CuGenDBv2

Gene ID	MC07g0083
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	ASCH domain-containing protein
Genome location	MC07:1514658..1524390
RNA-Seq Expression	MC07g0083
Synteny	MC07g0083
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR015947 - PUA-like superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

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XP_022145213.1 uncharacterized protein LOC111014716 isoform X2 [Momordica charantia]

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XP_022145214.1 uncharacterized protein LOC111014716 isoform X3 [Momordica charantia]

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A0A1S3CBK8 uncharacterized protein LOC103498964 isoform X1

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A0A5D3DMP1 RNA-binding ASCH domain protein, putative isoform 1

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A0A6J1CUK1 uncharacterized protein LOC111014716 isoform X3

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A0A6J1CVC4 uncharacterized protein LOC111014716 isoform X2

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A0A6J1CVP0 uncharacterized protein LOC111014716 isoform X1

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

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AT2G43465.1 RNA-binding ASCH domain protein

1.8e-109

50.9

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        I ++DC+ E++ F L   +    +FD+GL+G FCS LL      HD     S+S  L H  +GVP YPLYK LA  L +S+ SG+FC  + ++S+     
Subjt:  IPMKDCVAELLMFILQSSIKGTLDFDLGLSGGFCSALL-----QHD----PSTSNPLSHFTAGVPPYPLYKRLASALWESLCSGTFCPNYRRMSMMTGES

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         LK+KE EW KLI  KG E+V  LK V  EL V EP F+ +KDG K++EA+    +YDR+   G ++M NKCL+FE+ ++ +Y SF ++L++E+ + + P
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        G ++++EG+Q+ + L   D+E  + V+AI +S    QP ++ A I+SGLSY G+Q LLGL+HTTG++  ALPPPRS LLSSFM+PYKP+ KG +L+ GA+
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        ALAKH  RSS  +WG   G D DKN+ AM+ I   I +CCW+NIHIVPPHG VFEIR+A+GYGARWS+DG KFIGFLEPYMEDGH   WKH
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AT3G03320.1 RNA-binding ASCH domain protein

2.0e-36

35.97

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        G   + +++C+  LL F L+S +  ++  FDL L+  FC  L          L   T       +YK LA+AL E L S               E     
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          +++ KLI   G +++ +LK V  EL+V EP+FTQLKDG K++E +  +G Y R+  G  ++FNKCL+ E+ DV RY SFS+ML+ E L  +LPGVESI
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Query:  DEGLQIIKYLNIEDEEMADCVLAICISSVPFQPYISFASIISGLSYEGLQALL
        +EG+Q+ +    E++E  + V+AI ++    QP  + A ++S L   G+++LL
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Sequences

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TCTAGGTTTGACACATACCACAGGAACGGTTGCTGATGCGCTTCCCCCACCAAGATCAGCTCTTTTATCATCATTTATGATTCCATATAAACCCGAGGGTAAAGGCATAA
AGTTGACTATTGGAGCTAAGGCCTTGGCAAAGCACCACCATAGATCCAGCTCTAAATATTGGGGTACTTGTGATGGAAATGATTATGATAAGAATAAGCTTGCTATGAAT
AGCATTCTTGACTTGATAGCTCATTGTTGCTGGTTGAATATTCATATTGTTCCACCACATGGGATAGTTTTCGAGATAAGAATAGCAGAAGGGTATGGTGCCAGATGGTC
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mRNA sequence

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AGTCAAGTAAAATTATCATCTTTAATCTCTCTCTTGACGCTTATATGAAAGATTGTGAAGAGATTATTTCTTTGAAGGGCTGCAGAGAATTGCTTTGATAAGCTTGTGCT
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ATATCCTTTATACAAGCGTTTAGCATCAGCTTTGTGGGAATCCCTGTGTTCTGGCACCTTCTGTCCAAATTATAGGAGAATGTCAATGATGACTGGAGAAAGTTCTTTGA
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CTCGGATGTTCGCCGGTATGTGTCATTTTCTGATATGTTGGAGTCTGAAAATCTTCAAAGCATTCTGCCTGGCGTTGAAAGCATAGACGAAGGTTTGCAAATTATAAAAT
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AGAATAAGCTTGCTATGAATAGCATTCTTGACTTGATAGCTCATTGTTGCTGGTTGAATATTCATATTGTTCCACCACATGGGATAGTTTTCGAGATAAGAATAGCAGAA
GGGTATGGTGCCAGATGGTCAAAAGATGGAAACAAGTTCATTGGATTTCTGGAGCCATACATGGAAGATGGACATTTGAAGGGATGGAAGCACTAATCTTCCTTTGAAGA
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CTTTTCATTACTATACAATGGCCGCAGTTTAGATGGGTTAGATACATATCTTTAAATTATAAAGTTCATTTTATTCCGTCCTTGAAGTAATATGCTTGTATCTCTAATTT
AGAAGTATATATTATTATCGGGTAAACTCAAGGTGCCACGTGTCACGGTCATACATTTTTCAACTGCGCGGCGTCATGATCTAAGCTCGACCATGCCCAGCCTTACGAGG
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TCGGCCACTCGGCCCTCCCG

Protein sequence

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EMADCVLAICISSVPFQPYISFASIISGLSYEGLQALLGLTHTTGTVADALPPPRSALLSSFMIPYKPEGKGIKLTIGAKALAKHHHRSSSKYWGTCDGNDYDKNKLAMN
SILDLIAHCCWLNIHIVPPHGIVFEIRIAEGYGARWSKDGNKFIGFLEPYMEDGHLKGWKH

MC07g0083 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome