; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g1207 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g1207
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionribonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationMC08:10391020..10392006
RNA-Seq ExpressionMC08g1207
SyntenyMC08g1207
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0004748 - ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000358 - Ribonucleotide reductase small subunit family
IPR009078 - Ferritin-like superfamily
IPR012348 - Ribonucleotide reductase-like
IPR030475 - Ribonucleotide reductase small subunit, acitve site
IPR033909 - Ribonucleotide reductase small subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581100.1 hypothetical protein SDJN03_21102, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.02e-23395.44Show/hide
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XP_022935447.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucurbita moschata]6.08e-23395.44Show/hide
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XP_022984134.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain [Cucurbita maxima]2.37e-23094.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8R8 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain3.44e-23294.22Show/hide
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A0A1S3BNB8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain3.85e-22993.01Show/hide
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A0A6J1F5K5 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.95e-23395.44Show/hide
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A0A6J1J9K8 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.15e-23094.83Show/hide
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B9RBH6 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain, putative4.12e-22490.58Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B2.2e-15880.78Show/hide
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.5e-17087.23Show/hide
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P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A1.7e-14275Show/hide
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        +EPLL     RF MFPI+Y  +WEMYKKAEASFWTAEEVDLS D++ WE+LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQIA+
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        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK RLF AIET+PC++KKA+W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
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Query:  CDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGDY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V +IV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRLL  LG E+ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVG+Y
Subjt:  CDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGDY

Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

Q4KLN6 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M22.3e-13169.6Show/hide
Query:  PAIPDEPLLAPSPDRFCMFPIQYPQVWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGF
        P+I +EPLL  +P RF +FPI+Y  +W+MYKKAEASFWTAEEVDLS+D++HWE+L PDE+HFI+HVLAFFAASDGIV ENL  RF +EVQV EAR FYGF
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Query:  QIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVAKKAEWALKWI-DSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR
        QIA+ENIHSEMYSLL++TYIKDS E+  LF AIET+PCV KKA+WAL+WI D   ++ ER++AFA VEGIFFSGSF SIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR
Subjt:  QIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVAKKAEWALKWI-DSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISR

Query:  DEGLHCDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEK
        DEGLHCDFACL++  L  K S  RVKEI+  +V IE+EF+ +ALPV L+GMN  LM QYIEFVADRL+  LG+ KI+ V+NPFD+ME ISL+GKTNFFEK
Subjt:  DEGLHCDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEK

Query:  RVGDYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        RVG+YQ+  VMSN   N     F +D DF
Subjt:  RVGDYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C2.8e-16182.83Show/hide
Query:  MPAIPDEPLLAPSPDRFCMFPIQYPQVWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWE-SLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY
        MP++P+EPLL P+PDRFCMFPI YPQ+WEMYKKAEASFWTAEEVDLSQD R WE SL   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+EARAFY
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Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVAKKAEWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E+  LFRAIET+PCVAKKA+WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVAKKAEWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLS +RVK IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRLLGALGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
Subjt:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE

Query:  KRVGDYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVGDYQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGDYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A1.2e-14375Show/hide
Query:  DEPLLAPSPDRFCMFPIQYPQVWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQIAI
        +EPLL     RF MFPI+Y  +WEMYKKAEASFWTAEEVDLS D++ WE+LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQIA+
Subjt:  DEPLLAPSPDRFCMFPIQYPQVWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQIAI

Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVAKKAEWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK RLF AIET+PC++KKA+W L WI S  SFA R++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
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Query:  CDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGDY
        CDFACLLYSLL+K+L  ++V +IV EAV+IE EFVC ALP  L+GMN +LMSQYI+FVADRLL  LG E+ Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVG+Y
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Query:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF
        QKASVMSNL      +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF

AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein2.0e-16282.83Show/hide
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Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVAKKAEWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E+  LFRAIET+PCVAKKA+WA+KWID +++FAERI+AFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
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Query:  RDEGLHCDFACLLYSLLRKKLSGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+LL+ KLS +RVK IV +AV+IEREFVCDALP ALVGMN DLMSQYIEFVADRLLGALGY K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGDYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF
        KRVGDYQKASVMS++NGNG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGDYQKASVMSNLNGNGGI--HEFKMDEDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTGCAATTCCCGACGAGCCTCTCCTCGCCCCCAGCCCCGATCGCTTCTGCATGTTCCCAATTCAGTATCCTCAGGTCTGGGAAATGTACAAGAAGGCCGAAGCTTC
ATTTTGGACCGCCGAGGAAGTCGATCTCTCGCAGGATCTCCGCCACTGGGAATCCCTTACTCCCGACGAGAAGCACTTCATCACGCACGTTCTCGCCTTCTTCGCTGCCT
CCGACGGCATTGTTTTGGAGAATCTTGCCGGACGGTTCATGAAGGAGGTGCAGGTCGCGGAGGCCAGAGCGTTCTATGGATTCCAGATCGCGATTGAGAATATTCACTCC
GAGATGTATAGTCTTCTCCTGGAAACGTATATTAAAGATTCGAATGAGAAGAGCCGGTTGTTTCGCGCGATCGAGACCGTCCCTTGCGTCGCGAAGAAGGCCGAATGGGC
GTTGAAGTGGATCGATAGCACCGAATCGTTCGCCGAGCGGATTCTGGCTTTCGCTTGCGTTGAGGGAATCTTCTTCTCCGGGAGTTTCTGCTCCATTTTCTGGCTGAAAA
AACGTGGATTAATGCCCGGACTCACGTTCTCCAACGAGCTGATTTCGCGAGACGAAGGTCTCCATTGCGATTTCGCCTGTTTGCTGTATTCGCTCTTGAGGAAGAAACTG
AGCGGGGATCGAGTGAAGGAAATTGTTCGGGAGGCGGTGGATATAGAGAGGGAGTTCGTGTGCGATGCATTGCCGGTGGCTCTCGTCGGAATGAACGGCGATCTGATGAG
CCAGTACATAGAATTCGTAGCGGACAGATTGCTGGGAGCCCTAGGGTATGAAAAAATCTATAATGTTCAGAATCCATTCGATTGGATGGAGCTGATTTCATTGCAGGGGA
AGACGAATTTCTTCGAGAAACGAGTTGGGGATTACCAGAAGGCGTCTGTAATGTCGAATTTGAACGGTAATGGCGGCATCCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTGCAATTCCCGACGAGCCTCTCCTCGCCCCCAGCCCCGATCGCTTCTGCATGTTCCCAATTCAGTATCCTCAGGTCTGGGAAATGTACAAGAAGGCCGAAGCTTC
ATTTTGGACCGCCGAGGAAGTCGATCTCTCGCAGGATCTCCGCCACTGGGAATCCCTTACTCCCGACGAGAAGCACTTCATCACGCACGTTCTCGCCTTCTTCGCTGCCT
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AGACGAATTTCTTCGAGAAACGAGTTGGGGATTACCAGAAGGCGTCTGTAATGTCGAATTTGAACGGTAATGGCGGCATCCATGAGTTTAAGATGGATGAAGATTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPAIPDEPLLAPSPDRFCMFPIQYPQVWEMYKKAEASFWTAEEVDLSQDLRHWESLTPDEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQIAIENIHS
EMYSLLLETYIKDSNEKSRLFRAIETVPCVAKKAEWALKWIDSTESFAERILAFACVEGIFFSGSFCSIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLLRKKL
SGDRVKEIVREAVDIEREFVCDALPVALVGMNGDLMSQYIEFVADRLLGALGYEKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGDYQKASVMSNLNGNGGIHEFKMDEDF