; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g0539 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g0539
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionCytochrome c oxidase subunit 2
Genome locationMC08:4388241..4388336
RNA-Seq ExpressionMC08g0539
SyntenyMC08g0539
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GFP91537.1 uncharacterized mitochondrial protein atmg01280 [Phtheirospermum japonicum]1.48e-1293.75Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

KAA0050494.1 cytochrome c oxidase subunit 2 [Cucumis melo var. makuwa]1.41e-1296.88Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        LIIAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

QYK19099.1 cytochrome c oxidase subunit 2, partial [Dryadella lilliputiana]5.54e-1293.75Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

QYK19145.1 cytochrome c oxidase subunit 2, partial [Myoxanthus exasperatus]5.42e-1293.75Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

QYK19277.1 cytochrome c oxidase subunit 2, partial [Stelis grandiflora]5.19e-1293.75Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A3P6H111 COX2_TM domain-containing protein3.90e-1287.5Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L I+PCDAAEP QLGSQDAATP+MQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

A0A484MYE2 COX2_TM domain-containing protein2.74e-1293.75Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

A0A5A7U5H8 Cytochrome c oxidase subunit 26.84e-1396.88Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        LIIAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

A0A5A7U5K2 Cytochrome c oxidase subunit 24.08e-1293.75Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

A0A5D3CT80 Cytochrome c oxidase subunit 2 (Mitochondrion)4.08e-1293.75Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P04373 Cytochrome c oxidase subunit 22.4e-0990.62Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IA CDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

P05491 Cytochrome c oxidase subunit 28.3e-1090.62Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLG QDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

P08744 Cytochrome c oxidase subunit 28.3e-1090.62Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L IAPCDAAEP QLG QDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

P27168 Cytochrome c oxidase subunit 22.4e-0993.1Show/hide
Query:  APCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        +PCDAAEP QLGSQDAATPMMQGIIDLHH
Subjt:  APCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

P92559 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg012801.1e-0987.5Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L I+PCDAAEP QLGSQDAATP+MQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07695.1 Cytochrome C oxidase subunit II-like, transmembrane domain7.7e-1187.5Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L I+PCDAAEP QLGSQDAATP+MQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

ATMG00160.1 cytochrome oxidase 27.7e-1187.5Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L I+PCDAAEP QLGSQDAATP+MQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH

ATMG01280.1 Cytochrome C oxidase subunit II-like, transmembrane domain7.7e-1187.5Show/hide
Query:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH
        L I+PCDAAEP QLGSQDAATP+MQGIIDLHH
Subjt:  LIIAPCDAAEPXQLGSQDAATPMMQGIIDLHH


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CTCATAATTGCTCCTTGTGATGCAGCGGAACCATAGCAATTAGGATCTCAAGACGCAGCAACACCTATGATGCAAGGAATAATAGACTTACATCAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCATAATTGCTCCTTGTGATGCAGCGGAACCATAGCAATTAGGATCTCAAGACGCAGCAACACCTATGATGCAAGGAATAATAGACTTACATCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
LIIAPCDAAEPUQLGSQDAATPMMQGIIDLHH