; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g1239 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g1239
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionmucin-1
Genome locationMC08:10699033..10699593
RNA-Seq ExpressionMC08g1239
SyntenyMC08g1239
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066977.1 mucin-1 [Cucumis melo var. makuwa]3.72e-3561Show/hide
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        MA Q ++VFALIF AAVAGVFAEAP  SPS +P+PKAS S S   SPSSS PAASPKA SE+ SPS + A+SP S+S+DAP       SP SSP+ SPSP
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        A+DSPADSPA D+P    AD+P AASP++DVSSPPSP +A++P A      ADGP  AADGP +DSPAD+P G   S  +DLK  +A VGGV  AG +AF
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XP_008450043.1 PREDICTED: mucin-1 [Cucumis melo]3.72e-3561Show/hide
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        MA Q ++VFALIF AAVAGVFAEAP  SPS +P+PKAS S S   SPSSS PAASPKA SE+ SPS + A+SP S+S+DAP       SP SSP+ SPSP
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Query:  ASDSPADSPA-DAPT---ADSPDAASPEADVSSPPSPGSAESPAADGPDAAADGPDAAADGPASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGGVAVAGLFAF
        A+DSPADSPA D+P    AD+P AASP++DVSSPPSP +A++P A      ADGP  AADGP +DSPAD+P G   S  +DLK  +A VGGV  AG +AF
Subjt:  ASDSPADSPA-DAPT---ADSPDAASPEADVSSPPSPGSAESPAADGPDAAADGPDAAADGPASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGGVAVAGLFAF

XP_022934589.1 mucin-1-like [Cucurbita moschata]1.53e-2549.58Show/hide
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        + F++VFALIF AAVAG FAEAP ++PS++PAPK++ S   +SSPSSSPA+SP    A++ +D+P+ +PA +P     D PA                  
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Query:  ---------------------GSPDSSPATSPSPASDSPADSPADAPTADSPDAASPEADVSSPPSP--GSAESPAADGPDAAADGPDAA-----ADGPA
                              SPDSSP+ SPSPA+DSPA SPAD+    SP AASP++D SSPPSP   +A+SP ADGP + ADGP  A     ADG  
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Query:  SDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAV-GGVAVAGLFAF
        SDSPAD+P G ADSG S LK  +AAV G VAVAGLFAF
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XP_023529000.1 classical arabinogalactan protein 6-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.68e-2447.45Show/hide
Query:  RQFLVVFALIFAAAVAGVFAEAPASSPSDAPAPKASNSSS---SPSSSPAASPK-----------------------------------AESESDSPSSS
        + F++VFALIF AAVAGVFAEAP +SPS++PAPK++ S S   SPSSSPA+SP                                    A++ +D+P+ +
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Query:  PAASPKSNSTDAPAGS---------------------------PDSSPATSPSPASDSPADSPADAPTADSPDAASPEADVSSPPSP--GSAESPAADGP
        PA +P    +DAPA S                           PDSSP+ SPSPA+DSPA SPAD+    SP AASP++D SSPPSP   +A+SP ADGP
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Query:  DAAADGPDAAADGPASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGG---VAVAGLFAF
         + ADGP + ADGP SDSPAD+P G ADSG S LK  +AAV G   VAVAGLFAF
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XP_031737954.1 classical arabinogalactan protein 11 [Cucumis sativus]1.16e-3160.38Show/hide
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        MA Q ++VFALIF AAVAGVFAEAP  SPS +P+PKAS S S   SPSSS PA SPKA  E+ SPS  PAAS  S+S+DAP       SP SSP+ SPSP
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Query:  ASDSPADSPA-DAPTADSP--------DAASPEADVSSPPSPGSAESPAADGPDAAADGPDAA-----ADGP-ASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAA-A
        A+DSP+DSPA D+P ADSP         AASP++DVSSPPSP +A++P ADGP AAADGP AA     ADGP A+DSPAD+P     SG +DLK  +A  
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Query:  VGGVAVAGLFAF
        VG VA  G FAF
Subjt:  VGGVAVAGLFAF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDP4 Uncharacterized protein5.01e-2558.42Show/hide
Query:  MARQFLVVFALIFAAAVAGVFAEAPASSPSDAPAPKASNSSS---SPSSS-PAASPKAESESDSPSSSPAASPKSNSTDAPAG-----SPDSSPATSPSP
        MA Q ++VFALIF AAVAGVFAEAP  SPS +P+PKAS S S   SPSSS PA SPKA  E+ SPS  PAAS  S+S+DAP       SP SSP+ SPSP
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Query:  ASDSPADSPA-DAPTADSP--------DAASPEADVSSPPSPGSAESPAADGPDAAADGPDAAADGP-ASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGGVAV
        A+DSP+DSPA D+P ADSP         AASP++DVSSPPSP +A++P ADGP AAADGP  AADGP A+D P  A G  A  G +      AA G  A 
Subjt:  ASDSPADSPA-DAPTADSP--------DAASPEADVSSPPSPGSAESPAADGPDAAADGPDAAADGP-ASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGGVAV

