; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g1127 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g1127
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description(S)-2-hydroxy-acid oxidase
Genome locationMC08:9442881..9452665
RNA-Seq ExpressionMC08g1127
SyntenyMC08g1127
Gene Ontology termsGO:0009854 - oxidative photosynthetic carbon pathway (biological process)
GO:0005777 - peroxisome (cellular component)
GO:0003973 - (S)-2-hydroxy-acid oxidase activity (molecular function)
GO:0010181 - FMN binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000262 - FMN-dependent dehydrogenase
IPR008259 - FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active site
IPR012133 - Alpha-hydroxy acid dehydrogenase, FMN-dependent
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR037396 - FMN hydroxy acid dehydrogenase domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022148294.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like [Momordica charantia]4.25e-253100Show/hide
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XP_022955687.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X1 [Cucurbita moschata]6.82e-22588.46Show/hide
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XP_022955690.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X4 [Cucurbita moschata]1.62e-22588.46Show/hide
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XP_023527008.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.63e-22588.19Show/hide
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XP_038880952.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X2 [Benincasa hispida]6.57e-22587.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEF4 (S)-2-hydroxy-acid oxidase3.18e-22585.99Show/hide
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A0A1S3CCP5 (S)-2-hydroxy-acid oxidase9.12e-22586.54Show/hide
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A0A6J1D4Y8 (S)-2-hydroxy-acid oxidase2.06e-253100Show/hide
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A0A6J1GUB4 (S)-2-hydroxy-acid oxidase3.30e-22588.46Show/hide
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A0A6J1GVS5 (S)-2-hydroxy-acid oxidase7.82e-22688.46Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8AKX6 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO11.2e-12061.39Show/hide
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        E  NV +++ +A+Q LPKM YD+YA GAED+ TL+EN +AF +I  RPR+L+DVSKIDMS T+LG++IS PIM+AP+A  K+A+ +GE ATARAA+AA T
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        A  V IGRPV+F LAA+GE GVR VL M++ E E+TMALSGC S+ DITR+ + T  D+L
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B8B8K5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO42.4e-12964.82Show/hide
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        P+NV +++ELA++ALPKM YD+  GGAED+HTLRENI A+ +I +RPRVLVDVSKIDMSTT+LGY + +PI+VAPT  HKLA+ EGE ATARAAA+   I
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        MVLS+S++  IE+VASSC+A+RF+QLYV+K R+++  LV+RAE  G+KA++LT DTP LGRREADI+NKM+ P   NLEGL+++ + ++  GS+LE  A 
