; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g0008 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g0008
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionprotein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, chloroplastic/mitochondrial
Genome locationMC08:58311..63707
RNA-Seq ExpressionMC08g0008
SyntenyMC08g0008
Gene Ontology termsGO:0030488 - tRNA methylation (biological process)
GO:0070475 - rRNA base methylation (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0008173 - RNA methyltransferase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR043459 - NFD6/NOXY2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029191.1 hypothetical protein SDJN02_07528, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.73e-4579.82Show/hide
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XP_022159141.1 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, chloroplastic/mitochondrial [Momordica charantia]6.58e-67100Show/hide
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XP_022961783.1 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita moschata]5.75e-5083.49Show/hide
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XP_038885250.1 uncharacterized protein LOC120075707 isoform X1 [Benincasa hispida]1.15e-4666.91Show/hide
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XP_038885251.1 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, mitochondrial isoform X2 [Benincasa hispida]1.74e-5386.11Show/hide
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A0A0A0L605 Radical_SAM domain-containing protein4.33e-3976.47Show/hide
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A0A5D3D8K9 Dual-specificity RNA methyltransferase RlmN isoform X16.44e-3873.53Show/hide
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A0A6J1E309 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, chloroplastic/mitochondrial3.19e-67100Show/hide
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A0A6J1HCT7 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 6, chloroplastic/mitochondrial2.79e-5083.49Show/hide
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A0A6J1K524 uncharacterized protein LOC111491756 isoform X24.88e-4383.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55205.1 unknown protein3.0e-0639Show/hide
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AT1G55205.2 unknown protein5.6e-0538.95Show/hide
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AT1G70350.1 unknown protein2.3e-1451.38Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CACTAAGCCTACTGGACTTCCTTCTGCTAAGCCGGCAGCATCTCCCCGTTTCTCTGTTCAGAAGCTTACCAACCTCAGGCTTCCAGTGGAGCTGTCAAGTGTGCAGTCGC
TAATGCCACTGCACAGTGTTACTGCTTCTGCCTTATTTACTTCGTTGCTTTCTTTGCATAACAACAGTTGGGGTTGTCTATCTGAAGGATTTGCTACACCGCTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AAAAACAAATAACTATAATAAATATAAATACAATATTTATGAGTAAATTCGAAACTAAAATAAGATCCAAAATCTAAAAGTATAAAATTAAAATTTTATACTAAATAAAT
TTCTAAAACAACACTCCAAACAGACCCACTATAATTTCTGTAGTACTTCTGGGCTTTTCTTTCTTCGGCCGTCAGCACTCCCGATCTTGGTCAGACGATTTGGATTTTGG
AGGACAGACGAAGGCCCAGCGTGGAATAGCCCGAGGAAATTCCATAAGCTAACCCCTAGCGCCAACGGATCTAAGTTTTCCTCCGAGGGTCAGCTCCTCTTCTAATTCTA
TTCTAACAGAGAGCCAAGGAAATATGGCGGCTTGCTGTACCTGGAAAACCCTACGAATGTCCTCCTCTTCCACAAGAACTCTCATTTGCCGTTCCTCTTCCTCATCGTCT
GCGTCCCATTTTGTGTCCAGACCCACTAAGCCTACTGGACTTCCTTCTGCTAAGCCGGCAGCATCTCCCCGTTTCTCTGTTCAGAAGCTTACCAACCTCAGGCTTCCAGT
GGAGCTGTCAAGTGTGCAGTCGCTAATGCCACTGCACAGTGTTACTGCTTCTGCCTTATTTACTTCGTTGCTTTCTTTGCATAACAACAGTTGGGGTTGTCTATCTGAAG
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