; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC07g0764 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC07g0764
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase Topors
Genome locationMC07:15339972..15341371
RNA-Seq ExpressionMC07g0764
SyntenyMC07g0764
Gene Ontology termsGO:0000209 - protein polyubiquitination (biological process)
GO:0006513 - protein monoubiquitination (biological process)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR017907 - Zinc finger, RING-type, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593954.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.99e-14678.87Show/hide
Query:  IMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNC
        IM  +TREP RKL  ENFV KVISPAICGETCPICLREL+D T AVLT+CIHAYCV CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWFSKI  SS SFRKE LP LNC
Subjt:  IMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNC

Query:  VDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKI
         D L  G+GSSR D+RR+LQ  RNEL+R RRSE PLTWRRSFGRRG E VP DVIA RKLQWRASIY+R IQA PSSVR    +N++GSHG KEAILE+I
Subjt:  VDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKI

Query:  KPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        KPWIQREL+AIL DPDPTIIVHLVTSLFV+RLEAPSSQLN E+DFL  L PFLYEKTDLFWHELR
Subjt:  KPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

XP_022138780.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors [Momordica charantia]3.17e-192100Show/hide
Query:  MKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCV
        MKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCV
Subjt:  MKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCV

Query:  DKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIK
        DKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIK
Subjt:  DKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIK

Query:  PWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        PWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
Subjt:  PWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

XP_022999966.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X1 [Cucurbita maxima]5.97e-14877.78Show/hide
Query:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL
        +++ +IMK +T EP RKLN ENFV KVISPAICG+TCPICLREL+D T AVLT+CIHAYCV CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWF KIN SS SFRKE L
Subjt:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL

Query:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA
        P LNC D L  G+GSSR D+RR+LQ  RNEL+R RRSE PLTWRRSFGRRG E VP DVIA RKLQWRASIY+R IQAVPSSVR    +N++GSHG KEA
Subjt:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA

Query:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        ILE+IKPWIQREL+AIL DPDPTIIVHLVTSLFV+RLEAPSSQLN E+DFL  L PFLYEKTDLFWHELR
Subjt:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

XP_038875512.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X1 [Benincasa hispida]4.89e-14778.15Show/hide
Query:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL
        ++Q E+MKP+TREP  KLN ENF+SKVISPAICGETCPICL EL+D T AVLT+CIHAYC+ CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWF+KIN SS SFR E L
Subjt:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL

Query:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA
         TLNC DKL  GVGSSR D+R +LQ  RNELNR RRSE  LTWRRSFGRRG E VPADV+A R+LQWRASIYNR IQA+PSSVR   ELNI GS GAKEA
Subjt:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA

Query:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        ILE+IKPWI+RELQAILEDPDPTIIVHLV SLFV+RLE PS QLN EDDFL  L PFL+EKTDLFWHELR
Subjt:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

XP_038875513.1 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X2 [Benincasa hispida]3.19e-14778.15Show/hide
Query:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL
        ++Q E+MKP+TREP  KLN ENF+SKVISPAICGETCPICL EL+D T AVLT+CIHAYC+ CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWF+KIN SS SFR E L
Subjt:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL

Query:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA
         TLNC DKL  GVGSSR D+R +LQ  RNELNR RRSE  LTWRRSFGRRG E VPADV+A R+LQWRASIYNR IQA+PSSVR   ELNI GS GAKEA
Subjt:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA

Query:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        ILE+IKPWI+RELQAILEDPDPTIIVHLV SLFV+RLE PS QLN EDDFL  L PFL+EKTDLFWHELR
Subjt:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCD1 RING-type domain-containing protein6.24e-14276.12Show/hide
Query:  EIMK--PATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPT
        E+MK   +TREP RKLN ENF++KVISPAICGETCPICLREL+D T AVLT+CIHAYC+ CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWF+KIN SS SFRKE L T
Subjt:  EIMK--PATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPT

Query:  LNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAIL
         NC DKL  GVGSS+ID+R +LQ  R ELNR RRSE  LTWRRSFGRRG + +PADV+ +RK QWRASIYNR IQAVPSSVR   ELN+ GS G KE IL
Subjt:  LNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAIL

Query:  EKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        E+IKPWIQRELQ ILEDPDPTIIVHLV SLFV+R+EA SSQLN EDDFL  L PFL+EKTDLFWHELR
Subjt:  EKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

A0A1S3C7X8 E3 ubiquitin-protein ligase Topors4.36e-14276.69Show/hide
Query:  MKPA--TREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLN
        MKP+  TREP RKLN ENF++KVISPAICGETCPICLREL+D T AVLT+CIHAYC+ CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWF+KIN SS SFRKE L T N
Subjt:  MKPA--TREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLN

