; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MC08g1277 (gene) of Bitter gourd (Dali-11) v1 genome

Gene IDMC08g1277
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationMC08:11184109..11184636
RNA-Seq ExpressionMC08g1277
SyntenyMC08g1277
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]7.33e-11595.45Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]6.43e-124100Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.02e-11394.89Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein9.80e-11595.45Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.02e-11494.89Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.02e-11494.89Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like3.11e-124100Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like9.36e-11193.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1YKY7 Protein IAL14.7e-3855.8Show/hide
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 21.7e-4052.81Show/hide
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         +L    + L +Y    I A +      +  A  +  T      +T+   HY+   +F       G   P G+ +D G
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Q32SG3 LOB domain-containing protein 67.2e-3955.17Show/hide
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 254.8e-5183.78Show/hide
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        + TNA+L+RYA
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES1.4e-4757.65Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 253.4e-5283.78Show/hide
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        + TNA+L+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.0e-4857.65Show/hide
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.0e-4857.65Show/hide
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        QKELDA NA+L  Y  +   A            P P PS          + +  S   N     +  SYG       F PW+N       GHD+ G
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.0e-4857.65Show/hide
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein1.0e-4857.65Show/hide
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        QKELDA NA+L  Y  +   A            P P PS          + +  S   N     +  SYG       F PW+N       GHD+ G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGCGCAGCCTGCAAGTTCCTCCGGCGAAAATGCCTACCGGACTGCGTTTTTGCCCCGTACTTCCCGCCCGAGGAGCCGCA
GAAGTTTGCCAACGTCCACAAGATCTTCGGCGCCAGCAATGTCAGCAAGCTGCTGAACGAAGTCCAGCCACACCAACGCGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCCTACGAGG
CCGAGGCAAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTAGGCGCCATCTCCATCCTCCAGAGGCAAGTCATCAAGCTCCAGAAAGAACTCGACGCCACCAATGCGAATCTC
ATCCGCTATGCCTGCAATGAAATCCCTGCTCCGTCCCCGTCCCCGTCGTCGTCCTCACAATACGCTCGGAGGTCGTCGTCTACGAACCATGAGGGAAGCTCCTCCACCTC
TAGCTATGGCCACTACTATTCTGGTCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATGGCCCTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGCGCAGCCTGCAAGTTCCTCCGGCGAAAATGCCTACCGGACTGCGTTTTTGCCCCGTACTTCCCGCCCGAGGAGCCGCA
GAAGTTTGCCAACGTCCACAAGATCTTCGGCGCCAGCAATGTCAGCAAGCTGCTGAACGAAGTCCAGCCACACCAACGCGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCCTACGAGG
CCGAGGCAAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTAGGCGCCATCTCCATCCTCCAGAGGCAAGTCATCAAGCTCCAGAAAGAACTCGACGCCACCAATGCGAATCTC
ATCCGCTATGCCTGCAATGAAATCCCTGCTCCGTCCCCGTCCCCGTCGTCGTCCTCACAATACGCTCGGAGGTCGTCGTCTACGAACCATGAGGGAAGCTCCTCCACCTC
TAGCTATGGCCACTACTATTCTGGTCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATGGCCCTTGTGGAGATGGCCATGACAAAGGAGGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQKELDATNANL
IRYACNEIPAPSPSPSSSSQYARRSSSTNHEGSSSTSSYGHYYSGLYFSPWSNNNGPCGDGHDKGG