; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC07g0710 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC07g0710
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RHF1A-like isoform X2
Genome locationMC07:14913748..14917217
RNA-Seq ExpressionMC07g0710
SyntenyMC07g0710
Gene Ontology termsGO:0009561 - megagametogenesis (biological process)
GO:0010498 - proteasomal protein catabolic process (biological process)
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GO:0051726 - regulation of cell cycle (biological process)
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GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023549293.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.03e-17674.93Show/hide
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A0A6J1CAQ5 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A-like isoform X13.68e-24899.44Show/hide
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A0A6J1CAZ3 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A-like isoform X23.57e-250100Show/hide
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A0A6J1CCF2 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A-like isoform X39.94e-23395Show/hide
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A0A6J1H5S5 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A isoform X16.71e-17574.93Show/hide
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A0A6J1L048 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A isoform X11.17e-17575.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2HIJ8 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A2.1e-0945.45Show/hide
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Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A2.8e-5442.42Show/hide
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        V+RE++AGIAGVARM ER+D +SKR   S  + +      G + S KGK V   S   ++ +K
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Q8LE94 E3 ubiquitin-protein ligase At3g022904.7e-0946Show/hide
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        + ED C  CL+ +TS NP  VT C H +HL CI +W +RS  CP+C +++
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Q93ZF6 E3 ubiquitin-protein ligase AIRP11.5e-0747.06Show/hide
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        D C ICL+ +   NP  +T C H++HL CIL W +RS  CP+C + LVL +
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Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A7.2e-4237.14Show/hide
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        D  +DAC ICL+ F   +P T+T CKHEYHLQCIL+W QRS++CP+C Q + LKDP  QEL+ A+  ER  +     +A         +F++ H     D
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        +++ ++ I+QHLAAAA+  RAR+  R E  R   S +G  Q       P    P    P+  SPS      ++S     AL   G H  N    T ++  
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Query:  KISPRAL------LTETSSGSQQKTNQSEGLSFPDSIKSKISSTSTKYKESIWRSTKGIKEKLLARNSSVKDLSRGVKREVSAGIAGVARMFERLDL--T
        ++SP A       L ++S   Q +   SE  SF +S+KS++++ ST+YKESI ++T+  K++L +RN+S+ DL   VKREVSAGIA V+RM ERL+    
Subjt:  KISPRAL------LTETSSGSQQKTNQSEGLSFPDSIKSKISSTSTKYKESIWRSTKGIKEKLLARNSSVKDLSRGVKREVSAGIAGVARMFERLDL--T

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        S+ + ASV+  S N     +++          + +   +   C TGS SS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G14220.1 RING-H2 group F1A2.0e-5542.42Show/hide
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        S F+     PF+P I    S  +     SDDD  ++DAC ICL+PFT  +P TVT CKHEYHLQCI++WSQRS ECPIC QL VL+DP  QEL+ A+  E
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        R+LK+R++SS++  S+  H + D   +   S  S FD+  ++HL  AA R   + R + Q       S +        L   Y+   +S       +  P
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Query:  SPGSISEFHVQALSSVGLHDGNEFSRTGTNKISPRALLTETSSGSQQKTNQSEGLSFPDSIKSKISSTSTKYKESIWRSTKGIKEKLLARNSSVKDLSRG
        SPGS++   V   SS+   D N  SR     ISP      + S S Q     E  S P++IKSK+++ S KYKESI +S +G+KEKLLARN+SVK+LS+G
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        V+RE++AGIAGVARM ER+D +SKR   S  + +      G + S KGK V   S   ++ +K
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AT5G22000.1 RING-H2 group F2A5.1e-4337.14Show/hide