Query:  AG
         G
Subjt:  AG

A0A1S3BND1 mucin-11.80e-3561Show/hide
Query:  MARQFLVVFALIFAAAVAGVFAEAPASSPSDAPAPKASNSSS---SPSSS-PAASPKAESESDSPSSSPAASPKSNSTDAPAG-----SPDSSPATSPSP
        MA Q ++VFALIF AAVAGVFAEAP  SPS +P+PKAS S S   SPSSS PAASPKA SE+ SPS + A+SP S+S+DAP       SP SSP+ SPSP
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        A+DSPADSPA D+P    AD+P AASP++DVSSPPSP +A++P A      ADGP  AADGP +DSPAD+P G   S  +DLK  +A VGGV  AG +AF
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A0A5A7VIK3 Mucin-11.80e-3561Show/hide
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        A+DSPADSPA D+P    AD+P AASP++DVSSPPSP +A++P A      ADGP  AADGP +DSPAD+P G   S  +DLK  +A VGGV  AG +AF
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A0A6J1F318 mucin-1-like7.40e-2649.58Show/hide
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        + F++VFALIF AAVAG FAEAP ++PS++PAPK++ S   +SSPSSSPA+SP    A++ +D+P+ +PA +P     D PA                  
Subjt:  RQFLVVFALIFAAAVAGVFAEAPASSPSDAPAPKASNS---SSSPSSSPAASPK---AESESDSPSSSPAASPKSNSTDAPA------------------

Query:  ---------------------GSPDSSPATSPSPASDSPADSPADAPTADSPDAASPEADVSSPPSP--GSAESPAADGPDAAADGPDAA-----ADGPA
                              SPDSSP+ SPSPA+DSPA SPAD+    SP AASP++D SSPPSP   +A+SP ADGP + ADGP  A     ADG  
Subjt:  ---------------------GSPDSSPATSPSPASDSPADSPADAPTADSPDAASPEADVSSPPSP--GSAESPAADGPDAAADGPDAA-----ADGPA

Query:  SDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAV-GGVAVAGLFAF
        SDSPAD+P G ADSG S LK  +AAV G VAVAGLFAF
Subjt:  SDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAV-GGVAVAGLFAF

A0A6J1J779 mucin-1-like1.72e-2145.14Show/hide
Query:  MARQFLVVFALIFAAAVAGVFAEAPASSPSDAPAPKASNS---SSSPSSSPAASPK-------AESESDSPSSSPAASPKSNSTDAPA------------
        MA Q ++VFALIF AAVAG FAEAP +SPS++PAPK++ S   +SSPSSSPA +P        AE+ +D+P+ +PA +P     D PA            
Subjt:  MARQFLVVFALIFAAAVAGVFAEAPASSPSDAPAPKASNS---SSSPSSSPAASPK-------AESESDSPSSSPAASPKSNSTDAPA------------

