| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_011651771.1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 isoform X1 [Cucumis sativus] | 5.02e-77 | 97.41 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAE AKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| XP_021618269.1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 [Manihot esculenta] | 1.01e-76 | 95.69 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFT+ERE+HTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKE DH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAE+AKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| XP_021645507.1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 [Hevea brasiliensis] | 2.05e-76 | 95.69 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFT+ERE+HTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAEIAKFS+DY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| XP_022152550.1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 [Momordica charantia] | 2.13e-78 | 100 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAEIAKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| XP_022949378.1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 [Cucurbita moschata] | 1.44e-76 | 96.55 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
L+N FEAE AKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LCD5 RNA_pol_L_2 domain-containing protein | 2.43e-77 | 97.41 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAE AKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| A0A1S5R4J3 DNA-directed RNA polymerase | 9.90e-77 | 95.69 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFT+ERE+HTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAEIAKFS+DY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| A0A2C9VHF2 RNA_pol_L_2 domain-containing protein | 4.91e-77 | 95.69 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFT+ERE+HTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKE DH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAE+AKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| A0A6J1DE90 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 | 1.03e-78 | 100 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKNAFEAEIAKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| A0A6J1GBY1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 | 6.97e-77 | 96.55 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
L+N FEAE AKFSRDY
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O08740 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 | 7.1e-27 | 52.29 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP +E F++ EG KK++ +DTK+ NA FTI +E+HT+GNI++ QL +D VLFAGYK+PHPL++KIIIR+ TT SP +A+ AI DL EL
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEI
L+ F I
Subjt: LKNAFEAEI
|
|
| P52435 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a | 7.1e-27 | 52.29 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP +E F++ EG KK++ +DTK+ NA FTI +E+HT+GNI++ QL +D VLFAGYK+PHPL++KIIIR+ TT SP +A+ AI DL EL
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEI
L+ F I
Subjt: LKNAFEAEI
|
|
| Q32P79 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 | 7.1e-27 | 52.29 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP +E F++ EG KK++ +DTK+ NA FTI +E+HT+GNI++ QL +D VLFAGYK+PHPL++KIIIR+ TT SP +A+ AI DL EL
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEI
L+ F I
Subjt: LKNAFEAEI
|
|
| Q38859 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 | 4.3e-56 | 88.79 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP+RYERFVVPEGTKKVSY+RDTKIINAASFT+ERE+HTIGNI+RMQLHRDENVLFAGY+LPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELD+
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKN FEAE+AKFS +
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| Q86JJ5 DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb11 | 8.4e-28 | 48.65 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDR+E FV+P+G KKV+ RDTKI NA+ FTI +E+HTIGN++RMQL D++++FAGY++PHPL++ + IRI T + ++P++ +++ L +E
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAK
L+N+F ++ K
Subjt: LKNAFEAEIAK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G29540.1 RNApolymerase 14 kDa subunit | 5.2e-09 | 30.59 | Show/hide |
Query: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFEAEIAKF
++ ASFT+ E+HT+ N +R L++D V A Y +PHP ++ IR+ TT + + + A +L + H+++ F+ +A++
Subjt: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFEAEIAKF
|
|
| AT2G29540.2 RNApolymerase 14 kDa subunit | 5.2e-09 | 30.59 | Show/hide |
Query: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFEAEIAKF
++ ASFT+ E+HT+ N +R L++D V A Y +PHP ++ IR+ TT + + + A +L + H+++ F+ +A++
Subjt: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFEAEIAKF
|
|
| AT3G52090.1 DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like | 3.0e-57 | 88.79 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP+RYERFVVPEGTKKVSY+RDTKIINAASFT+ERE+HTIGNI+RMQLHRDENVLFAGY+LPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELD+
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFEAEIAKFSRDY
LKN FEAE+AKFS +
Subjt: LKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
| AT3G52090.2 DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like | 1.7e-52 | 70.55 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIR--------------------------
MNAP+RYERFVVPEGTKKVSY+RDTKIINAASFT+ERE+HTIGNI+RMQLHRDENVLFAGY+LPHPLKYKII+R
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIR--------------------------
Query: ----IHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFEAEIAKFSRDY
IHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELD+LKN FEAE+AKFS +
Subjt: ----IHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFEAEIAKFSRDY
|
|