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        +++ ++ I+QHLAAAA+  RAR+  R E  R   S +G  Q       P    P    P+  SPS      ++S     AL   G H  N    T ++  
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        ++SP A       L ++S   Q +   SE  SF +S+KS++++ ST+YKESI ++T+  K++L +RN+S+ DL   VKREVSAGIA V+RM ERL+    
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        S+ + ASV+  S N     +++          + +   +   C TGS SS
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AT5G22000.2 RING-H2 group F2A5.1e-4337.14Show/hide
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AT5G22000.3 RING-H2 group F2A5.1e-4337.14Show/hide
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AT5G38895.1 RING/U-box superfamily protein5.2e-1140.68Show/hide
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        + +D D ED C  CLD +T  NP  +T C H +HL CI +W +RS  CP+C +++   +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCCATTTTCTCCATTCATTTGCCGGCCCCCCTCTCCCATGGCGGATTTCACTTCCGATGACGATTCTGAAGACGCCTGCTGCATCTGCCTCGACCCCTTCACCTCCCACA
ACCCTCCCACTGTTACCTGTTGCAAGCATGAATATCATCTCCAATGTATTCTTGATTGGTCTCAAAGAAGCAATGAATGCCCAATATGTTGCCAGTTGCTAGTGTTGAAG
GATCCTGTTGGCCAGGAGCTTATAATGGCCATGGCTAGTGAAAGGATTTTAAAGTCAAGAAGCATGTCTTCTGCTGCATCCACTTCTCTGCGATTCCATGAAAACTTTGA
TGTTGACCACGACTCCTCTCACTCGGATGACTCTGACTTTGATGACCTGATTATGCAGCATCTTGCTGCTGCAGCTAGCAGAGCTCGGTATGTTCATAGAAGCGAGAGGC
AAAGGCATTTTGTATCTCCAGAAGGGGTTCCCCAGCAAACATGCCCATTGTCGCCTCGATATCAGGATCCAACTCTAAGTTCACCTATTAGTGATTCACCATCTCCTGGT
TCCATATCTGAGTTTCATGTTCAAGCTTTGTCATCTGTGGGCCTCCATGATGGCAATGAGTTCTCAAGAACTGGAACTAATAAAATATCGCCCAGGGCTTTACTGACTGA
GACGTCATCTGGTAGTCAACAGAAAACAAACCAATCTGAGGGGCTCTCTTTCCCTGATTCCATCAAATCCAAAATTTCTTCTACTTCCACGAAGTACAAGGAATCAATCT
GGCGAAGCACTAAAGGTATTAAGGAGAAACTGCTTGCTCGTAACAGCTCCGTGAAGGATCTAAGCAGAGGTGTAAAGCGCGAAGTGAGTGCCGGGATTGCTGGTGTTGCT
CGAATGTTTGAGCGTCTAGATTTGACTTCAAAAAGGAATGCTGCATCTGTTGCTCTTTTCAGTTGCAATGGGGGTACATCAAAATCCTCGAAAGGAAAGAACGTAGTGCA
AGAGAGTGCTGTCACAGATGATTCAAATAAAATACATAGAATCTGTACTGGTTCACCCTCATCACAGGTTTCCCCTACTGTTCCAAGCTCAGTCGAAGTTTCTCCTTCTC
AGAGAGGAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTAATAGTGAAAAAAAAAAAAAGAAATTGGGAAGTTCAGAGAAAGCAGAGCAGACTAGTTCCACTCCACCAAACCGTTTCCGTTTCTCCCCATTTCATCCTCCTCAAATC
CCCCCATTTTCTCCATTCATTTGCCGGCCCCCCTCTCCCATGGCGGATTTCACTTCCGATGACGATTCTGAAGACGCCTGCTGCATCTGCCTCGACCCCTTCACCTCCCA
CAACCCTCCCACTGTTACCTGTTGCAAGCATGAATATCATCTCCAATGTATTCTTGATTGGTCTCAAAGAAGCAATGAATGCCCAATATGTTGCCAGTTGCTAGTGTTGA
AGGATCCTGTTGGCCAGGAGCTTATAATGGCCATGGCTAGTGAAAGGATTTTAAAGTCAAGAAGCATGTCTTCTGCTGCATCCACTTCTCTGCGATTCCATGAAAACTTT
GATGTTGACCACGACTCCTCTCACTCGGATGACTCTGACTTTGATGACCTGATTATGCAGCATCTTGCTGCTGCAGCTAGCAGAGCTCGGTATGTTCATAGAAGCGAGAG
GCAAAGGCATTTTGTATCTCCAGAAGGGGTTCCCCAGCAAACATGCCCATTGTCGCCTCGATATCAGGATCCAACTCTAAGTTCACCTATTAGTGATTCACCATCTCCTG
GTTCCATATCTGAGTTTCATGTTCAAGCTTTGTCATCTGTGGGCCTCCATGATGGCAATGAGTTCTCAAGAACTGGAACTAATAAAATATCGCCCAGGGCTTTACTGACT
GAGACGTCATCTGGTAGTCAACAGAAAACAAACCAATCTGAGGGGCTCTCTTTCCCTGATTCCATCAAATCCAAAATTTCTTCTACTTCCACGAAGTACAAGGAATCAAT
CTGGCGAAGCACTAAAGGTATTAAGGAGAAACTGCTTGCTCGTAACAGCTCCGTGAAGGATCTAAGCAGAGGTGTAAAGCGCGAAGTGAGTGCCGGGATTGCTGGTGTTG
CTCGAATGTTTGAGCGTCTAGATTTGACTTCAAAAAGGAATGCTGCATCTGTTGCTCTTTTCAGTTGCAATGGGGGTACATCAAAATCCTCGAAAGGAAAGAACGTAGTG
CAAGAGAGTGCTGTCACAGATGATTCAAATAAAATACATAGAATCTGTACTGGTTCACCCTCATCACAGGTTTCCCCTACTGTTCCAAGCTCAGTCGAAGTTTCTCCTTC
TCAGAGAGGAGATTGATTTGTGGATGTTATGATTTGACTCATCTAAGTGAACATCTTATCAACTCGACTCGGCAGAATGCATACTATGGCAAGCGACGTAGAATGACTTA
ACCAACATCCTCGTTGGTTTGCGTCCTGCATTTTCTTTTTTCTTCTTCAATATATAAATAACTCTAGCTCTACTAATGAAAAAGGCGTAATTTTCGAGTATTTCGAAATA
TATTTTATGTAATGTTGATGTTGTGCTTCATGATACTCTATTTATATGTGGATGAGTTTCTTTCTATCTCTTTGGGATCGAGGCTGGGAGTTTTAGCTAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
NSEKKKKKLGSSEKAEQTSSTPPNRFRFSPFHPPQIPPFSPFICRPPSPMADFTSDDDSEDACCICLDPFTSHNPPTVTCCKHEYHLQCILDWSQRSNECPICCQLLVLK
DPVGQELIMAMASERILKSRSMSSAASTSLRFHENFDVDHDSSHSDDSDFDDLIMQHLAAAASRARYVHRSERQRHFVSPEGVPQQTCPLSPRYQDPTLSSPISDSPSPG
SISEFHVQALSSVGLHDGNEFSRTGTNKISPRALLTETSSGSQQKTNQSEGLSFPDSIKSKISSTSTKYKESIWRSTKGIKEKLLARNSSVKDLSRGVKREVSAGIAGVA
RMFERLDLTSKRNAASVALFSCNGGTSKSSKGKNVVQESAVTDDSNKIHRICTGSPSSQVSPTVPSSVEVSPSQRGD