; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g0988 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g0988
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionEpidermal patterning factor-like protein
Genome locationMC08:8043903..8044289
RNA-Seq ExpressionMC08g0988
SyntenyMC08g0988
Gene Ontology termsGO:0010052 - guard cell differentiation (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR039455 - EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606797.1 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.34e-4568.52Show/hide
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XP_022153574.1 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 8 [Momordica charantia]6.61e-75100Show/hide
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XP_022948690.1 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 8 [Cucurbita moschata]2.65e-4568.52Show/hide
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XP_022998271.1 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 8 [Cucurbita maxima]7.92e-4770.37Show/hide
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XP_023525861.1 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 8 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.58e-4670.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWT7 Epidermal patterning factor-like protein3.26e-4165.14Show/hide
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A0A5D3E1Z8 Epidermal patterning factor-like protein6.78e-4162.62Show/hide
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A0A6J1DJG7 Epidermal patterning factor-like protein3.20e-75100Show/hide
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A0A6J1GAL3 Epidermal patterning factor-like protein1.28e-4568.52Show/hide
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A0A6J1K9T3 Epidermal patterning factor-like protein3.83e-4770.37Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P43212 Polygalacturonase5.3e-0534.38Show/hide
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Q1G3V9 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 82.2e-0630.85Show/hide
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Q1PEY6 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 62.8e-0642.62Show/hide
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        LGS PP+C  KC  C PC      P H       P+T       YY   W+C+CGNKLY P
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Q2V3I3 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 42.7e-0436.67Show/hide
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        GS PP C  KC  C+PC    V  +       E          YY   W+C+CGNKL+ P
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Q9T068 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-like protein 22.4e-0529.27Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G80133.1 unknown protein1.5e-0730.85Show/hide
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AT2G30370.1 allergen-related2.0e-0742.62Show/hide
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AT2G30370.2 allergen-related2.0e-0742.62Show/hide
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AT4G14723.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: allergen-related (TAIR:AT3G22820.1)1.9e-0536.67Show/hide
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        GS PP C  KC  C+PC    V  +       E          YY   W+C+CGNKL+ P
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AT4G37810.1 unknown protein1.7e-0629.27Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCCCACTCACCACCCTTCTGAACCTCTCCATCACAGCCCTCTTCATCTTCTCCCTCTCCATTCCTCTTCCCACACCCTCAGTTTTTGCGGCGGGCGGTGGCGG
CGGGAGCTTGCAGGAGAAGACGGTGCTGGGGTCGAAGCCGCCGCAATGCATCGGGAAGTGCTTGAATTGCAGGCCCTGCTCGGCGACCCTGGTGGTGCCTGAGCACCGTG
AGAGGAAGGGATTCGAACCTCTGACTCGTAGAGAAAAAGATGATAGCTATTATCTTCTGCATTGGAAATGCAGATGTGGGAATAAGCTTTATCAGCCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCCCCACTCACCACCCTTCTGAACCTCTCCATCACAGCCCTCTTCATCTTCTCCCTCTCCATTCCTCTTCCCACACCCTCAGTTTTTGCGGCGGGCGGTGGCGG
CGGGAGCTTGCAGGAGAAGACGGTGCTGGGGTCGAAGCCGCCGCAATGCATCGGGAAGTGCTTGAATTGCAGGCCCTGCTCGGCGACCCTGGTGGTGCCTGAGCACCGTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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