRKNKAPGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQS

Query:  KLGG-------------ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
        +LGG              SS E      G     + ++   +  E  V KL+E +  AA QLL++K L +MP+  A
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AT4G30980.1 LJRHL1-like 21.4e-1732.35Show/hide
Query:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSSSS--SRRG
        T W  +V   T P   +    T      A ++  +  +P S     D +      G   ++ P GS     T S+   +    G  ++P++     +RRG
Subjt:  TEWTQNV--KTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSE--IHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAP---GILSKPRSSSS--SRRG

Query:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE
         +TD      R RR RIAER+++LQEL+P  +K ++AS+LD++ID+VK LQLQ+KV              LS S+LGG  S+S       G  H  +   
Subjt:  YSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGG-ESSSEPFRFVEGYGHYMSHQE

Query:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
         + +  E  V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  MQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

AT5G58010.1 LJRHL1-like 31.0e-1535.84Show/hide
Query:  APGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--
        AP +  KPR    +RRG +TD      R RR RIAER+++LQEL+P ++K ++AS+LD++I++V+ LQLQ+KV              LS S+LGG  S  
Subjt:  APGILSKPRSSSSSRRGYSTD------RQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESS--

Query:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA
                         + P   + G G+            E+ V KL+E D  +A Q L+ KGL LMP+  A
Subjt:  -----------------SEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFA

AT5G64980.1 unknown protein3.6e-2442.66Show/hide
Query:  SSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQELLPQSSKG-NQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQ
        S+ S + Y+ +R+R+ RIA+ ++AL +LLP   +G N    L+ ++DHVK L LQ              M++LS+S+LGGE  S P  F+EGYGHY+ H+
Subjt:  SSSSRRGYSTDRQRRIRIAERLEALQELLPQSSKG-NQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQ

Query:  EMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGSC
        +   + LEE++  LL  D  AAA LLE+KGL+L P+   +GSC
Subjt:  EMQGEPLEEMVGKLLEVDPSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGSC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AAAAGAAAAAGAAGTGGGCCTGTCGTGGTATTACGTACTGGTTTGCCGGCCCGGAACCAGCACGTAGGTAGAAGTAGAACTAGCTACCCGCGTCGTTCCCTCAACTCTCT
CTCTGTCTCTGCTCTGCTCTGCTCTGCTGTTGGCTGTTGCCATTTTCCTCTCGTCTTTCCCTTCAGACCCTCGTCTTCCCGGTTTCACCATTGTTATCCAAGTCACGACC
CAGGTAAAATGGAAGGACAAAATGGCTGCAACAACTCTGTACAAATTCTCTCAGTGAAACTTGGTGCGAATGTCAACATTGTTTCCCGTGTACCAGGAGATTGTACAAAC
CATCACCATGTTTTACCTGCTGATAGGAGTGTAAACCAAACCAACTTCCCCCTCTTAACTGAGTGGACACAAAATGTGAAAACAACTCCCACCTTTGTTGAGTTTATTGC
TGAAACTTCAAACTTTTCTAGAAAGGCGTCTACCAAAGAGATGTTAGCAAACGTTCCTTTCAGTACTATTGAAGCTGTTGATGGAGTCTCTGAGATTCATGGAGAATTTT
CATACAATCATCCCACAGGTTCAGACAGTTCGAAACCTACCGATTCACGCAAGAACAAGGCACCAGGTATACTATCCAAACCACGTTCCAGTTCATCAAGTCGAAGAGGC
TATTCAACTGATCGCCAACGCAGGATAAGGATAGCTGAAAGACTTGAAGCATTGCAGGAACTTCTTCCTCAGTCTTCAAAGGGAAATCAAGCATCTGTTTTGGATGATGT
TATTGACCACGTAAAGCACTTACAGCTTCAAATAAAGGTAGGCGGCCTGGCTTTTGCTCTCATCTATACGGTCATGCAGGACTTGAGTCAGAGCAAACTAGGAGGAGAAT
CATCTTCTGAGCCTTTTAGATTCGTTGAGGGATATGGTCACTACATGAGCCATCAAGAGATGCAGGGCGAACCACTTGAGGAGATGGTGGGAAAACTGCTGGAAGTTGAC
CCGTCAGCTGCAGCTCAGCTACTGGAGAACAAGGGCCTGTTTTTGATGCCCATGGATTTTGCTGAAGGATCATGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAGAAAAAGAAGTGGGCCTGTCGTGGTATTACGTACTGGTTTGCCGGCCCGGAACCAGCACGTAGGTAGAAGTAGAACTAGCTACCCGCGTCGTTCCCTCAACTCT
CTCTCTGTCTCTGCTCTGCTCTGCTCTGCTGTTGGCTGTTGCCATTTTCCTCTCGTCTTTCCCTTCAGACCCTCGTCTTCCCGGTTTCACCATTGTTATCCAAGTCACGA
CCCAGGTAAAATGGAAGGACAAAATGGCTGCAACAACTCTGTACAAATTCTCTCAGTGAAACTTGGTGCGAATGTCAACATTGTTTCCCGTGTACCAGGAGATTGTACAA
ACCATCACCATGTTTTACCTGCTGATAGGAGTGTAAACCAAACCAACTTCCCCCTCTTAACTGAGTGGACACAAAATGTGAAAACAACTCCCACCTTTGTTGAGTTTATT
GCTGAAACTTCAAACTTTTCTAGAAAGGCGTCTACCAAAGAGATGTTAGCAAACGTTCCTTTCAGTACTATTGAAGCTGTTGATGGAGTCTCTGAGATTCATGGAGAATT
TTCATACAATCATCCCACAGGTTCAGACAGTTCGAAACCTACCGATTCACGCAAGAACAAGGCACCAGGTATACTATCCAAACCACGTTCCAGTTCATCAAGTCGAAGAG
GCTATTCAACTGATCGCCAACGCAGGATAAGGATAGCTGAAAGACTTGAAGCATTGCAGGAACTTCTTCCTCAGTCTTCAAAGGGAAATCAAGCATCTGTTTTGGATGAT
GTTATTGACCACGTAAAGCACTTACAGCTTCAAATAAAGGTAGGCGGCCTGGCTTTTGCTCTCATCTATACGGTCATGCAGGACTTGAGTCAGAGCAAACTAGGAGGAGA
ATCATCTTCTGAGCCTTTTAGATTCGTTGAGGGATATGGTCACTACATGAGCCATCAAGAGATGCAGGGCGAACCACTTGAGGAGATGGTGGGAAAACTGCTGGAAGTTG
ACCCGTCAGCTGCAGCTCAGCTACTGGAGAACAAGGGCCTGTTTTTGATGCCCATGGATTTTGCTGAAGGATCATGCTGAACCGTATAATCAACCTGAACATTCTTATCA
TCTTATGTGCAACAATTCTGCTTCTGCTTTATTAAGTATGTAGGCCTTGTTAATGAACCGAAAGAACAGGTACCAGGTACGGCCTTGGTAACACTGAAAAAAAATAGTTA
TGTTGATCTGTAGCATCCAGTTGAAGTTGGAAAAGACCATGCAAGTGAGATGGAGGAATATCATAGCAATGTAGTTTTTGACACTCCATTTATTATCTCTTATATTCTGA
CCAAACTTGCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
KRKRSGPVVVLRTGLPARNQHVGRSRTSYPRRSLNSLSVSALLCSAVGCCHFPLVFPFRPSSSRFHHCYPSHDPGKMEGQNGCNNSVQILSVKLGANVNIVSRVPGDCTN
HHHVLPADRSVNQTNFPLLTEWTQNVKTTPTFVEFIAETSNFSRKASTKEMLANVPFSTIEAVDGVSEIHGEFSYNHPTGSDSSKPTDSRKNKAPGILSKPRSSSSSRRG
YSTDRQRRIRIAERLEALQELLPQSSKGNQASVLDDVIDHVKHLQLQIKVGGLAFALIYTVMQDLSQSKLGGESSSEPFRFVEGYGHYMSHQEMQGEPLEEMVGKLLEVD
PSAAAQLLENKGLFLMPMDFAEGSC