; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g0509 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g0509
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptiontranscription factor MYBS3-like isoform X1
Genome locationMC08:4106223..4109008
RNA-Seq ExpressionMC08g0509
SyntenyMC08g0509
Gene Ontology termsGO:0009725 - response to hormone (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585740.1 Transcription factor MYBS3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.44e-10663.04Show/hide
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        SVT
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XP_022131428.1 transcription factor MYBS3-like isoform X1 [Momordica charantia]3.39e-191100Show/hide
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XP_022131429.1 transcription factor MYB1R1-like isoform X2 [Momordica charantia]9.79e-131100Show/hide
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XP_022951726.1 probable transcription factor At5g61620 [Cucurbita moschata]2.18e-10662.62Show/hide
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        GIPS NSTPI         H+H H S +PIWFGYE  K    + N         H HGK+KT SHHQAPDLQLSLSTPKPV+               ING
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        AISVT
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XP_023538241.1 probable transcription factor At5g61620 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.04e-10762.91Show/hide
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        VT
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKT1 Uncharacterized protein6.96e-9059.06Show/hide
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        VPWSEEEH+VFL+GLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTL ++K  RPSLFDG A RDK T+QVVE       S N+N KPT+N   
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          PAS +NISFG P    TPI NI ++T    + +H++  +      F   P +K+SSSI         N+H H       HH  PDLQLSLSTPKPV
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A0A455PI93 MYB11.06e-10662.62Show/hide
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        GVPW+EEEHR+FLVGL+KLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRL +L ++KH RPSLFD   RDKF +QVV+ +NS  KP SNLP S   ISF
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        GIPS NSTPI         H+H H S +PIWFGYE  K    + N         H HGK+KT SHHQAPDLQLSLSTPKPV+               ING
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        AISVT
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A0A6J1BQ80 transcription factor MYB1R1-like isoform X24.74e-131100Show/hide
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        GIPSKNSTPINIPKMTLNHHHHHHNSSVPIWFGYEPSKNSSSIVNYHSHGKKKTISHHQAPDLQLSLSTPKPVQLPAAINGAISVT
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A0A6J1BTC4 transcription factor MYBS3-like isoform X11.64e-191100Show/hide
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        HHHNSSVPIWFGYEPSKNSSSIVNYHSHGKKKTISHHQAPDLQLSLSTPKPVQLPAAINGAISVT
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A0A6J1KLU7 probable transcription factor At5g616209.96e-10562.62Show/hide
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Query:  IPSKNSTPINIPKMTLNHHHHHHNSSVPIWFGYEPSKNSSSIVN--------YHSHGKKKTISHHQAPDLQLSLSTPKPV-------QLPAA-----ING
        IPS NSTPI         H+H H S +PIWFGYE  K    + N         H HGK+KT SHHQAPDLQLSLSTPKPV       Q P       ING
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Query:  AISVT
        AISVT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BI93 Transcription factor MYBS23.2e-2255.75Show/hide
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        ++M    S+D LP  +      +S D +LA+G        K  ERKKGVPW+EEEH+ FL GL +LGKGDWRGIS+ FVT+RT TQVASHAQKYFLR T 
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Query:  LTRKKHCRPSLFD
          +KK  R SLFD
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Q2V9B0 Transcription factor MYB1R12.8e-2638.74Show/hide
Query:  GRFKLFGVQLDGAAMKKSFSLDCL-----PSSSSTS----STSSSDIKLATGYLS-DGLI----TKTHERKKGVPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGIS
        G   LFGV++    M+KS SL+ L     P++++ +    +  SS +    GY S D  +        ERK+GVPW+EEEH++FL+GL+K+GKGDWRGIS
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Query:  RKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFDGGARDKFTMQVVESSNSNSKPT---SNLPASPSNISFGIPSKNST--PINIPKM----TLNH
        R FV TRTPTQVASHAQKYFLR + L R++  R SLFD        M + E  N    P    + LP + +N     P+      P+ I K     TL  
Subjt:  RKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFDGGARDKFTMQVVESSNSNSKPT---SNLPASPSNISFGIPSKNST--PINIPKM----TLNH

Query:  HHHHHNS----SVPIWFGYEPSKNSSSIVNYHSHGKKKTISHHQAPDLQLSLS
        H H ++S     VP++    PS       N++S  +  ++S      L+LSLS
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Q7XC57 Transcription factor MYBS31.0e-3648.4Show/hide
Query:  MGRKCSHCGKVGHNSRTCTIRGRFKLFGVQLDGAAMKKSFSLDCLPSSSSTSSTSSSDIK----------LATGYLSD----GLITKTHERKKGVPWSEE
        M R+CSHC   GHNSRTC  RG  K+FGV+L   +++KS S+  L   SS + ++S               A GY SD    G  + T +RKKGVPW+EE
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Query:  EHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFDGGARDKFTMQVVESSNSNSKPTSNLPASP
        EHR FL+GL+KLGKGDWRGISR FV +RTPTQVASHAQKYF+R + +TR+K  R SLFD    +   +  +           N PA P
Subjt:  EHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFDGGARDKFTMQVVESSNSNSKPTSNLPASP