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        V+   PV FGLAA+GE G R V+EML  ELE+ MAL GC S+ +ITRS V T+ D+++S+L
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Q24JJ8 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO35.7e-14772.14Show/hide
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        ++SY ++ + EE+ASSC+AVRF Q+YV+KRRDIT  +VKRAE++G+KAIVLT D PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL S E+   +GS ++A A+  
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        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+ VRT+ ++L SML
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Q8H3I4 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO45.7e-13165.37Show/hide
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        P+NV +++ELA++ALPKM YD+  GGAED+HTLRENI A+ +I +RPRVLVDVSKIDMSTT+LGY + +PI+VAPT  HKLA+ EGE ATARAAA+   I
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        MVLS+S++  IE+VASSC+A+RF+QLYV+K R+++  LV+RAE  G+KA++LT DTP LGRREADI+NKM+ P   NLEGL++  + ++  GS+LE  A 
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        ATLD SL W+DI WL+SITS+PI +KGI+T EDA RAVEAGV G+IVSNHGARQLD+APAT++ LEEVV AV G VPVL DGG+RRGTDVFKALALGA+A
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        V++GRPV FGLAA+GE G R V+EML  ELE+ MAL GC S+ +ITRS V T+ D+++S+L
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Q9LJH5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO41.1e-15072.7Show/hide
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         DASL W+DI WLRSIT LPIL+KG+LT EDA +AVEAGVDGI+VSNHGARQLD++PAT++VLEEVVHAVKGR+PVL DGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G14130.1 Aldolase-type TIM barrel family protein7.8e-15272.7Show/hide
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AT3G14150.1 Aldolase-type TIM barrel family protein4.0e-14872.14Show/hide
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        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+ VRT+ ++L SML
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AT3G14150.2 Aldolase-type TIM barrel family protein4.0e-14872.14Show/hide
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        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+ VRT+ ++L SML
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AT3G14420.1 Aldolase-type TIM barrel family protein2.5e-12161.17Show/hide
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        E  NV ++  +A+Q LPKM YD+YA GAEDQ TL+EN  AF +I  RPR+L+DVSKIDM+TT+LG++IS PIMVAPTA  K+A+ +GE ATARAA+AA T
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        IM LS  ATSS+EEVAS+   +RFFQLYV+K R++   LV+RAER+G+KAI LT DTPRLGRRE+DIKN+   PP   +KN EGL   +++    S L +
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Query:  HANATLDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVKGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALG
        +    +D +L W+D+ WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PAT+S LEEVV A +GR+PV  DGGVRRGTDVFKALALG