Query:  CVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEK
        C +KL  GVGSS+ D+R +LQ  R ELNR RRSE  LTWRRSFGRRG + +PADV+ +RKLQWRASIYNR IQAVPSSVR   ELNI G+ G KE ILE+
Subjt:  CVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEK

Query:  IKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        IKPWIQRELQ ILEDPDPTIIVHLV SLFV+RLEA SSQLN EDDFL  L PFL+EKTDLFWHELR
Subjt:  IKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

A0A6J1CAG7 E3 ubiquitin-protein ligase Topors1.54e-192100Show/hide
Query:  MKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCV
        MKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCV
Subjt:  MKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCV

Query:  DKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIK
        DKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIK
Subjt:  DKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIK

Query:  PWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        PWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
Subjt:  PWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

A0A6J1EQ79 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X11.94e-14678.87Show/hide
Query:  IMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNC
        I K +T EP RKLN ENFV KVISPAICGETCPICLREL+D   AVLT+CIHAYCV CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWFSKI  SS SFRKE LP LNC
Subjt:  IMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNC

Query:  VDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKI
         D L  G+GSSR D+RR+LQ  RNEL+R RRSE PLTWRRSFGRRG E VP DVIA RKLQWRASIY+R IQAVPSSVR    +N++GSHG KEAILE+I
Subjt:  VDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKI

Query:  KPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        KPWIQREL+AIL DPDPTIIVHLVTSLFV+RLEAPSSQLN E+DFL  L PFLYEKTDLFWHELR
Subjt:  KPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

A0A6J1KEK6 E3 ubiquitin-protein ligase Topors isoform X12.89e-14877.78Show/hide
Query:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL
        +++ +IMK +T EP RKLN ENFV KVISPAICG+TCPICLREL+D T AVLT+CIHAYCV CIRKWS LKRTCPLCNAQF+SWF KIN SS SFRKE L
Subjt:  LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHL

Query:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA
        P LNC D L  G+GSSR D+RR+LQ  RNEL+R RRSE PLTWRRSFGRRG E VP DVIA RKLQWRASIY+R IQAVPSSVR    +N++GSHG KEA
Subjt:  PTLNCVDKLNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEA

Query:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        ILE+IKPWIQREL+AIL DPDPTIIVHLVTSLFV+RLEAPSSQLN E+DFL  L PFLYEKTDLFWHELR
Subjt:  ILEKIKPWIQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08393 E3 ubiquitin-protein ligase ICP08.1e-0536.17Show/hide
Query:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQ
        G+ C +C  E+          C+H +C+ C++ W  L+ TCPLCNA+
Subjt:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQ

P28284 E3 ubiquitin-protein ligase ICP03.1e-0435.56Show/hide
Query:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCN
        G+ C +C  E+          C+H +C+ C++ W  L+ TCPLCN
Subjt:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCN

P29129 E3 ubiquitin-protein ligase ICP02.4e-0436.84Show/hide
Query:  CPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSS
        CPICL      T A    C+H +C++CI++W+     CPLCNA+  S    ++  +S
Subjt:  CPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSS

Q7ZWF4 RING finger protein 1454.0e-0440.82Show/hide
Query:  ETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFES
        + C IC    QD  +AV+T C H +   C++KW  ++ TCPLC+ Q +S
Subjt:  ETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFES

Q9P1Y6 PHD and RING finger domain-containing protein 13.1e-0431.75Show/hide
Query:  ETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRK
        E+CPICL   +D       +C H +C++CI +WS    +CP+    F+    +  F     RK
Subjt:  ETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39100.1 RING/U-box superfamily protein1.0e-5845.32Show/hide
Query:  ATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQD-CTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCVDK
        ++R  R   +   F  + I PA+ G++CPICL  L +  + AV+T C H YC+ CIRKWS+ KR CPLCN +F+SWF   +F+S  + KE LP L   + 
Subjt:  ATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQD-CTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCVDK

Query:  LNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIKPW
        L T   ++  D RR++QR+R+ L        PL WRRSFGR GS  VP  VI QRKLQWRASIY + ++AV    R   EL+++ +   K  I E+I+PW
Subjt:  LNTGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIKPW

Query:  IQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPE-----DDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR
        I+RELQA+L DPDP++IVH  ++LF+ RLE  +++   +     +D + +L  FL +K D+FWHELR
Subjt:  IQRELQAILEDPDPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPE-----DDFLLALHPFLYEKTDLFWHELR

AT4G10940.1 RING/U-box protein3.4e-0644.9Show/hide
Query:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFE
        GE C IC+  + D    VL  C H +C ECI  WST+   CPLC  +F+
Subjt:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFE

AT5G12310.1 RING/U-box superfamily protein1.7e-0543.14Show/hide
Query:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKR--TCPLCNAQFE
        G  C ICL  +    TA++  C HAYCV CI +W++ K   TCP C   F+
Subjt:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKR--TCPLCNAQFE

AT5G19430.1 RING/U-box superfamily protein9.8e-0643.14Show/hide
Query:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKR--TCPLCNAQFE
        G  C ICL E+    TA++  C H YCV CI +W++ K   TCP C   F+
Subjt:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKR--TCPLCNAQFE

AT5G19430.2 RING/U-box superfamily protein9.8e-0643.14Show/hide
Query:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKR--TCPLCNAQFE
        G  C ICL E+    TA++  C H YCV CI +W++ K   TCP C   F+
Subjt:  GETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKR--TCPLCNAQFE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTAGTGCAGGAGGAAATCATGAAGCCTGCAACCCGGGAACCGCGGCGAAAGCTCAACCGCGAAAACTTCGTATCTAAGGTAATTTCGCCGGCAATCTGTGGGGAAACCTG
CCCAATTTGCCTCAGAGAATTGCAGGATTGTACCACCGCCGTGCTTACATCTTGTATCCACGCCTATTGCGTAGAATGCATTCGCAAATGGAGCACTTTGAAGCGGACTT
GCCCTCTCTGCAACGCTCAATTCGAGTCATGGTTCTCCAAAATCAATTTCTCATCATCAAGCTTCCGCAAAGAACATTTGCCAACCTTGAATTGTGTCGATAAGCTCAAT
ACTGGAGTCGGATCCTCCCGGATTGACAGTCGCAGGCTTCTTCAGAGAGCGAGGAACGAATTAAATAGAGTTAGACGGTCGGAAATACCACTGACATGGCGGCGATCGTT
TGGACGGCGAGGGTCAGAACCTGTACCAGCTGACGTTATTGCCCAGCGAAAACTTCAATGGCGAGCAAGCATATACAACCGACATATACAAGCTGTTCCATCTTCGGTCA
GATGCGGTGCAGAACTGAACATATCAGGAAGTCATGGAGCTAAAGAAGCAATACTAGAGAAGATTAAACCATGGATTCAGAGAGAGTTGCAAGCCATCCTTGAGGACCCA
GATCCAACTATAATTGTTCATCTGGTTACCTCACTATTTGTCTCGAGACTTGAAGCTCCTTCCTCGCAGCTTAATCCCGAGGATGACTTTCTTTTGGCGCTGCATCCCTT
CCTTTATGAAAAAACTGACTTGTTTTGGCATGAATTAAGGTACATGACTCAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTAGTGCAGGAGGAAATCATGAAGCCTGCAACCCGGGAACCGCGGCGAAAGCTCAACCGCGAAAACTTCGTATCTAAGGTAATTTCGCCGGCAATCTGTGGGGAAACCTG
CCCAATTTGCCTCAGAGAATTGCAGGATTGTACCACCGCCGTGCTTACATCTTGTATCCACGCCTATTGCGTAGAATGCATTCGCAAATGGAGCACTTTGAAGCGGACTT
GCCCTCTCTGCAACGCTCAATTCGAGTCATGGTTCTCCAAAATCAATTTCTCATCATCAAGCTTCCGCAAAGAACATTTGCCAACCTTGAATTGTGTCGATAAGCTCAAT
ACTGGAGTCGGATCCTCCCGGATTGACAGTCGCAGGCTTCTTCAGAGAGCGAGGAACGAATTAAATAGAGTTAGACGGTCGGAAATACCACTGACATGGCGGCGATCGTT
TGGACGGCGAGGGTCAGAACCTGTACCAGCTGACGTTATTGCCCAGCGAAAACTTCAATGGCGAGCAAGCATATACAACCGACATATACAAGCTGTTCCATCTTCGGTCA
GATGCGGTGCAGAACTGAACATATCAGGAAGTCATGGAGCTAAAGAAGCAATACTAGAGAAGATTAAACCATGGATTCAGAGAGAGTTGCAAGCCATCCTTGAGGACCCA
GATCCAACTATAATTGTTCATCTGGTTACCTCACTATTTGTCTCGAGACTTGAAGCTCCTTCCTCGCAGCTTAATCCCGAGGATGACTTTCTTTTGGCGCTGCATCCCTT
CCTTTATGAAAAAACTGACTTGTTTTGGCATGAATTAAGGTACATGACTCAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
LVQEEIMKPATREPRRKLNRENFVSKVISPAICGETCPICLRELQDCTTAVLTSCIHAYCVECIRKWSTLKRTCPLCNAQFESWFSKINFSSSSFRKEHLPTLNCVDKLN
TGVGSSRIDSRRLLQRARNELNRVRRSEIPLTWRRSFGRRGSEPVPADVIAQRKLQWRASIYNRHIQAVPSSVRCGAELNISGSHGAKEAILEKIKPWIQRELQAILEDP
DPTIIVHLVTSLFVSRLEAPSSQLNPEDDFLLALHPFLYEKTDLFWHELRYMTH