; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC07g0268 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC07g0268
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP62
Genome locationMC07:9294874..9315880
RNA-Seq ExpressionMC07g0268
SyntenyMC07g0268
Gene Ontology termsGO:0006913 - nucleocytoplasmic transport (biological process)
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InterPro domainsIPR007758 - Nucleoporin, NSP1-like, C-terminal
IPR026010 - Nucleoporin NSP1/NUP62


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022142426.1 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X1 [Momordica charantia]3.33e-27185.47Show/hide
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XP_022156652.1 nuclear pore complex protein NUP62, partial [Momordica charantia]8.51e-314100Show/hide
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XP_023548092.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.65e-24684.87Show/hide
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XP_038874708.1 nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida]1.23e-24684.88Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CM51 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X11.61e-27185.47Show/hide
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A0A6J1CMQ9 nuclear pore complex protein NUP62-like isoform X21.02e-28193.53Show/hide
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A0A6J1DSI7 nuclear pore complex protein NUP624.12e-314100Show/hide
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A0A6J1H5C8 nuclear pore complex protein NUP62 isoform X16.57e-24684.5Show/hide
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        S PLFG+SAPTA+PGS++ GAS AASGS                    S++ FGSN F +SSS     LF SS SSAST+ FQNSFSSSSSQ+LSSSSPF
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Query:  AASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSAS
        AASSS GFSF TTSLSKTT S+TA+SSSS LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFS SNAAST  S+APGTTA KPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSAS
Subjt:  AASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSAS

Query:  TPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSG
        TP A+ST QPSFS+PAFSLSSSAATT+S AASS PS  SSGAASSFTGFGVT+TA+SSS IVSLSLPTK+LTAASSSQ PASFGF SL  ASTAATT+SG
Subjt:  TPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSG

Query:  FSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAE
         +A SQSQTSSTLV+ASSSSGTTSTVS  VS TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ E
Subjt:  FSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAE

Query:  LERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
        LE+KLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
Subjt:  LERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN

Query:  QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS
        QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AATQGPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS

A0A6J1L2D4 nuclear pore complex protein NUP626.21e-24684.87Show/hide
Query:  STPLFGSSAPTATPGSALPGASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGT----SSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSSPF
        S PLFG+SAPTA+PGS++ GAS AASGS            S+LFG    +NSF S++ GT    S+S LF SS SSAST+ FQNSFSSSSSQ+LSSSSPF
Subjt:  STPLFGSSAPTATPGSALPGASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGT----SSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSSPF

Query:  AASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSAS
        AASSS GFSF TTSLSKTT S+T +SSSS LTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGF+ SNAAS   S+APGTTA KPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSAS
Subjt:  AASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSAS

Query:  TPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSG
        TP A+ST QPSFS+PAFSLSSSAATT+S AASS PSA SSGAASSFTGFG+T+TA+SSS IVSLSLPTK+LTAASSSQ PASFGF SL SAS AATT+SG
Subjt:  TPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSG

Query:  FSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAE
         +A SQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSA VS TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQ E
Subjt:  FSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAE

Query:  LERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
        LE+KLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN
Subjt:  LERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNN

Query:  QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS
        QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+AATQGPAADRELLGQKFWMS
Subjt:  QLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
G0SBQ3 Nucleoporin NSP11.0e-1129.44Show/hide
Query:  LFGSSAPTATPG-SALPGASVAASGSLFG--TASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSAS-TSSFQNS-----FSSSSSQSLSSSS
        LFGS   T + G S+   A+ A SGSLFG  TA++ GS+       P ST  FG ++  T+S  LF S+ + A+ TS  Q +     F S  S + + + 
Subjt:  LFGSSAPTATPG-SALPGASVAASGSLFG--TASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSAS-TSSFQNS-----FSSSSSQSLSSSS

Query:  PFAASSSSG----FSFPTTSLSKT------TNSVTASSSSSPLTSA-----STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSF
        P  A+ ++G     S P T+ + T      T++ T   SS+PL  A     ST++++    TPA+SA  S+    F  A  T +SA   +T+T   + S 
Subjt:  PFAASSSSG----FSFPTTSLSKT------TNSVTASSSSSPLTSA-----STSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSF

Query:  STSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFS-VPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPAS
          +  PLF    TTSA     ++ T   FS  PA + ++ ++T  ST   + P+  ++ AASS         A++S+P +  S P  T TA +S  P  +
Subjt:  STSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFS-VPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPAS

Query:  FGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAA-VSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNR
            + P++++A  T++       S T+ST      +  TT+ + A+ V    +LP  +  KT++EII  W  +L +   +F++QA  + EWDR +++N 
Subjt:  FGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAA-VSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNR

Query:  DILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN---
        + + +L     +      E+ER+L  +E+ Q+E+   L   E + + +Y  + G    ++AA     R+  Y+ AE +  +L++M + +  +I+ +N   
Subjt:  DILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN---

Query:  --ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKIAATQG
           ++G + D      PL  +VR+LN  L+ L WID  A    +++   QK A + G
Subjt:  --ANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKIAATQG

P17955 Nuclear pore glycoprotein p622.6e-0729.03Show/hide
Query:  GASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLS-SSSPFAASSSSGFSF----PTTSLSKT
        G    A G  FGTA ++ +  +  F    S    G   FGT S      + ++ STS F  +  +S++Q+   +     AS  +GFS     P  SLS T
Subjt:  GASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLS-SSSPFAASSSSGFSF----PTTSLSKT

Query:  TNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFS
          +   +++ S    +ST +++ S G   SS   +  GF F   +ST ++ + GTT    TS S S   A  F+  +  S + P A S    S   PA  
Subjt:  TNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFS

Query:  LSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFP-SLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVAS
         +++A  T    A++TP+AA++ A S+         ASSS+ ++SLS P  T    ++     S   P + P AST +TT++         T++T   AS
Subjt:  LSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFP-SLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVAS

Query:  SSSGTTSTVSAAVSTTPKLPS-----------------------EITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKV
        +SS TT+T   A+S  P +P+                        +T   +E +I +W+ EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L  EV KV
Subjt:  SSSGTTSTVSAAVSTTPKLPS-----------------------EITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKV

Query:  VETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAV
           Q  L+++L+ I + Q+E++  L  +EE      K++ G +    A   R+  Y+ AE I+ +L++M + +K II+ LN   GG  D  D   PL  +
Subjt:  VETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAV

Query:  VRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
         +ILN  + SL W+D+ +     R+++
Subjt:  VRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK

P37198 Nuclear pore glycoprotein p625.3e-0827.82Show/hide
Query:  GASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVT
        G      G  FGTA ++ +  +   G   ST+  G   FG      F  + S+ ST  F          SL++ +P  A+ ++GF+F T +L+      +
Subjt:  GASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVT

Query:  ASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSF---STSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPS-FSV-----
            +S L  ++T++      TPA  A+ S FG   SN  +  +S    +  T PT   F   +TSVAP     TT+   +    ST QPS F++     
Subjt:  ASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSF---STSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPS-FSV-----

Query:  ------PAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTG---FGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPS
              PA    + A    +TA ++ P+A +  A  + TG   F    TA +SS    LSL T   TA + +     F   +  +AS  +TT+S  +  +
Subjt:  ------PAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTG---FGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPS

Query:  QSQTSSTLVVA-------SSSSGTTSTVSAAVSTTP--------KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIE
         + TSS+            + +G  S  +AAV+  P           S +T   +E +I +W+ EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L  E
Subjt:  QSQTSSTLVVA-------SSSSGTTSTVSAAVSTTP--------KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIE

Query:  VAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP
        V KV   Q  L+++L+ I + Q+E++  L  +EE    + K++ G +    A   R+  Y+ AE I+ +L++M + +K II+ LN + G   D  D   P
Subjt:  VAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP

Query:  LDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI
        L  + +ILN  + SL WID+ +     +++++
Subjt:  LDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI

Q63850 Nuclear pore glycoprotein p622.9e-0628.33Show/hide
Query:  GASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLS-SSSPFAASSSSGFSF----PTTSLSK-
        G    A G  FGTA ++ +  +  F    S    G   FGT S      + ++ STS F  +  + ++Q+   +     AS  +GFS     P  SLS  
Subjt:  GASVAASGSLFGTASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLS-SSSPFAASSSSGFSF----PTTSLSK-

Query:  -----TTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSF
             T N+ +    SS LT+A +S S+ + GT  +       GF F   +ST ++ + G+T    TS S S   A  FS  +  S++ P A S    S 
Subjt:  -----TTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSF

Query:  SVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSST
          PA  ++++A  T   AA+ T +  S+G+    T F     A +SS    LSLP    TAA+ S     F   +  +A  A+TTS+  +  + + T++ 
Subjt:  SVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPASFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSST

Query:  LVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPK------LPSE-----------ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVV
           +++++G   ++   VS  P       LP+            +T   +E +I +W+ EL+++   F +QA  +  WDR +++N + +  L  EV KV 
Subjt:  LVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPK------LPSE-----------ITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVV

Query:  ETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVV
          Q  L+++L+ I + Q+E++  L  +EE      K++ G +    A   R+  Y+ AE I+ +L++M + +K II+ LN   GG  D  D   PL  + 
Subjt:  ETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVV

Query:  RILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
        +ILN  + SL W+D+ +     R+++
Subjt:  RILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK

Q8L7F7 Nuclear pore complex protein NUP621.8e-10455.79Show/hide
Query:  STPLFG--SSAPTATPGSALPGASVAASGSLFG---------TASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQ----NSFSSS
        ++PLFG  SSA  ATP  ++  ++  +S S+FG          ASS+  +  ++FGA  S+  FGS++   S+  LFASS S A+TSS      ++F+SS
Subjt:  STPLFG--SSAPTATPGSALPGASVAASGSLFG---------TASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQ----NSFSSS

Query:  SSQSLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAP
        S+ + S++S    S+S+GFSF    L  T +S T+S++ S     ++SSSSFSFGT A+S      GF+     ST +SAAP   A+  +   FS     
Subjt:  SSQSLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAP

Query:  LFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQP----PA-
          +T TTTS+STP A  T+ P+ S PA +++  +    S+A ++TP  ASS A  S TGFG+   T    S++     ++P KT T ASSSQP    PA 
Subjt:  LFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQP----PA-

Query:  SFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNR
        SF  PS  S +  AT+S+       + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RILQNR
Subjt:  SFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNR

Query:  DILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGE
        D+LLRLEIEVAKVVETQ+ LER+LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGE
Subjt:  DILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGE

Query:  LDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS
        L+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI A QG   DREL+  K WMS
Subjt:  LDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45000.1 structural constituent of nuclear pore1.3e-10555.79Show/hide
Query:  STPLFG--SSAPTATPGSALPGASVAASGSLFG---------TASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQ----NSFSSS
        ++PLFG  SSA  ATP  ++  ++  +S S+FG          ASS+  +  ++FGA  S+  FGS++   S+  LFASS S A+TSS      ++F+SS
Subjt:  STPLFG--SSAPTATPGSALPGASVAASGSLFG---------TASSSGSAGSALFGAPLSTNSFGSNTFGTSSSGLFASSISSASTSSFQ----NSFSSS

Query:  SSQSLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAP
        S+ + S++S    S+S+GFSF    L  T +S T+S++ S     ++SSSSFSFGT A+S      GF+     ST +SAAP   A+  +   FS     
Subjt:  SSQSLSSSSPFAASSSSGFSFPTTSLSKTTNSVTASSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNAASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAP

Query:  LFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQP----PA-
          +T TTTS+STP A  T+ P+ S PA +++  +    S+A ++TP  ASS A  S TGFG+   T    S++     ++P KT T ASSSQP    PA 
Subjt:  LFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFSLSSSAATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGV---TNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQP----PA-

Query:  SFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNR
        SF  PS  S +  AT+S+       + T +TLVV SSS   TST  A V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERTG+FRKQANAIAEWD+RILQNR
Subjt:  SFGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNR

Query:  DILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGE
        D+LLRLEIEVAKVVETQ+ LER+LELIETHQQEVDKAL S+EE+AERIY DER  LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGGE
Subjt:  DILLRLEIEVAKVVETQAELERKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGE

Query:  LDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS
        L+ IDGM+PLD VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI A QG   DREL+  K WMS
Subjt:  LDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKIAATQGPAADRELLGQKFWMS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGTACTCCATTGTTTGGCTCATCTGCACCCACTGCAACTCCGGGATCAGCTTTGCCTGGCGCATCTGTTGCCGCTTCTGGTTCTCTGTTTGGGACAGCTTCATCTTCAGG
AAGTGCAGGCTCAGCTTTGTTTGGGGCTCCGTTATCCACGAACAGTTTTGGGTCAAATACCTTCGGTACATCTTCATCGGGCTTGTTTGCGTCATCTATATCATCGGCAT
CGACCTCTTCGTTCCAGAACTCTTTTTCTTCGAGTTCTTCCCAGAGTTTAAGTTCGTCTTCACCATTTGCGGCTTCTTCTTCTTCTGGATTTTCATTTCCGACCACTTCT
TTGTCCAAAACTACTAATAGTGTCACTGCATCTTCTTCTTCTTCCCCTCTTACATCAGCTTCAACTAGTTCGTCGAGCTTCTCATTTGGAACACCTGCTTCCTCAGCGTC
TCAATCTTCCTTCGGGTTTAGTTTTAGCAATGCAGCATCAACAGCAGCGTCTGCTGCTCCAGGGACTACTGCGACAAAGCCTACTTCTCTATCATTTTCGACTTCCGTGG
CACCTTTATTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGTTGCTAGTAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTTGAGTTCTTCAGCTGCT
ACTACGATATCCACAGCAGCATCCTCCACTCCCTCAGCTGCTTCCTCAGGTGCTGCAAGTTCATTTACAGGTTTTGGTGTCACAAACACAGCTTCTTCATCAAGTCCAAT
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