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Query:  AQAVLIGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYD
        A  + IGRPV+F LAA+GE GVR VL+ML++E E+TMALSGC S+K+I+R+ + T++D
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AT3G14420.2 Aldolase-type TIM barrel family protein2.5e-12161.17Show/hide
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        E  NV ++  +A+Q LPKM YD+YA GAEDQ TL+EN  AF +I  RPR+L+DVSKIDM+TT+LG++IS PIMVAPTA  K+A+ +GE ATARAA+AA T
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Query:  IMVLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPP---VKNLEGLVSVEINSDQGSKLEA
        IM LS  ATSS+EEVAS+   +RFFQLYV+K R++   LV+RAER+G+KAI LT DTPRLGRRE+DIKN+   PP   +KN EGL   +++    S L +
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        +    +D +L W+D+ WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PAT+S LEEVV A +GR+PV  DGGVRRGTDVFKALALG
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        A  + IGRPV+F LAA+GE GVR VL+ML++E E+TMALSGC S+K+I+R+ + T++D
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTGAGCCGATGAATGTGAATGACTTCAAAGAATTGGCTAGGCAGGCACTTCCAAAAATGTATTATGATTTCTATGCAGGGGGTGCTGAGGACCAACACACACT
TAGAGAGAACATACAAGCTTTCCATAAAATCACGATCCGACCTAGAGTTCTTGTGGATGTGAGCAAAATTGATATGTCAACAACCATATTGGGCTATCGCATATCTGCAC
CTATCATGGTTGCTCCAACTGCAGCACATAAGCTAGCATACCATGAAGGAGAACTAGCCACGGCCAGGGCAGCAGCTGCTGCAAAAACCATAATGGTTCTATCCTACTCT
GCGACCTCTTCAATAGAGGAAGTTGCCTCTAGCTGTGATGCTGTCCGTTTTTTTCAATTATATGTATTCAAAAGGCGTGATATCACAACTCTGCTAGTAAAGAGAGCTGA
GAGATCTGGATACAAGGCAATAGTCCTGACTGCTGATACTCCTCGGCTTGGAAGAAGGGAGGCTGACATAAAGAACAAAATGATTGCACCTCCAGTGAAGAATCTTGAAG
GCCTCGTATCGGTTGAAATTAACTCTGATCAAGGTTCAAAATTAGAAGCTCATGCCAATGCGACCTTGGATGCATCTCTGCGCTGGGAAGATATAGGATGGTTAAGATCA
ATCACTAGCCTGCCAATTTTGATCAAGGGAATTCTTACTCATGAAGATGCAACTAGAGCTGTGGAAGCAGGTGTTGATGGAATTATTGTCTCCAATCATGGGGCCCGCCA
ACTCGATTTTGCTCCTGCTACTGTTTCTGTTCTTGAAGAGGTAGTTCATGCTGTCAAGGGTAGAGTTCCTGTCCTCTTCGACGGAGGTGTGCGACGAGGAACAGATGTGT
TTAAGGCGTTAGCCCTTGGTGCCCAAGCAGTCCTTATAGGGAGACCAGTTTTGTTTGGGCTAGCAGCAAAGGGAGAAGAGGGAGTAAGAACAGTGCTGGAAATGCTCAAG
AATGAGTTGGAGATCACTATGGCACTTTCTGGTTGCCCGTCCATCAAGGATATTACTAGAAGCCTTGTGAGGACACAGTATGATAAGCTGCAATCAATGCTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGGCAGAGATGATCATAAAGGGCTAATATATATAGCGCAATACGTTTCTTGGACGTCAGATCTCGGCTGCGCGTGCGCTAGGCGGAGACGTTCCGGAGAAATTGTTCCGA
TTTCCGAATGAAATTGCTGAAGAACTGAAGAAGAAAAGAAACCGAAGAAATTCAATTCTCTTACCATTACAATAAAATCCAATTTGTCCATTTAAAATACTGTATTGGTT
GGTAAATTCCTCCGTTAATTTCACAACCCTTTAAATCCTCTAAATCAAATCAGAACCCCAATGCAATAGTCAGGTGTTAAATTAAAGATGGTGAAGCTGACAATGATTGC
CCGTGTTACTGACGGTCTTCCTCTTGCTGAGGGACTAGATGATGGTCGTGATTTGAAAGATGCTGAATATTTCAAGCAGCAAGCCAAAGCTTTGTTTAAGAACTTATCAA
GAGGACAGAATCAACCTTCGAGGATGTCTATTGAAACTGGCTCTTATGTCTTTCATTATATAATTGAGGGGCGTGTTTGCTATTTGACAATGTGCGACCGTGCTTACCCA
AAAAAACTTGCTTTCCAGTATCTTGAAGACCTTAAGAATGAATTTGAACGTGTTAATGGGCCTCAGATTGAAACTGCTGCTAGGCCATATGCATTTATCAAGTTTGATAC
ATTCATGCAGAAAACGAAGAAGCTATATCAGGACACCCGTACCCAGCGTAATATTGCAAAATTAAATGATGAACTCTATGAAGTGCACCAAATAATGACTCGAAATGTTC