Query:  -------------------------------------------GSPDSSPATSPSPASDSPADSPADAPTADSPDAASPEADVSSPPSP--GSAESPAAD
                                                    SPDSSP+ SPSP +DSPA SPAD+    SP AASP++D SSPPSP   +A+SP AD
Subjt:  -------------------------------------------GSPDSSPATSPSPASDSPADSPADAPTADSPDAASPEADVSSPPSP--GSAESPAAD

Query:  GPDAAADGPDAAADGPASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGG---VAVAGLFAF
        GP        +  DGP SDSPADAP G ADSG S LK  +AAV G   VAVAGLFAF
Subjt:  GPDAAADGPDAAADGPASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGG---VAVAGLFAF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCGTCAATTTCTTGTTGTTTTTGCTCTGATCTTCGCCGCCGCCGTCGCCGGCGTTTTTGCCGAGGCTCCGGCTAGCTCGCCCTCGGATGCCCCGGCGCCGAAGGC
CTCCAATTCGTCGTCTTCTCCGTCGTCTTCGCCGGCGGCGTCTCCCAAGGCGGAGTCGGAGTCTGACTCTCCGTCGTCTTCTCCGGCGGCGTCTCCCAAGTCCAACTCCA
CCGACGCGCCGGCCGGCTCCCCGGACTCCTCCCCTGCCACTTCTCCGTCGCCTGCGAGCGACTCTCCGGCCGATTCTCCCGCCGATGCCCCCACCGCCGATTCGCCTGAC
GCTGCCTCGCCGGAGGCCGACGTCTCCTCTCCCCCCTCCCCTGGCTCCGCCGAAAGCCCTGCAGCCGATGGCCCTGACGCTGCCGCCGATGGCCCTGATGCCGCCGCCGA
TGGCCCCGCCTCTGATTCTCCGGCTGACGCACCCGGCGGTGCCGCAGATAGCGGCGCTTCTGATCTGAAATTCGCTGCCGCCGCCGTTGGTGGTGTCGCCGTTGCCGGTC
TCTTTGCTTTC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTCGTCAATTTCTTGTTGTTTTTGCTCTGATCTTCGCCGCCGCCGTCGCCGGCGTTTTTGCCGAGGCTCCGGCTAGCTCGCCCTCGGATGCCCCGGCGCCGAAGGC
CTCCAATTCGTCGTCTTCTCCGTCGTCTTCGCCGGCGGCGTCTCCCAAGGCGGAGTCGGAGTCTGACTCTCCGTCGTCTTCTCCGGCGGCGTCTCCCAAGTCCAACTCCA
CCGACGCGCCGGCCGGCTCCCCGGACTCCTCCCCTGCCACTTCTCCGTCGCCTGCGAGCGACTCTCCGGCCGATTCTCCCGCCGATGCCCCCACCGCCGATTCGCCTGAC
GCTGCCTCGCCGGAGGCCGACGTCTCCTCTCCCCCCTCCCCTGGCTCCGCCGAAAGCCCTGCAGCCGATGGCCCTGACGCTGCCGCCGATGGCCCTGATGCCGCCGCCGA
TGGCCCCGCCTCTGATTCTCCGGCTGACGCACCCGGCGGTGCCGCAGATAGCGGCGCTTCTGATCTGAAATTCGCTGCCGCCGCCGTTGGTGGTGTCGCCGTTGCCGGTC
TCTTTGCTTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARQFLVVFALIFAAAVAGVFAEAPASSPSDAPAPKASNSSSSPSSSPAASPKAESESDSPSSSPAASPKSNSTDAPAGSPDSSPATSPSPASDSPADSPADAPTADSPD
AASPEADVSSPPSPGSAESPAADGPDAAADGPDAAADGPASDSPADAPGGAADSGASDLKFAAAAVGGVAVAGLFAF