Q9FKF9 Probable transcription factor At5g616201.8e-3345.88Show/hide
Query:  MGRKCSHCGKVGHNSRTC---TIRGRFKLFGVQLDG--------AAMKKSFSLDCLPSSSSTSSTSSSDIKLA----TGYLSDGLI-----TKTHERKKG
        + + CSHCG  GHN+RTC     +   KLFGV +           A++KS SL  L +  +   ++ S   +A    TGY SDG I        HE+KKG
Subjt:  MGRKCSHCGKVGHNSRTC---TIRGRFKLFGVQLDG--------AAMKKSFSLDCLPSSSSTSSTSSSDIKLA----TGYLSDGLI-----TKTHERKKG

Query:  VPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFDGGARDKFTMQVVESSNSNSKPTSNLPASP
         PW+EEEHR FL+GL KLGKGDWRGI++ FV+TRTPTQVASHAQKYF+RL    ++K  R SLFD    D    Q  +  NS    T   P  P
Subjt:  VPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFDGGARDKFTMQVVESSNSNSKPTSNLPASP

Q9LVS0 Transcription factor KUA11.9e-3553.42Show/hide
Query:  MGRKCSHCGKVGHNSRTCTIRGRFKLFGVQLDGAAMKKSFSLDCLP----SSSSTSSTSSS---------DIKLATGYLSDGLI---TKTHERKKGVPWS
        M R+CSHC   GHNSRTC  RG  KLFGV+L   +++KS S+  L     S S    T S+         D     GY S+  +   + + ERKKG PW+
Subjt:  MGRKCSHCGKVGHNSRTCTIRGRFKLFGVQLDGAAMKKSFSLDCLP----SSSSTSSTSSS---------DIKLATGYLSDGLI---TKTHERKKGVPWS

Query:  EEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFD
        EEEHR+FL+GL+KLGKGDWRGISR +VTTRTPTQVASHAQKYF+R + ++R+K  R SLFD
Subjt:  EEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70000.1 myb-like transcription factor family protein4.5e-3249.7Show/hide
Query:  MGRKCSHCGKVGHNSRTC----TIRG----------RFKLFGVQLDGAA---MKKSFSLDCLPSSSSTSSTSSSDIKLATGYLSDGLI---TKTHERKKG
        M R CS CG  GHNSRTC    T  G             LFGV++  A+    +KS S++ L     T   + +D     GY SD ++    +  ERK+G
Subjt:  MGRKCSHCGKVGHNSRTC----TIRG----------RFKLFGVQLDGAA---MKKSFSLDCLPSSSSTSSTSSSDIKLATGYLSDGLI---TKTHERKKG

Query:  VPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFD
         PW+EEEHR+FL GL K+GKGDWRGISR FV TRTPTQVASHAQKYFLR T   R++  R SLFD
Subjt:  VPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFD

AT3G16350.1 Homeodomain-like superfamily protein1.4e-3344.16Show/hide
Query:  MGRKCSHCGKVGHNSRTCTIRG-----------------------RFKLFGVQL-DGAAMKKSFSLDCLP--------------SSSSTSSTSS------
        M R+CSHC   GHNSRTC  RG                         KLFGV+L DG+ +KKS S+  L               S SS  +TS+      
Subjt:  MGRKCSHCGKVGHNSRTCTIRG-----------------------RFKLFGVQL-DGAAMKKSFSLDCLP--------------SSSSTSSTSS------

Query:  ------SDIKLATGYLSD------GLITKTHERKKGVPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLF
              S++    GYLSD      G   +  ERK+GVPW+EEEHR+FLVGL+KLGKGDWRGISR +VT+RTPTQVASHAQKYF+R T+ +R+K  R SLF
Subjt:  ------SDIKLATGYLSD------GLITKTHERKKGVPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLF

Query:  DGGARDKFTMQVVESSNSNSKPTSNLPASPS
        D    +     V +SS +  + T N  +SPS
Subjt:  DGGARDKFTMQVVESSNSNSKPTSNLPASPS

AT5G47390.1 myb-like transcription factor family protein1.4e-3653.42Show/hide
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        M R+CSHC   GHNSRTC  RG  KLFGV+L   +++KS S+  L     S S    T S+         D     GY S+  +   + + ERKKG PW+
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Query:  EEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFD
        EEEHR+FL+GL+KLGKGDWRGISR +VTTRTPTQVASHAQKYF+R + ++R+K  R SLFD
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AT5G56840.1 myb-like transcription factor family protein1.4e-4661.11Show/hide
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        MGR+CSHCG VGHNSRTC+       +LFGV LD                AA+KKSFS+DCLP+ SS+SS+ +       GYLSDGL  KT +RKKGVPW
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Query:  SEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFD
        + EEHR FL+GLEKLGKGDWRGISR FV T++PTQVASHAQKYFLR TT    K  R SLFD
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AT5G61620.1 myb-like transcription factor family protein1.3e-3445.88Show/hide
Query:  MGRKCSHCGKVGHNSRTC---TIRGRFKLFGVQLDG--------AAMKKSFSLDCLPSSSSTSSTSSSDIKLA----TGYLSDGLI-----TKTHERKKG
        + + CSHCG  GHN+RTC     +   KLFGV +           A++KS SL  L +  +   ++ S   +A    TGY SDG I        HE+KKG
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Query:  VPWSEEEHRVFLVGLEKLGKGDWRGISRKFVTTRTPTQVASHAQKYFLRLTTLTRKKHCRPSLFDGGARDKFTMQVVESSNSNSKPTSNLPASP
         PW+EEEHR FL+GL KLGKGDWRGI++ FV+TRTPTQVASHAQKYF+RL    ++K  R SLFD    D    Q  +  NS    T   P  P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAAGAGCTTCAGCTTGGATTGTTTGCCTTCTTCTTCTTCTACTTCTTCTACTTCTTCTTCTGACATTAAATTGGCAACTGGGTATCTCTCTGATGGCCTCATCACCAAAA
CCCACGAGAGAAAAAAGGGTGTGCCATGGAGTGAAGAGGAGCACAGAGTGTTTCTAGTTGGGCTAGAGAAGCTTGGAAAAGGAGATTGGAGAGGAATCTCAAGGAAATTT
GTGACGACAAGAACTCCAACTCAAGTGGCCAGCCATGCCCAAAAGTACTTCCTCAGACTCACAACCCTCACCAGAAAAAAGCACTGCCGCCCCAGCCTTTTCGATGGTGG
TGCAAGAGACAAATTCACAATGCAAGTGGTTGAGAGCAGCAATTCCAACTCCAAGCCAACCAGCAACCTGCCAGCTTCTCCATCCAATATTTCCTTTGGGATTCCATCAA
AAAATTCAACTCCAATTAATATTCCCAAAATGACCTTGAATCACCATCATCATCATCATAATTCTTCAGTGCCCATTTGGTTTGGTTATGAGCCATCAAAAAATTCAAGC
TCAATAGTGAATTACCATTCTCATGGAAAAAAGAAGACAATTTCCCATCATCAGGCACCTGATTTGCAGCTCAGTTTGTCAACTCCAAAGCCAGTTCAACTACCAGCTGC
CATTAATGGAGCAATTTCAGTGACATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TGGGTCACAATTCAAGAACTTGCACCATTAGAGGGAGATTTAAGCTATTTGGAGTTCAACTTGATGGAGCAGCCATGAAGAAGAGCTTCAGCTTGGATTGTTTGCCTTCT
TCTTCTTCTACTTCTTCTACTTCTTCTTCTGACATTAAATTGGCAACTGGGTATCTCTCTGATGGCCTCATCACCAAAACCCACGAGAGAAAAAAGGGTGTGCCATGGAG
TGAAGAGGAGCACAGAGTGTTTCTAGTTGGGCTAGAGAAGCTTGGAAAAGGAGATTGGAGAGGAATCTCAAGGAAATTTGTGACGACAAGAACTCCAACTCAAGTGGCCA
GCCATGCCCAAAAGTACTTCCTCAGACTCACAACCCTCACCAGAAAAAAGCACTGCCGCCCCAGCCTTTTCGATGGTGGTGCAAGAGACAAATTCACAATGCAAGTGGTT
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GACCTTGAATCACCATCATCATCATCATAATTCTTCAGTGCCCATTTGGTTTGGTTATGAGCCATCAAAAAATTCAAGCTCAATAGTGAATTACCATTCTCATGGAAAAA
AGAAGACAATTTCCCATCATCAGGCACCTGATTTGCAGCTCAGTTTGTCAACTCCAAAGCCAGTTCAACTACCAGCTGCCATTAATGGAGCAATTTCAGTGACATGAAAT
CATGACCAGAGCCTTCTTTGATATGGAAACTTAATTTGTTTTGCTCTTTGATATGATAAATAAGATCATTTGAGGAGTTTTTAGCTATGGTATGCAATATTATAGTTACT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SIVNYHSHGKKKTISHHQAPDLQLSLSTPKPVQLPAAINGAISVT