; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g0961 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g0961
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationMC08:7699857..7700474
RNA-Seq ExpressionMC08g0961
SyntenyMC08g0961
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004152334.1 uncharacterized protein LOC101207294 [Cucumis sativus]6.13e-5459.72Show/hide
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XP_022153483.1 uncharacterized protein LOC111020980 [Momordica charantia]7.57e-127100Show/hide
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XP_023528743.1 uncharacterized protein LOC111791584 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.76e-5664.02Show/hide
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XP_038877738.1 uncharacterized protein LOC120069962 [Benincasa hispida]1.41e-6467.77Show/hide
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        V SNKKK CMCSPT HPGSFRCSLHKNS  SV   NR QFQN       +LN RRSAMTNSLVRIG VEG DLV+R LSALIRPSS+QQRR+ AFQPRPS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWX3 Uncharacterized protein2.97e-5459.72Show/hide
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A0A1S3BY19 uncharacterized protein LOC1034946765.38e-5762.38Show/hide
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A0A5D3E1W2 Serine-rich protein-like protein5.38e-5762.38Show/hide
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A0A6J1DHK6 uncharacterized protein LOC1110209803.66e-127100Show/hide
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        SRAEED
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A0A6J1IQC9 uncharacterized protein LOC1114795649.40e-5363.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24577.1 unknown protein4.1e-0464Show/hide
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        +S  K +C+CSPTTHPGSF+C LH+
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related9.0e-2846.73Show/hide
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          S+  K+   CMCSPTTHPGSFRCSLHKN     G        NG       LN RRSAMTNSLVRIG VE G+ VRRAL+ LIRPSS+  +R+ A+QP
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        RPSRLS+M++A+E+
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related3.1e-1243.64Show/hide
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        VSSN   K+ C+CSPTTHPGSFRCS H      K+ T +     R    +     +  LN R+ A+ NSL +IG VE  +  RR+L+A L +PSS    R
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        +  F+PR SR
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related6.4e-2643.96Show/hide
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        + ++ CMCSPTTHPGSFRCSLHKN     G        NG       LN RRSAMTNSLVRIG VE G+ VRRAL+ LIRPSS+Q +R+ A++PR SRL+
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         MS+AE+
Subjt:  VMSRAEE

AT5G25280.2 serine-rich protein-related6.4e-2643.96Show/hide
Query:  SSGVESRRSASGGYYRSSPSPFASSSSTFSARSS-----TFRSSSPNRVAMNGKSSSSLSSSSSAAAASVRFQIDRGSSTSPGRSISVQKARENANAVSS
        S+ + S   +S G+  S+ S F+S S+ F +  +       RS+SP RV +          +S+    S R+ ID   S SP RSI+V   + + +    
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        + ++ CMCSPTTHPGSFRCSLHKN     G        NG       LN RRSAMTNSLVRIG VE G+ VRRAL+ LIRPSS+Q +R+ A++PR SRL+
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         MS+AE+
Subjt:  VMSRAEE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCGTCGTCCGGAGTCGAATCTAGACGATCGGCGTCGGGAGGATACTACCGTTCTTCTCCGTCGCCTTTCGCCTCGTCGAGTTCGACTTTTTCCGCCCGCTCGTC
GACTTTTCGATCATCATCTCCGAATCGTGTTGCGATGAATGGAAAATCTTCGTCTTCGCTGTCGTCGTCGTCGTCGGCGGCGGCGGCGTCTGTGAGGTTTCAGATTGATC
GGGGTTCGTCGACGTCGCCCGGCCGTTCGATTTCGGTTCAGAAGGCGAGGGAAAATGCGAATGCGGTGTCGTCGAATAAGAAGAAAGTGTGCATGTGTTCTCCGACGACG
CATCCAGGCTCGTTCCGGTGTTCTCTTCACAAGAATTCGACGTTCTCTGTTGGTGCCGCGAATCGCCGCCAGTTCCAAAACGGAGCGTTCGGATCGAGCAGCACGTTGAA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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HPGSFRCSLHKNSTFSVGAANRRQFQNGAFGSSSTLNFRRSAMTNSLVRIGVVEGGDLVRRALSALIRPSSNQQRRQLAFQPRPSRLSVMSRAEED