AGGAAGTTCTTGGTGTGGGTGAAAAGTTAGATCAGGTTAGTGAAATGTCAAGTCGATTAACATCAGAATCTCGCATTTATGCTGACAAGGCAAAAGACTTGAATCGACAG
GCTTTGATTCGGAAGTGGGCACCTGTAGGTATCGTGCTTGGAGTCGTAATTCTCCTATTCTGGGTGAAAACAAAGATTTGGTAACCCAATTGCCAATTCTAATCTGAAAT
ATTATGAGGCTTCTTCAACGCCGTGGATTGCTGCATGCATTTTTGGCGTAACTCGAGACTATGGAGTCCATGTCTCAACTTTCAAGGTGGGATTGAGTTAGAACACACGT
TTTGTATGCAAAGGGGAAGATGCTCCCTCGTGAACTGTGAGGATTCCCTCCATCTAACAGTTAGATTAGTGAGAACATTTACATCTTCTGTATGATAAGTATTGAACATT
CATAGATCTCTGCCCTTTTTTCCCTTTTCTTGGGAGGGGATGGGCTTTGTTTGACCACATTATTTCTGTTCTATATTTTCTTTAGGATGATATTCCTTTTGTTCTCTTCT
ACTTGAATGACATTGAATAAAGATAGAAGGTACAGAGTCCAACCCCTTTGAAAACCAATAACGTAATCGATCTTATTATGCCACGTTTCTGGAAAGCAATGAAGAAATAG
ATTTGTTGCATAGGACACCAATTGATAATGGGTAATTCTGTTTGATGGCAGGCTCATGTTGGTCTGTTTGAGAAGGAAAATACTTGGTTCCTTGATGGTAATAAGCAATA
TTGTCGTTAATAACTTAGTATCACTAAATGTTTGACAATTAATAAAATGACAATTAAGAGAAGGAAATGCAAAATTAATTTTTTTTTTTAAATAATGAGTTGTGAATTTT
TTTAATAGTGGTGTGGACATGATGTGGTCCTTGTTCGGCTCCTAATGGTAAGAATTAATCTTGTCTCCACCTCTAAGTCCGACATCGTTTTCGTCAATTTAAACACATTT
GAATATTCATCGTATTTTGGCATCGGCCGTCACCATCCGTAATGAAATTATTACAATAAAACAGAGTACTTGGATTGCTAATGGATCAACAAATTAAGTTGATCGATATC
TTCTAAACTTCCACTTCTACTAGAGAACACGCAATCATAGGCCACAGTCCTATATTCGACTTCAACTTCTCTTAAGAGTCTGGATTTTCGTAGAGGTAACCAGCTCAACC
CATTTTCCATTGAAGCCTGCACTTTCCAGTTGGGTCAATATAACAGGAGCGTCAAGCCTCAAGGATAAAATGTCTTCTGAGCCGATGAATGTGAATGACTTCAAAGAATT
GGCTAGGCAGGCACTTCCAAAAATGTATTATGATTTCTATGCAGGGGGTGCTGAGGACCAACACACACTTAGAGAGAACATACAAGCTTTCCATAAAATCACGATCCGAC
CTAGAGTTCTTGTGGATGTGAGCAAAATTGATATGTCAACAACCATATTGGGCTATCGCATATCTGCACCTATCATGGTTGCTCCAACTGCAGCACATAAGCTAGCATAC
CATGAAGGAGAACTAGCCACGGCCAGGGCAGCAGCTGCTGCAAAAACCATAATGGTTCTATCCTACTCTGCGACCTCTTCAATAGAGGAAGTTGCCTCTAGCTGTGATGC
TGTCCGTTTTTTTCAATTATATGTATTCAAAAGGCGTGATATCACAACTCTGCTAGTAAAGAGAGCTGAGAGATCTGGATACAAGGCAATAGTCCTGACTGCTGATACTC
CTCGGCTTGGAAGAAGGGAGGCTGACATAAAGAACAAAATGATTGCACCTCCAGTGAAGAATCTTGAAGGCCTCGTATCGGTTGAAATTAACTCTGATCAAGGTTCAAAA
TTAGAAGCTCATGCCAATGCGACCTTGGATGCATCTCTGCGCTGGGAAGATATAGGATGGTTAAGATCAATCACTAGCCTGCCAATTTTGATCAAGGGAATTCTTACTCA
TGAAGATGCAACTAGAGCTGTGGAAGCAGGTGTTGATGGAATTATTGTCTCCAATCATGGGGCCCGCCAACTCGATTTTGCTCCTGCTACTGTTTCTGTTCTTGAAGAGG
TAGTTCATGCTGTCAAGGGTAGAGTTCCTGTCCTCTTCGACGGAGGTGTGCGACGAGGAACAGATGTGTTTAAGGCGTTAGCCCTTGGTGCCCAAGCAGTCCTTATAGGG
AGACCAGTTTTGTTTGGGCTAGCAGCAAAGGGAGAAGAGGGAGTAAGAACAGTGCTGGAAATGCTCAAGAATGAGTTGGAGATCACTATGGCACTTTCTGGTTGCCCGTC
CATCAAGGATATTACTAGAAGCCTTGTGAGGACACAGTATGATAAGCTGCAATCAATGCTTTAATGTGTTTGCGTTATAATATAAGTAAGCAGCTACCTCCTGTCCTGAT
TTACATAAAGGAGTTCTGCAAGGATGTATCTCCAATTCTTCAGTAATGTTATTCCTAATATTTGGAGACTTCTGATAAATAGCTCTAAAAGTATTTAAACACTTTCCACT
CTATCGATCAGAACCTTAGTGAGGAGGCAAAGAAGGATCTTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSEPMNVNDFKELARQALPKMYYDFYAGGAEDQHTLRENIQAFHKITIRPRVLVDVSKIDMSTTILGYRISAPIMVAPTAAHKLAYHEGELATARAAAAAKTIMVLSYS
ATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSVEINSDQGSKLEAHANATLDASLRWEDIGWLRS
ITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVKGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALGAQAVLIGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLK
NELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML